MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma genitalium M2288 chromosome

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018498	AAAAC	2	10	15234	15243	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018498	TTTAA	2	10	15493	15502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018498	AATTA	2	10	28564	28573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018498	AAGTT	2	10	37599	37608	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018498	TAAGT	2	10	37768	37777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018498	AAGCT	2	10	37941	37950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018498	TACTA	2	10	38450	38459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018498	AAAAG	2	10	84109	84118	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018498	CTTTT	2	10	84140	84149	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018498	AGTTA	2	10	84342	84351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018498	TTATT	2	10	84529	84538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018498	GAAGT	2	10	85886	85895	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018498	AATTA	2	10	87908	87917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018498	GAAAA	2	10	121402	121411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018498	ATCCA	2	10	131146	131155	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_018498	ATCTC	2	10	168407	168416	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_018498	TCGTG	2	10	170907	170916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018498	CAATA	2	10	171561	171570	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018498	GAAAA	2	10	171782	171791	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018498	CTCAT	2	10	174088	174097	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018498	TTAAT	2	10	231769	231778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018498	AAACT	2	10	231782	231791	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018498	AAACC	2	10	247650	247659	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_018498	AGTGA	2	10	264987	264996	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018498	TACCC	2	10	265139	265148	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_018498	TCATT	2	10	266297	266306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018498	TTAAT	2	10	270074	270083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018498	TTTTA	2	10	305573	305582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018498	AAAAC	2	10	305645	305654	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018498	AAAAC	2	10	305814	305823	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018498	AAAAC	2	10	341727	341736	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018498	TAAAT	2	10	343467	343476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018498	CAAAA	2	10	344761	344770	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018498	ATTTA	2	10	346389	346398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018498	TTCCA	2	10	351052	351061	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018498	TAAAT	2	10	362523	362532	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018498	TTTAA	2	10	364225	364234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018498	TTCAT	2	10	366407	366416	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018498	TGTTC	2	10	366483	366492	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018498	TAAAT	2	10	367082	367091	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018498	TGTAA	2	10	367604	367613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018498	ATCAT	2	10	368036	368045	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018498	TAAAC	2	10	368286	368295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018498	TTTAA	2	10	371668	371677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018498	TTGGG	2	10	382979	382988	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018498	AAACC	2	10	383208	383217	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018498	TGATC	2	10	388203	388212	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018498	AGATT	2	10	389851	389860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018498	TCGCT	2	10	391095	391104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018498	AAAGC	2	10	398510	398519	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018498	AATTA	2	10	408662	408671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018498	ATAAC	2	10	423072	423081	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018498	ACTAA	2	10	426116	426125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018498	CCACT	2	10	426570	426579	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_018498	GTTTG	2	10	427956	427965	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018498	TCTCC	2	10	448341	448350	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_018498	TTAAA	2	10	450634	450643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018498	GTTAT	2	10	458997	459006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018498	GAAAA	2	10	462471	462480	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018498	AATTA	2	10	463163	463172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018498	TTTGT	2	10	493010	493019	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018498	TTTTC	2	10	508500	508509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018498	AAATG	2	10	515701	515710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018498	TAAAT	2	10	520919	520928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018498	AAATT	2	10	533256	533265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018498	TTTTC	2	10	537808	537817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018498	AATTG	2	10	543890	543899	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018498	TTTAA	2	10	551035	551044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018498	ATTTT	2	10	551515	551524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018498	AACAA	2	10	551596	551605	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018498	AAAAT	2	10	563439	563448	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.