MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma genitalium M2288 chromosome

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018498	AAAAGA	2	12	799	810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402552295
2	NC_018498	AGAGAT	2	12	2413	2424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402552296
3	NC_018498	AATCTA	2	12	12132	12143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402552304
4	NC_018498	TTTGCT	2	12	14278	14289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402552306
5	NC_018498	AACAAT	2	12	16686	16697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402552308
6	NC_018498	AATCAG	2	12	19177	19188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402552309
7	NC_018498	GAAAAA	2	12	21541	21552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402552310
8	NC_018498	AGATAA	2	12	25469	25480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402552313
9	NC_018498	GTCAAG	2	12	27584	27595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402552316
10	NC_018498	AAGTGA	2	12	27888	27899	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402552316
11	NC_018498	TAAAAG	2	12	28585	28596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018498	TCAACT	2	12	32165	32176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402552322
13	NC_018498	TTCTTT	2	12	34405	34416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402552323
14	NC_018498	TTATCT	2	12	35609	35620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402552323
15	NC_018498	CTTTTA	2	12	36114	36125	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402552323
16	NC_018498	TTTTAG	2	12	36767	36778	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018498	TGGTTA	2	12	38395	38406	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018498	ATGGTG	2	12	38568	38579	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018498	CTAATG	2	12	40700	40711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552326
20	NC_018498	CTTAAT	2	12	44291	44302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018498	CTAGCA	2	12	45168	45179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402552328
22	NC_018498	TGCTAT	2	12	46175	46186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402552328
23	NC_018498	TCAATA	2	12	46445	46456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402552329
24	NC_018498	AATCTA	2	12	46545	46556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402552329
25	NC_018498	AATTGA	2	12	49854	49865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402552332
26	NC_018498	AATCCT	2	12	52512	52523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402552334
27	NC_018498	TTGATT	2	12	52839	52850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402552334
28	NC_018498	CAGTAG	2	12	53415	53426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402552335
29	NC_018498	AAATGA	2	12	54490	54501	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402552335
30	NC_018498	TGAACT	2	12	55103	55114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552336
31	NC_018498	ATGTTG	2	12	55790	55801	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402552337
32	NC_018498	AATTAA	2	12	58648	58659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402552340
33	NC_018498	GCTACT	2	12	62765	62776	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402552344
34	NC_018498	ACTCAA	2	12	63034	63045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402552344
35	NC_018498	TTGTTT	2	12	63434	63445	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402552345
36	NC_018498	TACATC	2	12	66151	66162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402552349
37	NC_018498	TACCAA	2	12	68960	68971	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402552353
38	NC_018498	AATAAA	2	12	70347	70358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018498	CAAAGT	2	12	70735	70746	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402552354
40	NC_018498	CAAAAT	2	12	72094	72105	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402552354
41	NC_018498	GAAAGC	2	12	73453	73464	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402552356
42	NC_018498	ACTTTA	2	12	73946	73957	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402552357
43	NC_018498	TAGCAT	2	12	75615	75626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552357
44	NC_018498	TAACTT	2	12	79896	79907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402552359
45	NC_018498	AAATTA	2	12	81027	81038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402552359
46	NC_018498	AGAACA	2	12	81743	81754	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402552360
47	NC_018498	ATTTGT	2	12	82608	82619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402552361
48	NC_018498	TGGAAG	2	12	85644	85655	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018498	CTCCCC	2	12	86034	86045	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
50	NC_018498	TTGATG	2	12	90639	90650	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402552366
51	NC_018498	AACACC	2	12	91651	91662	50 %	0 %	0 %	50 %	402552367
52	NC_018498	TTGTGT	2	12	93002	93013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402552368
53	NC_018498	ACTGCA	2	12	93503	93514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402552368
54	NC_018498	ATTTTA	2	12	93533	93544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402552368
55	NC_018498	TTTTAC	2	12	99851	99862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402552372
56	NC_018498	CACTTT	2	12	100309	100320	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402552372
57	NC_018498	GTTAAT	2	12	101652	101663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402552372
58	NC_018498	CTTTTG	2	12	101920	101931	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402552372
59	NC_018498	CATTAA	2	12	102298	102309	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402552372
60	NC_018498	TGTTTT	2	12	102841	102852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402552373
61	NC_018498	TTTAGA	2	12	102995	103006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018498	TGTTAA	2	12	106682	106693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402552377
63	NC_018498	AGTGGT	2	12	106797	106808	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402552377
64	NC_018498	AGATTG	2	12	106861	106872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402552377
65	NC_018498	GACAAA	2	12	108715	108726	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402552377
66	NC_018498	AATGCT	2	12	110960	110971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552381
67	NC_018498	TTAATG	2	12	111649	111660	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402552381
68	NC_018498	CCAAAA	2	12	114290	114301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402552384
69	NC_018498	AAGAAA	2	12	114964	114975	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402552386
70	NC_018498	AATTGA	2	12	115502	115513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402552386
71	NC_018498	TGAACT	2	12	119040	119051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552391
72	NC_018498	TAATAG	2	12	119417	119428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402552391
73	NC_018498	AGAGAA	2	12	122701	122712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402552393
74	NC_018498	ATCAAG	2	12	123154	123165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402552393
75	NC_018498	ATCCTA	2	12	123793	123804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402552394
76	NC_018498	TTGTTA	2	12	125436	125447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402552395
77	NC_018498	AAAGAT	2	12	134930	134941	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402552405
78	NC_018498	GTGCTA	2	12	140124	140135	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402552411
79	NC_018498	TAAGAG	2	12	140409	140420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402552411
80	NC_018498	TAGTGT	2	12	147107	147118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402552418
81	NC_018498	ATTGTT	2	12	147657	147668	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402552418
82	NC_018498	TATTGC	2	12	148918	148929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402552419
83	NC_018498	AAGCTA	2	12	149433	149444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402552420
84	NC_018498	TAGATT	2	12	152236	152247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402552421
85	NC_018498	AGCAAA	2	12	152653	152664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402552421
86	NC_018498	CTAAAA	2	12	153118	153129	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402552423
87	NC_018498	AGTGTT	2	12	155232	155243	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402552425
88	NC_018498	ATGTTG	2	12	155924	155935	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402552426
89	NC_018498	AAAACC	2	12	156493	156504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402552427
90	NC_018498	AAAATC	2	12	157862	157873	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402552428
91	NC_018498	TGAAAA	2	12	158690	158701	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402552431
92	NC_018498	TGCTTG	2	12	161775	161786	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402552435
93	NC_018498	GAATAT	2	12	164552	164563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402552437
94	NC_018498	TGGAAG	2	12	167252	167263	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402552439
95	NC_018498	CTCCCC	2	12	167636	167647	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
96	NC_018498	GGCGAA	2	12	170567	170578	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018498	AAAAGA	2	12	180378	180389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402552445
98	NC_018498	AAGAGC	2	12	183487	183498	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402552449
99	NC_018498	CTTTAA	2	12	184521	184532	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402552450
100	NC_018498	TTTAAC	2	12	184722	184733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402552451
101	NC_018498	CATGAA	3	18	188881	188898	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402552454
102	NC_018498	TACACT	2	12	189319	189330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018498	CCTTTA	2	12	189990	190001	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402552456
104	NC_018498	GTTAGT	2	12	190754	190765	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402552457
105	NC_018498	AAACTA	2	12	191255	191266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402552458
106	NC_018498	TAAAAC	2	12	197164	197175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402552472
107	NC_018498	TCAAAC	2	12	198509	198520	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402552475
108	NC_018498	GGATTA	2	12	199563	199574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402552477
109	NC_018498	TTGCCA	2	12	203489	203500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402552484
110	NC_018498	TGGTTT	2	12	206171	206182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402552487
111	NC_018498	CAATGG	2	12	206896	206907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402552488
112	NC_018498	CACTTC	2	12	207145	207156	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402552488
113	NC_018498	CCATTG	2	12	207243	207254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402552488
114	NC_018498	ATAACC	2	12	208652	208663	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402552490
115	NC_018498	TTAAGT	2	12	209032	209043	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402552490
116	NC_018498	AGTTTT	2	12	211725	211736	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402552492
117	NC_018498	TAGTGA	2	12	211848	211859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402552492
118	NC_018498	AAAACA	2	12	212498	212509	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402552492
119	NC_018498	TGGAAG	2	12	213448	213459	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018498	CTCCCC	2	12	213800	213811	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
121	NC_018498	CTTTAA	2	12	215915	215926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402552495
122	NC_018498	ATAGCT	2	12	216172	216183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552495
123	NC_018498	TGGAAG	2	12	222038	222049	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402552500
124	NC_018498	ACCAAT	2	12	224308	224319	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402552500
125	NC_018498	TAGTGA	2	12	225138	225149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402552500
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127	NC_018498	TTGGGA	2	12	228618	228629	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402552501
128	NC_018498	CCCCAT	2	12	233039	233050	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	402552507
129	NC_018498	AAAACC	2	12	233465	233476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402552507
130	NC_018498	AACCAA	2	12	237617	237628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018498	TGAACC	2	12	237823	237834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018498	CAACTC	2	12	237912	237923	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018498	AGTTCA	2	12	238003	238014	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_018498	AACCAA	2	12	264610	264621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018498	TGAAGT	2	12	265178	265189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_018498	AACCCA	2	12	265703	265714	50 %	0 %	0 %	50 %	402552532
144	NC_018498	ATCTAA	2	12	266096	266107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018498	TGCTAA	2	12	266598	266609	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552534
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168	NC_018498	TTTTGA	2	12	305501	305512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018498	TGATAT	2	12	309140	309151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402552572
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174	NC_018498	CTCCCC	2	12	313040	313051	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	402552575
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177	NC_018498	TCAAGT	2	12	318983	318994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552582
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217	NC_018498	AATGCT	2	12	370313	370324	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552622
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221	NC_018498	CAATAA	2	12	377094	377105	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402552628
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224	NC_018498	TACTAT	3	18	384173	384190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
225	NC_018498	TTGTTT	2	12	384663	384674	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
226	NC_018498	TTTTAT	2	12	385508	385519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_018498	GCAACA	2	12	386035	386046	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
228	NC_018498	TCCTGA	2	12	386578	386589	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402552631
229	NC_018498	TTCAAA	2	12	387795	387806	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
230	NC_018498	CTAAAG	2	12	388808	388819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
231	NC_018498	ACTATT	2	12	389775	389786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
232	NC_018498	AAAGAT	2	12	392340	392351	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402552634
233	NC_018498	TTAGGT	2	12	394331	394342	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402552637
234	NC_018498	GCAGTT	2	12	398346	398357	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402552640
235	NC_018498	TACCAA	2	12	398492	398503	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402552640
236	NC_018498	AGCTGA	2	12	401383	401394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402552642
237	NC_018498	AAAAAT	2	12	405832	405843	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402552644
238	NC_018498	TTCAAC	2	12	408276	408287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402552646
239	NC_018498	ACTAAA	2	12	408930	408941	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402552648
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250	NC_018498	TGATGG	2	12	422574	422585	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402552661
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252	NC_018498	AAGATC	2	12	424310	424321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_018498	AAAGTT	2	12	424515	424526	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_018498	AAAATA	2	12	462733	462744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018498	AAAAGA	2	12	462806	462817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_018498	ATTTTG	2	12	463437	463448	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_018498	ATTAGC	2	12	496324	496335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552723
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320	NC_018498	AATGTT	2	12	526418	526429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402552749
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322	NC_018498	TTATTT	2	12	528679	528690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402552750
323	NC_018498	TTTTTA	2	12	531071	531082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_018498	TAAAAA	2	12	531442	531453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402552753
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328	NC_018498	CCTAAA	2	12	533980	533991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402552757
329	NC_018498	TTGAAA	2	12	539447	539458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402552761
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336	NC_018498	CAGTTT	2	12	557176	557187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402552780
337	NC_018498	CACCAA	2	12	561168	561179	50 %	0 %	0 %	50 %	402552784
338	NC_018498	TCTTTA	2	12	562520	562531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402552786
339	NC_018498	TTTTTA	2	12	564526	564537	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402552789
340	NC_018498	TGAAAT	2	12	566102	566113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402552790
341	NC_018498	AGTATC	2	12	566982	566993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402552790
342	NC_018498	TTAGGT	2	12	567362	567373	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402552791
343	NC_018498	GTTTTT	2	12	569075	569086	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402552793
344	NC_018498	ACCTGA	2	12	570092	570103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402552795
345	NC_018498	AATGAA	2	12	570815	570826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402552796
346	NC_018498	CAAAAA	2	12	572755	572766	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402552796
347	NC_018498	TTTTGA	2	12	574470	574481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402552796
348	NC_018498	TATCAC	2	12	574570	574581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402552796
349	NC_018498	AATTTT	2	12	576737	576748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_018498	TCTTTT	2	12	577210	577221	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402552798
351	NC_018498	ATCAAT	2	12	577314	577325	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402552798
352	NC_018498	CTAAAT	2	12	577457	577468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402552798
353	NC_018498	TTATTT	2	12	578589	578600	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402552799
354	NC_018498	TCAAGA	2	12	579397	579408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402552800

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.