MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018500	GGTATA	2	12	46021	46032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018500	GAATAC	2	12	60066	60077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018500	TTTATA	2	12	95021	95032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018500	TACTTA	2	12	109669	109680	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018500	AATAAA	2	12	117480	117491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018500	CATAAA	2	12	159185	159196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018500	TATCCC	2	12	208329	208340	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018500	ATAAGA	2	12	221473	221484	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018500	ATTTTT	2	12	230721	230732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018500	ATAAAT	2	12	291214	291225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018500	CAAAAG	2	12	291394	291405	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018500	ATGAAT	2	12	302425	302436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018500	TATTTT	2	12	302690	302701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018500	AATTGA	2	12	343986	343997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018500	AATGAG	2	12	344014	344025	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018500	GTATGG	2	12	348652	348663	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018500	TCAAAC	2	12	358991	359002	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018500	TTTATA	2	12	381916	381927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018500	AAAGAA	2	12	395161	395172	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018500	TTAAAA	2	12	411653	411664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018500	TTAAAA	2	12	438325	438336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018500	AAATTA	2	12	456373	456384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018500	TGTAAA	2	12	459332	459343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018500	AAAATT	2	12	489289	489300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018500	ATATTT	2	12	489418	489429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018500	TATGTA	2	12	494077	494088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018500	ATAGGG	2	12	518606	518617	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018500	ATTTGT	2	12	521939	521950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018500	TGAAAA	2	12	523594	523605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018500	ATAATC	2	12	527903	527914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018500	TGATAA	2	12	531456	531467	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018500	ATTTTG	2	12	551977	551988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018500	CAAAAA	2	12	635624	635635	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018500	TTTTTC	2	12	656243	656254	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018500	ATTTTT	2	12	677604	677615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018500	ATTTTT	2	12	678136	678147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018500	AGAAGG	2	12	686802	686813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018500	TTTAAA	2	12	689244	689255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018500	TTTGCA	2	12	690189	690200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018500	AAAGAG	2	12	713528	713539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018500	GAAAGA	2	12	718258	718269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018500	AAAATA	2	12	733492	733503	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018500	ATATTG	2	12	742235	742246	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018500	GAGCAA	2	12	759036	759047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018500	ATTTTT	3	18	763353	763370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018500	ATTACA	2	12	765620	765631	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018500	ATAAAT	2	12	780412	780423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018500	TGTATA	2	12	786046	786057	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018500	AAATGA	2	12	807269	807280	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018500	ATTTTT	2	12	826832	826843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018500	TAGAAA	2	12	828012	828023	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018500	TTTTTA	2	12	834268	834279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018500	AAATTT	2	12	857588	857599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018500	GGTAAG	2	12	864949	864960	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018500	ATTTAA	2	12	870662	870673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018500	GTTATA	2	12	871971	871982	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018500	ATAAAA	2	12	872086	872097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018500	ATTAAT	2	12	887721	887732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018500	ATTGAA	2	12	900221	900232	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018500	AGAATA	2	12	906449	906460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018500	TTTATG	2	12	906578	906589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018500	TTTGCA	2	12	927677	927688	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018500	AGCGAA	2	12	932170	932181	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018500	TTTTAC	2	12	965110	965121	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018500	AGAGTC	2	12	981488	981499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018500	TATTTT	2	12	1000755	1000766	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018500	GATGAA	2	12	1001729	1001740	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018500	TTACAT	2	12	1009139	1009150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018500	TTTTTA	2	12	1045942	1045953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018500	TTTATT	2	12	1149383	1149394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018500	CTGTTT	2	12	1151044	1151055	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018500	GATAAA	2	12	1176047	1176058	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018500	TTATAT	2	12	1197786	1197797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018500	AAATTT	2	12	1200690	1200701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018500	AAGAAA	2	12	1201598	1201609	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018500	CAAAAA	2	12	1201615	1201626	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018500	GGGTTA	2	12	1201932	1201943	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018500	TTATTT	2	12	1210297	1210308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018500	TAAAAA	2	12	1217273	1217284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018500	AGTTTG	2	12	1217518	1217529	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018500	TAAAAA	2	12	1235507	1235518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018500	AAATAT	2	12	1239425	1239436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018500	TAAAAA	2	12	1244454	1244465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018500	GAATAC	2	12	1247522	1247533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018500	TTTCTA	2	12	1255731	1255742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018500	TTTTTA	2	12	1261458	1261469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018500	CTTTTC	2	12	1264186	1264197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018500	TATTTT	2	12	1271167	1271178	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018500	GAAATT	2	12	1307969	1307980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018500	GTAATC	2	12	1327190	1327201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018500	TTATAA	2	12	1327520	1327531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018500	TTATAT	2	12	1337179	1337190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018500	AATATA	2	12	1341019	1341030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018500	TATTAC	2	12	1346893	1346904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018500	AAAAGA	2	12	1359159	1359170	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018500	AATTTT	2	12	1359225	1359236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018500	AAAATA	2	12	1411176	1411187	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018500	TAATTT	2	12	1425336	1425347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018500	TCCATT	2	12	1430303	1430314	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018500	AGTATT	2	12	1434596	1434607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018500	GAGTTC	2	12	1439773	1439784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018500	TAAAAA	2	12	1447788	1447799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018500	TACATG	2	12	1451489	1451500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018500	TAAGTA	2	12	1451876	1451887	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018500	TTTCAT	2	12	1456026	1456037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018500	TTAAAT	2	12	1458633	1458644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018500	TACATC	2	12	1458982	1458993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018500	TAGTAT	2	12	1474468	1474479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018500	TGCATC	2	12	1479219	1479230	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018500	AAAGGA	2	12	1533971	1533982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018500	TTTCCT	2	12	1534898	1534909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018500	CATACA	2	12	1539298	1539309	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018500	TTTACT	2	12	1562652	1562663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018500	TTTTTA	2	12	1574301	1574312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018500	TTTCTT	2	12	1578691	1578702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018500	TTTATA	2	12	1578756	1578767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018500	AGTAAA	2	12	1584519	1584530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018500	TCTTTG	2	12	1586321	1586332	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018500	TTATAA	2	12	1610616	1610627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018500	CCTCAT	2	12	1615865	1615876	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018500	TACATA	2	12	1634146	1634157	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018500	TAAGAA	2	12	1639851	1639862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018500	TAAAAA	2	12	1641168	1641179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018500	ATAATT	2	12	1660728	1660739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018500	AAGCAC	2	12	1688443	1688454	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018500	AAGTTT	2	12	1691205	1691216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018500	AATATC	2	12	1707259	1707270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018500	TATTTT	2	12	1714523	1714534	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018500	ATATAA	2	12	1718925	1718936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_018500	ACTTTT	2	12	5433652	5433663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
380	NC_018500	GCTATA	2	12	5442832	5442843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
381	NC_018500	TAAAAA	2	12	5450571	5450582	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_018500	TAAAAA	2	12	5461975	5461986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_018500	AAAATA	2	12	5502391	5502402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_018500	ATATTA	2	12	5514405	5514416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
385	NC_018500	AGTAGA	2	12	5538436	5538447	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
386	NC_018500	ATAGAT	2	12	5538663	5538674	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
387	NC_018500	TATTTT	2	12	5555188	5555199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.