MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 3808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018500	CTTT	2	8	275	282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018500	TTGT	2	8	283	290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018500	AAGG	2	8	297	304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018500	AACT	2	8	5037	5044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018500	AAAT	2	8	6854	6861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018500	ATTC	2	8	14947	14954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018500	TTGA	2	8	14955	14962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018500	TGAT	2	8	22324	22331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018500	AAAG	2	8	22443	22450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018500	TCTT	2	8	31619	31626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018500	TCTT	2	8	31661	31668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018500	TAGG	2	8	36016	36023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018500	AGGA	2	8	36333	36340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018500	TAAT	2	8	43363	43370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018500	CTTA	2	8	43719	43726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018500	TTTA	2	8	47059	47066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018500	CTTT	2	8	54311	54318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018500	TTTC	2	8	54324	54331	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018500	TTTA	2	8	57454	57461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018500	AAAG	2	8	60033	60040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018500	TGTA	2	8	62435	62442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018500	AGAA	2	8	66160	66167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018500	TATC	2	8	74945	74952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018500	AAAG	2	8	75102	75109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018500	GATA	2	8	75143	75150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018500	AAAC	2	8	77012	77019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018500	AATT	2	8	79313	79320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018500	AATG	2	8	79480	79487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018500	ATGA	2	8	82412	82419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018500	GATT	2	8	82423	82430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018500	TGAA	2	8	85234	85241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018500	ATTA	2	8	90014	90021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018500	ATTA	2	8	90034	90041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018500	ATTT	2	8	90068	90075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018500	GAAA	2	8	90186	90193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018500	AGAT	2	8	92113	92120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018500	CATA	2	8	92428	92435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018500	AGGG	2	8	92446	92453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018500	TTAA	2	8	92557	92564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018500	ATCT	2	8	92736	92743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018500	TATG	2	8	95088	95095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018500	AATT	2	8	95154	95161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018500	TAAT	2	8	95213	95220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018500	AACT	2	8	95277	95284	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018500	TTTA	2	8	95449	95456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018500	TAAA	2	8	97772	97779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018500	TGAT	2	8	97898	97905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018500	TTAA	2	8	98322	98329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018500	ATAA	4	16	98342	98357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018500	AGAA	2	8	99041	99048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018500	AATG	2	8	99896	99903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018500	ATTT	2	8	99982	99989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018500	AGAC	2	8	102597	102604	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018500	TTTG	2	8	102717	102724	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018500	AATA	2	8	102778	102785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018500	ATTA	2	8	106148	106155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018500	ATAG	2	8	106169	106176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018500	TAAA	2	8	106201	106208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018500	TTGA	2	8	109202	109209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018500	TAGG	2	8	109249	109256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018500	ATAA	2	8	109615	109622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018500	AATT	2	8	109656	109663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018500	TTAA	2	8	109700	109707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018500	AATG	2	8	110476	110483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018500	AAAG	2	8	110935	110942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018500	CTTT	2	8	110965	110972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018500	AATA	2	8	111008	111015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018500	TGTT	2	8	111355	111362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018500	TTTC	2	8	111412	111419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018500	TTTA	2	8	111431	111438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018500	TTTA	2	8	112688	112695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018500	ACAA	2	8	113197	113204	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018500	AATG	2	8	113209	113216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018500	CTTG	2	8	113340	113347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018500	ATTA	2	8	114532	114539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018500	TTCT	2	8	114889	114896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018500	TTTA	2	8	117261	117268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018500	ATTA	2	8	117291	117298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018500	ATTA	2	8	117369	117376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018500	TAAT	2	8	118502	118509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018500	TTAG	2	8	118522	118529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018500	CTAA	2	8	118569	118576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018500	TTAT	2	8	119129	119136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018500	GAAA	2	8	119196	119203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018500	CATA	2	8	119496	119503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018500	ATTT	2	8	124380	124387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018500	ATAC	2	8	124480	124487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018500	TGAC	2	8	124840	124847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018500	GTTT	2	8	126225	126232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018500	TTAT	2	8	129505	129512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018500	TAGA	2	8	130744	130751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018500	TAGG	2	8	132551	132558	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018500	TAAT	2	8	133294	133301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018500	TAAA	2	8	136450	136457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018500	AAAT	2	8	138094	138101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018500	ATTT	2	8	138124	138131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018500	AATA	2	8	138273	138280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018500	ATTT	2	8	147073	147080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018500	TATG	2	8	147761	147768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018500	TGAA	2	8	147922	147929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018500	GCTT	2	8	150409	150416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018500	TTTC	2	8	150433	150440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018500	TAAG	2	8	153403	153410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018500	GGAT	2	8	159615	159622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018500	AACA	2	8	160297	160304	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018500	ATTT	2	8	160582	160589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018500	GTAC	2	8	164055	164062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018500	GAAT	2	8	164967	164974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018500	TAAA	2	8	166107	166114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018500	ATAA	2	8	166477	166484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018500	TTTA	2	8	167650	167657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018500	TTCT	2	8	167672	167679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018500	GAAG	2	8	170030	170037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018500	CTTT	2	8	175594	175601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018500	GTTT	2	8	180287	180294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018500	AATA	2	8	188484	188491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018500	AATA	2	8	188508	188515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018500	TTTC	2	8	190982	190989	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018500	AGTT	2	8	194835	194842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018500	TCTT	2	8	197270	197277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018500	TCTT	2	8	200389	200396	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018500	GTTA	2	8	200400	200407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018500	TGTA	2	8	204092	204099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018500	TGTA	2	8	207344	207351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018500	GAAT	2	8	208232	208239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018500	GGGA	2	8	208848	208855	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018500	TCTT	2	8	210339	210346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018500	TTCA	2	8	210394	210401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018500	GAAA	2	8	212897	212904	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018500	ACGT	2	8	212930	212937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018500	GGAA	2	8	214552	214559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018500	TGTA	2	8	221328	221335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018500	CGTC	2	8	221437	221444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018500	TTAG	2	8	224325	224332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018500	GTCT	2	8	224361	224368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018500	GAAT	2	8	229930	229937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018500	TTTA	2	8	230737	230744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018500	AGTA	2	8	231089	231096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018500	ATTT	2	8	233996	234003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018500	TGTT	2	8	234093	234100	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018500	AGTA	2	8	235748	235755	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018500	ATTT	2	8	235784	235791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018500	AGTG	2	8	239285	239292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018500	TGTT	2	8	243542	243549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018500	TACA	2	8	244249	244256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018500	AAAG	2	8	249121	249128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018500	GAAT	2	8	254197	254204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018500	AAAG	2	8	254621	254628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018500	CTTT	2	8	254640	254647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018500	ATTT	2	8	254784	254791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018500	CAAT	2	8	255109	255116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018500	AAAT	2	8	255262	255269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_018500	ATGA	2	8	626132	626139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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