MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 2676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018500	AAAAAG	2	12	2864	2875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558826
2	NC_018500	ACAATG	2	12	3259	3270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558826
3	NC_018500	GGATCT	2	12	4504	4515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558827
4	NC_018500	AGCGAC	2	12	5312	5323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558828
5	NC_018500	GCAAAA	2	12	5959	5970	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558829
6	NC_018500	TGATCG	2	12	9490	9501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558835
7	NC_018500	AAATTA	2	12	9985	9996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558836
8	NC_018500	GCAATT	2	12	11253	11264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558837
9	NC_018500	TATTTC	2	12	11444	11455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558837
10	NC_018500	ATGAAG	2	12	13608	13619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558839
11	NC_018500	TTGGAA	2	12	16441	16452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558841
12	NC_018500	GATGCA	2	12	23873	23884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558848
13	NC_018500	AAAGAA	2	12	25642	25653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558850
14	NC_018500	ATGTAA	2	12	30988	30999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558855
15	NC_018500	ACGGAA	2	12	31072	31083	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558855
16	NC_018500	TGCAGA	2	12	31436	31447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558855
17	NC_018500	GTAAAG	2	12	35393	35404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558856
18	NC_018500	TGTAGA	2	12	36420	36431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558857
19	NC_018500	AGATGA	2	12	37727	37738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558858
20	NC_018500	AAGAAA	2	12	38775	38786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558861
21	NC_018500	TAAAGG	2	12	39671	39682	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558861
22	NC_018500	TTCCGT	2	12	41842	41853	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402558864
23	NC_018500	AGGAAA	2	12	42715	42726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558865
24	NC_018500	GGTATA	2	12	46021	46032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018500	AAATGA	2	12	47198	47209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558869
26	NC_018500	AAATGA	2	12	50886	50897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558873
27	NC_018500	CTTCAG	2	12	52090	52101	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558874
28	NC_018500	ATTCAA	2	12	55012	55023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558876
29	NC_018500	AATTAA	2	12	55765	55776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558876
30	NC_018500	TAGGTG	2	12	55981	55992	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402558876
31	NC_018500	AAGGCA	2	12	57608	57619	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558879
32	NC_018500	GAATAC	2	12	60066	60077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018500	GGTATT	2	12	62237	62248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558881
34	NC_018500	AAATTA	2	12	62691	62702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558882
35	NC_018500	AAAGGA	2	12	63155	63166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558882
36	NC_018500	TTAGCT	2	12	65811	65822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558884
37	NC_018500	TTCGTC	2	12	66453	66464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402558885
38	NC_018500	AAAAGT	2	12	74577	74588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558893
39	NC_018500	TACGCA	2	12	77615	77626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402558895
40	NC_018500	GGTGCA	2	12	78143	78154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	402558896
41	NC_018500	ATGAAA	2	12	78354	78365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558897
42	NC_018500	AAAGTA	2	12	84003	84014	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558900
43	NC_018500	AAAACA	2	12	86214	86225	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402558903
44	NC_018500	GAATTA	2	12	88370	88381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558904
45	NC_018500	TAGCTG	2	12	93050	93061	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558906
46	NC_018500	ACGGTA	2	12	93100	93111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558906
47	NC_018500	TAGCTG	2	12	93584	93595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558906
48	NC_018500	ACGGTA	2	12	93634	93645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558906
49	NC_018500	TAGCTG	2	12	94118	94129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558906
50	NC_018500	ACGGTA	2	12	94168	94179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558906
51	NC_018500	TCTTTT	2	12	94336	94347	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558906
52	NC_018500	TTTATA	2	12	95021	95032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018500	ATTTAA	2	12	96276	96287	50 %	50 %	0 %	0 %	402558907
54	NC_018500	GCAATT	2	12	100695	100706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558912
55	NC_018500	TTCTTT	2	12	102459	102470	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558913
56	NC_018500	TTAAAA	2	12	104160	104171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558915
57	NC_018500	TACTTA	2	12	109669	109680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018500	TGATTT	2	12	112212	112223	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402558924
59	NC_018500	AATTGT	2	12	113999	114010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558925
60	NC_018500	TTCATA	2	12	115426	115437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558927
61	NC_018500	ATAGAG	2	12	116071	116082	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558929
62	NC_018500	AATAAA	2	12	117480	117491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018500	ATAGAG	2	12	120904	120915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558933
64	NC_018500	GAATAT	2	12	122829	122840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558934
65	NC_018500	TGCTAC	2	12	126750	126761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558936
66	NC_018500	TCTTTT	2	12	126817	126828	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558936
67	NC_018500	ATGTAA	2	12	130245	130256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558938
68	NC_018500	TTTTTA	2	12	132817	132828	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558940
69	NC_018500	TATTTT	2	12	137742	137753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558946
70	NC_018500	ATTGGG	2	12	140794	140805	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402558950
71	NC_018500	TCAAGA	2	12	142165	142176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558951
72	NC_018500	TAATCG	2	12	142533	142544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558951
73	NC_018500	CTTTTG	2	12	142598	142609	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402558951
74	NC_018500	ATCTAA	2	12	142938	142949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558951
75	NC_018500	GCTTAT	2	12	143258	143269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558951
76	NC_018500	ATATAC	2	12	145390	145401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558952
77	NC_018500	AGCAAA	2	12	152986	152997	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558960
78	NC_018500	TTTGGT	2	12	153830	153841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558961
79	NC_018500	CATAAA	2	12	159185	159196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_018500	AGAAAA	2	12	159863	159874	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558968
81	NC_018500	AAATGG	2	12	160061	160072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558968
82	NC_018500	AGTTGT	2	12	161889	161900	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558970
83	NC_018500	ATATTG	2	12	162404	162415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558970
84	NC_018500	GGGGCG	2	12	165547	165558	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	402558974
85	NC_018500	TTATAT	2	12	165921	165932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558974
86	NC_018500	TATTTT	2	12	168934	168945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558977
87	NC_018500	ATTGTA	2	12	169515	169526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558978
88	NC_018500	AAAAGC	2	12	174272	174283	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558984
89	NC_018500	TATTTT	2	12	176998	177009	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558986
90	NC_018500	GAAAAA	2	12	183162	183173	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558993
91	NC_018500	AAATGA	2	12	184543	184554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558994
92	NC_018500	GGTTAT	2	12	184930	184941	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558995
93	NC_018500	AAGAGC	2	12	185399	185410	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558995
94	NC_018500	CTTGAA	2	12	187157	187168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558997
95	NC_018500	ATGCAA	2	12	187239	187250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558997
96	NC_018500	ATCGCT	2	12	189471	189482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402559000
97	NC_018500	CACATA	2	12	191407	191418	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402559002
98	NC_018500	TTACTT	2	12	192860	192871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402559004
99	NC_018500	AAAGGA	2	12	195096	195107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559006
100	NC_018500	AGTATT	2	12	203732	203743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559013
101	NC_018500	ACAGAA	2	12	203769	203780	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402559013
102	NC_018500	AGTAAT	2	12	204450	204461	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402559014
103	NC_018500	TATCCC	2	12	208329	208340	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018500	GGAATT	2	12	211185	211196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559023
105	NC_018500	TAGAAG	2	12	211360	211371	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559023
106	NC_018500	ATTAAT	2	12	211713	211724	50 %	50 %	0 %	0 %	402559024
107	NC_018500	AATTTC	2	12	217054	217065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402559029
108	NC_018500	TCCTAA	2	12	217966	217977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402559030
109	NC_018500	ATAAGA	2	12	221473	221484	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018500	TCGAAT	2	12	230266	230277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402559044
111	NC_018500	ATTTTT	2	12	230721	230732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018500	ATCGGT	2	12	235000	235011	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402559047
113	NC_018500	TTCTAA	2	12	238940	238951	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402559050
114	NC_018500	CTGAAA	2	12	244413	244424	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559059
115	NC_018500	AAATTT	2	12	246515	246526	50 %	50 %	0 %	0 %	402559061
116	NC_018500	AGTTGG	2	12	248686	248697	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402559063
117	NC_018500	AATTGA	2	12	249492	249503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402559064
118	NC_018500	ATGAAG	2	12	250247	250258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559064
119	NC_018500	TAGTTG	2	12	250373	250384	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402559064
120	NC_018500	TAAATG	2	12	251511	251522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402559065
121	NC_018500	TGTTGC	2	12	253355	253366	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402559068
122	NC_018500	TCCTTG	2	12	257893	257904	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402559075
123	NC_018500	GAAGCA	2	12	258949	258960	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402559076
124	NC_018500	TGCAAT	2	12	259551	259562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402559076
125	NC_018500	TTTTTA	2	12	261580	261591	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402559077
126	NC_018500	TCGAAA	2	12	266097	266108	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559083
127	NC_018500	ATGGTG	2	12	267148	267159	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402559084
128	NC_018500	TGGACA	2	12	268834	268845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559087
129	NC_018500	ATTTAG	2	12	269580	269591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559087
130	NC_018500	GGATGA	2	12	271101	271112	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402559089
131	NC_018500	AAAAGA	2	12	273402	273413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402559091
132	NC_018500	AAAAGA	2	12	274752	274763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402559092
133	NC_018500	AAGAAA	2	12	275035	275046	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402559092
134	NC_018500	ATACGA	2	12	277437	277448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559093
135	NC_018500	ATGAAG	2	12	277815	277826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559093
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137	NC_018500	GAAAAT	2	12	281026	281037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402559096
138	NC_018500	ATACAT	2	12	285853	285864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402559102
139	NC_018500	ATAAAT	2	12	291214	291225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018500	CAAAAG	2	12	291394	291405	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_018500	TACATT	2	12	292794	292805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402559107
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143	NC_018500	ATTACA	2	12	297367	297378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402559112
144	NC_018500	TATGCG	2	12	300135	300146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402559113
145	NC_018500	ATGTAT	2	12	300733	300744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559113
146	NC_018500	ATGAAT	2	12	302425	302436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018500	TATTTT	2	12	302690	302701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018500	CATATA	2	12	303029	303040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402559115
149	NC_018500	CTTTTG	2	12	305234	305245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402559116
150	NC_018500	AAGCAT	2	12	306054	306065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559117
151	NC_018500	AAGTGC	2	12	315138	315149	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559125
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155	NC_018500	GGAGTT	2	12	321583	321594	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402559134
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159	NC_018500	AATTGG	2	12	327714	327725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559140
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161	NC_018500	CGAATG	2	12	330025	330036	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559142
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170	NC_018500	AATGAG	2	12	344014	344025	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018500	GGTTTC	2	12	345670	345681	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402559153
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175	NC_018500	GTATGG	2	12	348652	348663	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018500	TCAAAC	2	12	358991	359002	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_018500	ATTTAG	2	12	359980	359991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559168
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182	NC_018500	TCTTAT	2	12	382331	382342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402559183
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184	NC_018500	TTGCAG	2	12	382685	382696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402559183
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193	NC_018500	AATTGC	2	12	396489	396500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402559192
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199	NC_018500	TTAAAA	2	12	411653	411664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_018500	TGAAAT	2	12	414059	414070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402559203
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215	NC_018500	TTATAA	2	12	442440	442451	50 %	50 %	0 %	0 %	402559231
216	NC_018500	TTCATC	2	12	449229	449240	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402559237
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218	NC_018500	ATGCGA	2	12	452607	452618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559241
219	NC_018500	ATTATA	2	12	453054	453065	50 %	50 %	0 %	0 %	402559241
220	NC_018500	AAATTA	2	12	456373	456384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_018500	TGCTGA	2	12	456679	456690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402559244
222	NC_018500	AAATGG	2	12	457061	457072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559244
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224	NC_018500	ATTCCG	2	12	458681	458692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402559245
225	NC_018500	TGTAAA	2	12	459332	459343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
226	NC_018500	ACCAGC	2	12	465418	465429	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	402559251
227	NC_018500	GTACGC	2	12	465445	465456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	402559251
228	NC_018500	ACAAAA	2	12	471792	471803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402559258
229	NC_018500	AAAGCA	2	12	472569	472580	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402559260
230	NC_018500	TTTATC	2	12	480667	480678	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402559270
231	NC_018500	TGAATT	2	12	482157	482168	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559271
232	NC_018500	GTATAT	2	12	482791	482802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559271
233	NC_018500	ACTTTT	2	12	483500	483511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402559272
234	NC_018500	ATAACG	2	12	486080	486091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559275
235	NC_018500	AAAGCG	2	12	487064	487075	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402559277
236	NC_018500	ATTGAA	2	12	489013	489024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402559279
237	NC_018500	AAAATT	2	12	489289	489300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_018500	ATATTT	2	12	489418	489429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_018500	TATGTA	2	12	494077	494088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
240	NC_018500	TTGCAA	2	12	494461	494472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402559287
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346	NC_018500	TGGTAT	2	12	751554	751565	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402559534
347	NC_018500	ATGCTC	2	12	752478	752489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402559535
348	NC_018500	TTTATT	2	12	757470	757481	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402559539
349	NC_018500	GAGCAA	2	12	759036	759047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
350	NC_018500	ATAACT	2	12	759204	759215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402559541
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352	NC_018500	ATTTTT	3	18	763353	763370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
353	NC_018500	ATTACA	2	12	765620	765631	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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467	NC_018500	AGATTT	2	12	1040357	1040368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559847
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