MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 2273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018500	AAAAAG	2	12	2864	2875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558826
2	NC_018500	ACAATG	2	12	3259	3270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558826
3	NC_018500	GGATCT	2	12	4504	4515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558827
4	NC_018500	AGCGAC	2	12	5312	5323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558828
5	NC_018500	GCAAAA	2	12	5959	5970	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558829
6	NC_018500	TGATCG	2	12	9490	9501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558835
7	NC_018500	AAATTA	2	12	9985	9996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558836
8	NC_018500	GCAATT	2	12	11253	11264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558837
9	NC_018500	TATTTC	2	12	11444	11455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558837
10	NC_018500	ATGAAG	2	12	13608	13619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558839
11	NC_018500	TTGGAA	2	12	16441	16452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558841
12	NC_018500	GATGCA	2	12	23873	23884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558848
13	NC_018500	AAAGAA	2	12	25642	25653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558850
14	NC_018500	ATGTAA	2	12	30988	30999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558855
15	NC_018500	ACGGAA	2	12	31072	31083	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558855
16	NC_018500	TGCAGA	2	12	31436	31447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558855
17	NC_018500	GTAAAG	2	12	35393	35404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558856
18	NC_018500	TGTAGA	2	12	36420	36431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558857
19	NC_018500	AGATGA	2	12	37727	37738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558858
20	NC_018500	AAGAAA	2	12	38775	38786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558861
21	NC_018500	TAAAGG	2	12	39671	39682	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558861
22	NC_018500	TTCCGT	2	12	41842	41853	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402558864
23	NC_018500	AGGAAA	2	12	42715	42726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558865
24	NC_018500	AAATGA	2	12	47198	47209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558869
25	NC_018500	AAATGA	2	12	50886	50897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558873
26	NC_018500	CTTCAG	2	12	52090	52101	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558874
27	NC_018500	ATTCAA	2	12	55012	55023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558876
28	NC_018500	AATTAA	2	12	55765	55776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558876
29	NC_018500	TAGGTG	2	12	55981	55992	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402558876
30	NC_018500	AAGGCA	2	12	57608	57619	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558879
31	NC_018500	GGTATT	2	12	62237	62248	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558881
32	NC_018500	AAATTA	2	12	62691	62702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558882
33	NC_018500	AAAGGA	2	12	63155	63166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558882
34	NC_018500	TTAGCT	2	12	65811	65822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558884
35	NC_018500	TTCGTC	2	12	66453	66464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402558885
36	NC_018500	AAAAGT	2	12	74577	74588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558893
37	NC_018500	TACGCA	2	12	77615	77626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402558895
38	NC_018500	GGTGCA	2	12	78143	78154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	402558896
39	NC_018500	ATGAAA	2	12	78354	78365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558897
40	NC_018500	AAAGTA	2	12	84003	84014	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558900
41	NC_018500	AAAACA	2	12	86214	86225	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402558903
42	NC_018500	GAATTA	2	12	88370	88381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558904
43	NC_018500	TAGCTG	2	12	93050	93061	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558906
44	NC_018500	ACGGTA	2	12	93100	93111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558906
45	NC_018500	TAGCTG	2	12	93584	93595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558906
46	NC_018500	ACGGTA	2	12	93634	93645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558906
47	NC_018500	TAGCTG	2	12	94118	94129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558906
48	NC_018500	ACGGTA	2	12	94168	94179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558906
49	NC_018500	TCTTTT	2	12	94336	94347	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558906
50	NC_018500	ATTTAA	2	12	96276	96287	50 %	50 %	0 %	0 %	402558907
51	NC_018500	GCAATT	2	12	100695	100706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558912
52	NC_018500	TTCTTT	2	12	102459	102470	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558913
53	NC_018500	TTAAAA	2	12	104160	104171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558915
54	NC_018500	TGATTT	2	12	112212	112223	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402558924
55	NC_018500	AATTGT	2	12	113999	114010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558925
56	NC_018500	TTCATA	2	12	115426	115437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558927
57	NC_018500	ATAGAG	2	12	116071	116082	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558929
58	NC_018500	ATAGAG	2	12	120904	120915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558933
59	NC_018500	GAATAT	2	12	122829	122840	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558934
60	NC_018500	TGCTAC	2	12	126750	126761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558936
61	NC_018500	TCTTTT	2	12	126817	126828	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558936
62	NC_018500	ATGTAA	2	12	130245	130256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558938
63	NC_018500	TTTTTA	2	12	132817	132828	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558940
64	NC_018500	TATTTT	2	12	137742	137753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558946
65	NC_018500	ATTGGG	2	12	140794	140805	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402558950
66	NC_018500	TCAAGA	2	12	142165	142176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558951
67	NC_018500	TAATCG	2	12	142533	142544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558951
68	NC_018500	CTTTTG	2	12	142598	142609	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402558951
69	NC_018500	ATCTAA	2	12	142938	142949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558951
70	NC_018500	GCTTAT	2	12	143258	143269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558951
71	NC_018500	ATATAC	2	12	145390	145401	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558952
72	NC_018500	AGCAAA	2	12	152986	152997	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558960
73	NC_018500	TTTGGT	2	12	153830	153841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558961
74	NC_018500	AGAAAA	2	12	159863	159874	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558968
75	NC_018500	AAATGG	2	12	160061	160072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558968
76	NC_018500	AGTTGT	2	12	161889	161900	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558970
77	NC_018500	ATATTG	2	12	162404	162415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558970
78	NC_018500	GGGGCG	2	12	165547	165558	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	402558974
79	NC_018500	TTATAT	2	12	165921	165932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558974
80	NC_018500	TATTTT	2	12	168934	168945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558977
81	NC_018500	ATTGTA	2	12	169515	169526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558978
82	NC_018500	AAAAGC	2	12	174272	174283	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558984
83	NC_018500	TATTTT	2	12	176998	177009	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558986
84	NC_018500	GAAAAA	2	12	183162	183173	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558993
85	NC_018500	AAATGA	2	12	184543	184554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558994
86	NC_018500	GGTTAT	2	12	184930	184941	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558995
87	NC_018500	AAGAGC	2	12	185399	185410	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558995
88	NC_018500	CTTGAA	2	12	187157	187168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558997
89	NC_018500	ATGCAA	2	12	187239	187250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558997
90	NC_018500	ATCGCT	2	12	189471	189482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402559000
91	NC_018500	CACATA	2	12	191407	191418	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402559002
92	NC_018500	TTACTT	2	12	192860	192871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402559004
93	NC_018500	AAAGGA	2	12	195096	195107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559006
94	NC_018500	AGTATT	2	12	203732	203743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559013
95	NC_018500	ACAGAA	2	12	203769	203780	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402559013
96	NC_018500	AGTAAT	2	12	204450	204461	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402559014
97	NC_018500	GGAATT	2	12	211185	211196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559023
98	NC_018500	TAGAAG	2	12	211360	211371	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559023
99	NC_018500	ATTAAT	2	12	211713	211724	50 %	50 %	0 %	0 %	402559024
100	NC_018500	AATTTC	2	12	217054	217065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402559029
101	NC_018500	TCCTAA	2	12	217966	217977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402559030
102	NC_018500	TCGAAT	2	12	230266	230277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402559044
103	NC_018500	ATCGGT	2	12	235000	235011	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402559047
104	NC_018500	TTCTAA	2	12	238940	238951	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402559050
105	NC_018500	CTGAAA	2	12	244413	244424	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559059
106	NC_018500	AAATTT	2	12	246515	246526	50 %	50 %	0 %	0 %	402559061
107	NC_018500	AGTTGG	2	12	248686	248697	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402559063
108	NC_018500	AATTGA	2	12	249492	249503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402559064
109	NC_018500	ATGAAG	2	12	250247	250258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559064
110	NC_018500	TAGTTG	2	12	250373	250384	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402559064
111	NC_018500	TAAATG	2	12	251511	251522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402559065
112	NC_018500	TGTTGC	2	12	253355	253366	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402559068
113	NC_018500	TCCTTG	2	12	257893	257904	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402559075
114	NC_018500	GAAGCA	2	12	258949	258960	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402559076
115	NC_018500	TGCAAT	2	12	259551	259562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402559076
116	NC_018500	TTTTTA	2	12	261580	261591	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402559077
117	NC_018500	TCGAAA	2	12	266097	266108	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559083
118	NC_018500	ATGGTG	2	12	267148	267159	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402559084
119	NC_018500	TGGACA	2	12	268834	268845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559087
120	NC_018500	ATTTAG	2	12	269580	269591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559087
121	NC_018500	GGATGA	2	12	271101	271112	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402559089
122	NC_018500	AAAAGA	2	12	273402	273413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402559091
123	NC_018500	AAAAGA	2	12	274752	274763	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402559092
124	NC_018500	AAGAAA	2	12	275035	275046	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402559092
125	NC_018500	ATACGA	2	12	277437	277448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559093
126	NC_018500	ATGAAG	2	12	277815	277826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559093
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129	NC_018500	ATACAT	2	12	285853	285864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402559102
130	NC_018500	TACATT	2	12	292794	292805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402559107
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132	NC_018500	ATTACA	2	12	297367	297378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402559112
133	NC_018500	TATGCG	2	12	300135	300146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402559113
134	NC_018500	ATGTAT	2	12	300733	300744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559113
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136	NC_018500	CTTTTG	2	12	305234	305245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402559116
137	NC_018500	AAGCAT	2	12	306054	306065	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402559117
138	NC_018500	AAGTGC	2	12	315138	315149	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559125
139	NC_018500	AGCTGA	2	12	319623	319634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559131
140	NC_018500	TAATCA	2	12	320684	320695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402559133
141	NC_018500	GTATTT	2	12	321174	321185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402559133
142	NC_018500	GGAGTT	2	12	321583	321594	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402559134
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145	NC_018500	AAACAA	2	12	323299	323310	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402559135
146	NC_018500	AATTGG	2	12	327714	327725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559140
147	NC_018500	TGATAT	2	12	328601	328612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559141
148	NC_018500	CGAATG	2	12	330025	330036	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559142
149	NC_018500	TACACA	2	12	331270	331281	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402559143
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152	NC_018500	TACAGG	2	12	335201	335212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559146
153	NC_018500	TTGGAG	2	12	339694	339705	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402559146
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224	NC_018500	AATGGC	2	12	538197	538208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402559332
225	NC_018500	AGCGAC	2	12	538629	538640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402559332
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228	NC_018500	TTACAG	2	12	548689	548700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402559341
229	NC_018500	TTATGA	2	12	548815	548826	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402559341
230	NC_018500	GAACAA	2	12	549783	549794	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402559341
231	NC_018500	GAAATG	2	12	550147	550158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559342
232	NC_018500	TGTAGC	2	12	552569	552580	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402559345
233	NC_018500	GAAGTG	2	12	553761	553772	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402559346
234	NC_018500	GAGTAA	2	12	553978	553989	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559346
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461	NC_018500	AATTCA	2	12	1235044	1235055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402560066
462	NC_018500	TGGTTT	2	12	1235916	1235927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402560067
463	NC_018500	GATAAA	2	12	1252179	1252190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402560084
464	NC_018500	TCTTTT	2	12	1253212	1253223	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402560085
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483	NC_018500	GCTGAA	2	12	1313416	1313427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402560146
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489	NC_018500	ACTTTC	2	12	1331217	1331228	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402560162
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