MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 494

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018501	GCT	2	6	61	66	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018501	TAA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018501	ATT	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018501	TTA	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018501	ATA	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018501	ATT	2	6	403	408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018501	GAT	2	6	442	447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018501	AGG	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018501	TAA	2	6	2961	2966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018501	AGG	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018501	ATA	2	6	5245	5250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018501	ATT	2	6	5670	5675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018501	CTT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018501	CTT	2	6	5869	5874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018501	GAA	2	6	5930	5935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018501	ACC	2	6	5965	5970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018501	TAA	2	6	5991	5996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018501	TTG	2	6	7211	7216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018501	GAG	2	6	7257	7262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018501	TAC	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018501	GTT	2	6	7676	7681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018501	AAC	2	6	7703	7708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018501	GTT	2	6	7721	7726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018501	ATT	2	6	7777	7782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018501	TAC	2	6	7810	7815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018501	AAT	2	6	7817	7822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018501	ATT	2	6	7855	7860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018501	ACC	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_018501	AAT	2	6	7885	7890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018501	ATT	2	6	7958	7963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018501	CTT	2	6	8101	8106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018501	GAA	2	6	8162	8167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018501	TGT	2	6	8178	8183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018501	ATT	2	6	8224	8229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018501	TTA	2	6	8230	8235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018501	ATA	2	6	8659	8664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018501	ATT	2	6	8694	8699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018501	ATT	3	9	11626	11634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018501	CAG	2	6	11645	11650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018501	AAG	2	6	11656	11661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018501	GAA	3	9	11732	11740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018501	CAA	2	6	11810	11815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018501	AGA	2	6	11839	11844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018501	ATA	2	6	11891	11896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018501	ATT	2	6	12006	12011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018501	ATT	2	6	12018	12023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018501	GAA	2	6	12041	12046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018501	CAT	2	6	12107	12112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018501	CGA	2	6	12127	12132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018501	ATG	3	9	12336	12344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018501	GAA	2	6	12395	12400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018501	TTA	2	6	13914	13919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018501	ATT	2	6	13930	13935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018501	TAA	2	6	13936	13941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018501	AAT	3	9	13943	13951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018501	AGG	2	6	13994	13999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018501	AGG	2	6	14227	14232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018501	TCT	2	6	15241	15246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018501	AGG	2	6	16522	16527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018501	GAG	2	6	17780	17785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018501	GAT	2	6	19679	19684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018501	ATT	2	6	20334	20339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018501	AAT	2	6	21346	21351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018501	CAA	2	6	22347	22352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018501	AAT	2	6	22377	22382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018501	AAT	2	6	22462	22467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018501	TAA	2	6	22522	22527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018501	TCC	2	6	22822	22827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018501	AAT	3	9	22829	22837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018501	ATT	2	6	22930	22935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018501	TTA	2	6	22976	22981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018501	TAT	2	6	23009	23014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018501	TAT	2	6	23056	23061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018501	TAG	2	6	23135	23140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018501	ATT	2	6	23164	23169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018501	GCT	2	6	23347	23352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018501	ATT	3	9	23390	23398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018501	GAT	2	6	23399	23404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018501	TTA	2	6	23407	23412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018501	ATA	2	6	23455	23460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018501	TCT	2	6	23509	23514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018501	TTA	2	6	23544	23549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018501	AGA	2	6	23554	23559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018501	AGA	2	6	23597	23602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018501	AGT	2	6	23676	23681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018501	TAA	2	6	23694	23699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018501	TTG	2	6	23749	23754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018501	AAG	2	6	26045	26050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018501	TAA	2	6	26127	26132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018501	AGA	2	6	30575	30580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018501	TAG	2	6	30611	30616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018501	AAG	2	6	30634	30639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018501	TAA	2	6	30661	30666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018501	TTA	2	6	30709	30714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018501	CTT	2	6	31114	31119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018501	GAA	2	6	31175	31180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018501	TGT	2	6	31191	31196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018501	TAA	2	6	31228	31233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018501	GAA	2	6	31871	31876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018501	GGA	2	6	31930	31935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018501	ATG	2	6	33317	33322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018501	AGG	2	6	33336	33341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018501	GAG	2	6	36644	36649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018501	TAA	2	6	37682	37687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018501	TTA	3	9	40261	40269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018501	AGG	2	6	40713	40718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018501	AAT	2	6	41552	41557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018501	AGT	2	6	41683	41688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018501	CTT	2	6	43542	43547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018501	TGG	2	6	45053	45058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018501	GTA	2	6	45123	45128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018501	TAT	2	6	45232	45237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018501	TGG	2	6	45527	45532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018501	GTA	2	6	45597	45602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018501	TTG	2	6	45708	45713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018501	TAT	2	6	45757	45762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018501	TGT	2	6	45830	45835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018501	AAT	2	6	45861	45866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018501	GTT	2	6	45960	45965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018501	GTG	2	6	45996	46001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018501	AGG	2	6	46128	46133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018501	TTA	2	6	48808	48813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018501	TAA	2	6	48838	48843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018501	TTA	2	6	50452	50457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018501	TAG	2	6	51291	51296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018501	AGA	2	6	51373	51378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018501	ACC	2	6	53519	53524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018501	GAA	2	6	53613	53618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018501	AAC	2	6	53752	53757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018501	GTT	2	6	53815	53820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018501	TAA	2	6	53874	53879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018501	ATC	2	6	53969	53974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018501	TAC	2	6	53998	54003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018501	TTA	2	6	54506	54511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018501	GAA	2	6	54965	54970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018501	GAA	2	6	54977	54982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018501	ATA	2	6	55008	55013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018501	TCA	2	6	55017	55022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018501	TAG	2	6	55026	55031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018501	TGG	2	6	55048	55053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018501	TTA	2	6	55085	55090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018501	TAT	2	6	55181	55186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018501	TTA	2	6	55234	55239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.