MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 1247

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018500	TCTTT	2	10	10835	10844	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018500	AATGT	2	10	11775	11784	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018500	CATGT	2	10	36076	36085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018500	TATGT	2	10	43291	43300	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018500	TACAT	2	10	48813	48822	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018500	TACGC	2	10	53880	53889	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018500	TAATT	2	10	54424	54433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018500	TCATA	2	10	54440	54449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018500	TATAA	2	10	57400	57409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018500	ATATA	2	10	70056	70065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018500	ATTGA	2	10	73802	73811	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018500	ATAAA	2	10	76979	76988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018500	TTTAC	2	10	85213	85222	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018500	CGAAA	2	10	90205	90214	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018500	TTTAG	2	10	92523	92532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018500	TAAAT	2	10	95564	95573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018500	GTTAA	2	10	98972	98981	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018500	TTCAC	2	10	105333	105342	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018500	TAATT	2	10	105433	105442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018500	TTTAT	2	10	105570	105579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018500	ATTAA	2	10	109646	109655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018500	ATCAA	2	10	111140	111149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018500	AAAAT	2	10	111170	111179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018500	CTTTT	2	10	113055	113064	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_018500	TATAA	2	10	114558	114567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018500	AAATT	2	10	117101	117110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018500	AATGA	2	10	117421	117430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018500	ATTTT	2	10	117452	117461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018500	ATAAA	2	10	127364	127373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018500	GTGTA	2	10	127397	127406	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018500	TTATA	2	10	129528	129537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018500	ATATA	2	10	130734	130743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018500	TTTAT	2	10	138072	138081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018500	TGAAA	2	10	138170	138179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018500	TTTTA	2	10	144782	144791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018500	GAAAT	2	10	157879	157888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018500	TGTCT	2	10	169947	169956	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018500	TGAAA	2	10	170643	170652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018500	AGAAA	2	10	171882	171891	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018500	TTATA	2	10	181307	181316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018500	AGAAA	2	10	182730	182739	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018500	AACAT	2	10	186147	186156	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018500	TGAAA	2	10	188142	188151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018500	ATCTT	2	10	188276	188285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018500	GTGAA	2	10	193720	193729	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018500	TAAAA	2	10	197280	197289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018500	CTATT	2	10	208369	208378	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018500	TATTT	2	10	212905	212914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018500	TGTTA	2	10	218906	218915	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018500	AATTT	2	10	229987	229996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018500	ATAAA	2	10	230035	230044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018500	ATTTT	2	10	231024	231033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018500	TATAT	2	10	255953	255962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018500	ACTTT	2	10	258046	258055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018500	CTTTT	2	10	263887	263896	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018500	ATGAT	2	10	263915	263924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018500	TATTT	2	10	266788	266797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018500	AGATA	2	10	273753	273762	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018500	TAAAT	2	10	283782	283791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018500	TAAAA	2	10	290206	290215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018500	AATTG	2	10	291551	291560	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018500	AACAT	2	10	291982	291991	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018500	TAAAA	2	10	296306	296315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018500	CATTC	2	10	307724	307733	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_018500	TTATA	2	10	321360	321369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018500	ATGTA	2	10	326572	326581	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018500	TATAG	2	10	334053	334062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018500	AAATG	2	10	334078	334087	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018500	TGAAA	2	10	342277	342286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018500	GTATT	2	10	343089	343098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018500	TGATA	2	10	345441	345450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018500	TTAAC	2	10	348614	348623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018500	TATTT	2	10	355615	355624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018500	AATGG	2	10	356669	356678	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018500	TTTCA	2	10	358286	358295	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018500	AGCGG	2	10	358845	358854	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018500	AAAAG	2	10	359031	359040	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018500	TTAAT	2	10	368513	368522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018500	ATTGA	2	10	368547	368556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018500	TTATT	2	10	374962	374971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018500	TTTTA	2	10	376641	376650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018500	AAATT	2	10	377412	377421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018500	CCTCA	2	10	378165	378174	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_018500	ATTTT	2	10	378255	378264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018500	AATTG	2	10	386840	386849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018500	TGAAA	2	10	389487	389496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018500	GAAAA	2	10	390449	390458	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018500	ATATT	2	10	390721	390730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018500	ATTTG	2	10	393185	393194	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018500	TTAGA	2	10	393260	393269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018500	ATATT	2	10	393443	393452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018500	GAAAA	2	10	393593	393602	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018500	TCAAT	2	10	393780	393789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018500	ATTTC	2	10	395897	395906	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018500	TTTTC	2	10	399640	399649	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018500	AAGAA	2	10	399746	399755	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018500	GTTTT	2	10	399870	399879	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018500	GGGTA	2	10	400194	400203	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018500	AGAGG	2	10	405432	405441	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018500	TTTAT	2	10	405738	405747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018500	AGGGG	2	10	405790	405799	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018500	TTTAG	2	10	413075	413084	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018500	GAAAT	2	10	415654	415663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018500	TTTGA	2	10	418600	418609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018500	TTAAA	2	10	432923	432932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018500	TACAA	2	10	433442	433451	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018500	AAATT	2	10	434283	434292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018500	TAAAA	2	10	442651	442660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018500	TATAA	2	10	444211	444220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018500	AATAA	2	10	445892	445901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018500	TTTAT	2	10	450595	450604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018500	TATAA	2	10	459095	459104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018500	ATACA	2	10	463862	463871	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018500	ACTAA	2	10	466770	466779	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018500	TAAAA	2	10	469702	469711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018500	ATGAA	2	10	469743	469752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018500	CATAT	2	10	475369	475378	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018500	TGGAC	2	10	481236	481245	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_018500	ATTTG	2	10	483161	483170	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018500	TTAAA	2	10	484452	484461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018500	TAAAA	2	10	491828	491837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018500	ATCAC	2	10	492092	492101	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_018500	ATTTG	2	10	493676	493685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018500	AATAA	2	10	494142	494151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018500	AATAT	2	10	500292	500301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018500	ATTCG	2	10	500668	500677	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018500	AACTT	2	10	501096	501105	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018500	TTTAT	2	10	511105	511114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018500	TAGAA	2	10	511152	511161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018500	TAAAA	2	10	512698	512707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018500	ATCAC	2	10	516990	516999	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_018500	TGCTT	2	10	520050	520059	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018500	TCTAT	2	10	532148	532157	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_018500	AAAGC	2	10	544675	544684	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018500	GCTTT	2	10	544691	544700	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018500	TAATT	2	10	544907	544916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018500	TATTG	2	10	547694	547703	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018500	ATATA	2	10	562187	562196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018500	AAAAG	2	10	569540	569549	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018500	AAAAT	2	10	569958	569967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018500	AAGGA	2	10	576910	576919	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018500	ATTTT	2	10	580166	580175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018500	CTTTT	2	10	582824	582833	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018500	TTCAA	2	10	582837	582846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018500	TATAA	2	10	587128	587137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018500	CACAA	2	10	604550	604559	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_018500	ATTTT	2	10	604682	604691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018500	AAACA	2	10	615582	615591	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018500	TAATG	2	10	615912	615921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018500	TTACG	2	10	620563	620572	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_018500	AATTC	2	10	625742	625751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_018500	TTTTG	2	10	663678	663687	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_018500	TCTAG	3	15	707060	707074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_018500	GTGCT	2	10	729370	729379	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_018500	TGATA	2	10	1237179	1237188	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018500	CTTTA	2	10	1239399	1239408	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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432	NC_018500	TTTAT	2	10	1656793	1656802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_018500	TCAAC	2	10	1657643	1657652	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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441	NC_018500	ATTTT	2	10	1677922	1677931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_018500	ATATA	2	10	1734559	1734568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018500	ATTTT	2	10	1737398	1737407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_018500	TATTT	2	10	1748141	1748150	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_018500	TTTTC	2	10	1749891	1749900	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
454	NC_018500	ATAAA	2	10	1772640	1772649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_018500	GTACT	2	10	1773728	1773737	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
456	NC_018500	CGTTT	2	10	1773771	1773780	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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467	NC_018500	TTTTC	2	10	1841847	1841856	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
468	NC_018500	TTTTA	2	10	1847641	1847650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_018500	TCTTT	2	10	1895522	1895531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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