MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma genitalium M6320 chromosome

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018497	AAAAGA	2	12	799	810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551785
2	NC_018497	AGAGAT	2	12	2413	2424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551786
3	NC_018497	AATCTA	2	12	12132	12143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551794
4	NC_018497	TTTGCT	2	12	14278	14289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402551796
5	NC_018497	AACAAT	2	12	16686	16697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551798
6	NC_018497	GAAAAA	2	12	21541	21552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551800
7	NC_018497	TCAGAA	2	12	22248	22259	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551800
8	NC_018497	GTAAGA	2	12	23740	23751	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551802
9	NC_018497	AGATAA	2	12	25468	25479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551803
10	NC_018497	GTCAAG	2	12	27583	27594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551806
11	NC_018497	AAGTGA	2	12	27887	27898	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551806
12	NC_018497	TCAACT	2	12	32164	32175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551812
13	NC_018497	TTCTTT	2	12	34404	34415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402551813
14	NC_018497	TTATCT	2	12	35608	35619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551813
15	NC_018497	CTTTTA	2	12	36113	36124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551813
16	NC_018497	TGGTTA	2	12	38391	38402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551814
17	NC_018497	ATGGTG	2	12	38564	38575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402551814
18	NC_018497	CTAATG	2	12	40698	40709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551817
19	NC_018497	CTAGCA	2	12	45166	45177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402551819
20	NC_018497	TGCTAT	2	12	46173	46184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402551819
21	NC_018497	TCAATA	2	12	46443	46454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551820
22	NC_018497	AATCTA	2	12	46543	46554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551820
23	NC_018497	AATTGA	2	12	49853	49864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551823
24	NC_018497	AATCCT	2	12	52511	52522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551825
25	NC_018497	TTGATT	2	12	52838	52849	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551825
26	NC_018497	CAGTAG	2	12	53414	53425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551826
27	NC_018497	AAATGA	2	12	54489	54500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551826
28	NC_018497	TGAACT	2	12	55102	55113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551827
29	NC_018497	ATGTTG	2	12	55789	55800	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551828
30	NC_018497	AATTAA	2	12	58647	58658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402551831
31	NC_018497	GCTACT	2	12	62764	62775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551835
32	NC_018497	ACTCAA	2	12	63033	63044	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551835
33	NC_018497	TTGTTT	2	12	63433	63444	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402551836
34	NC_018497	TACATC	2	12	66149	66160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551841
35	NC_018497	TACCAA	2	12	68958	68969	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551845
36	NC_018497	CAAAGT	2	12	70733	70744	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551846
37	NC_018497	CAAAAT	2	12	72092	72103	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551846
38	NC_018497	GAAAGC	2	12	73451	73462	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402551848
39	NC_018497	ACTTTA	2	12	73944	73955	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551849
40	NC_018497	TAGCAT	2	12	75613	75624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551849
41	NC_018497	TAACTT	2	12	79894	79905	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551851
42	NC_018497	AAATTA	2	12	81025	81036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402551851
43	NC_018497	AGAACA	2	12	81741	81752	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551852
44	NC_018497	ATTTGT	2	12	82606	82617	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551853
45	NC_018497	AAAAGA	2	12	84107	84118	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551854
46	NC_018497	TTTTGA	2	12	84297	84308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551854
47	NC_018497	AGGTGG	2	12	85797	85808	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	402551857
48	NC_018497	CTCCCC	2	12	86038	86049	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	402551858
49	NC_018497	TTGATG	2	12	90655	90666	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551864
50	NC_018497	AGCAAA	2	12	91467	91478	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551865
51	NC_018497	AACACC	2	12	91667	91678	50 %	0 %	0 %	50 %	402551865
52	NC_018497	CACAGG	2	12	97074	97085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402551867
53	NC_018497	TTTTAC	2	12	99866	99877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551869
54	NC_018497	CACTTT	2	12	100324	100335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402551869
55	NC_018497	GTTAAT	2	12	101667	101678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551869
56	NC_018497	CTTTTG	2	12	101935	101946	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402551869
57	NC_018497	CCTTTT	2	12	102257	102268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402551869
58	NC_018497	CATTAA	2	12	102313	102324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551869
59	NC_018497	TGTTTT	2	12	102856	102867	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402551870
60	NC_018497	TGTTAA	2	12	106699	106710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551874
61	NC_018497	AGTGGT	2	12	106814	106825	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402551874
62	NC_018497	AGATTG	2	12	106878	106889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551874
63	NC_018497	GACAAA	2	12	108732	108743	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551874
64	NC_018497	AATGCT	2	12	110976	110987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551880
65	NC_018497	TTAATG	2	12	111665	111676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551880
66	NC_018497	CCAAAA	2	12	114306	114317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402551883
67	NC_018497	AAGAAA	2	12	114980	114991	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551885
68	NC_018497	AATTGA	2	12	115518	115529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551885
69	NC_018497	TAATAG	2	12	119433	119444	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551890
70	NC_018497	AGAGAA	2	12	122717	122728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402551892
71	NC_018497	ATCAAG	2	12	123170	123181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551892
72	NC_018497	TTGTTA	2	12	125452	125463	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551894
73	NC_018497	AAAGAT	2	12	134946	134957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551904
74	NC_018497	GTGCTA	2	12	140140	140151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402551910
75	NC_018497	TAAGAG	2	12	140425	140436	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551910
76	NC_018497	TAGTGT	2	12	147123	147134	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551917
77	NC_018497	ATTGTT	2	12	147673	147684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551917
78	NC_018497	TATTGC	2	12	148934	148945	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402551918
79	NC_018497	AAGCTA	2	12	149449	149460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551919
80	NC_018497	TAGATT	2	12	152252	152263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551920
81	NC_018497	AGCAAA	2	12	152669	152680	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551920
82	NC_018497	CTAAAA	2	12	153133	153144	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551921
83	NC_018497	AGTGTT	2	12	155247	155258	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551924
84	NC_018497	ATGTTG	2	12	155939	155950	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551925
85	NC_018497	AAAACC	2	12	156508	156519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402551926
86	NC_018497	TGAAAA	2	12	158705	158716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551930
87	NC_018497	TGCTTG	2	12	161798	161809	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402551934
88	NC_018497	GAATAT	2	12	164575	164586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551936
89	NC_018497	ATGTTA	2	12	166282	166293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551937
90	NC_018497	AAAAGA	2	12	180396	180407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551943
91	NC_018497	AAGAGC	2	12	183502	183513	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402551947
92	NC_018497	CTTTAA	2	12	184536	184547	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551948
93	NC_018497	TTTAAC	2	12	184737	184748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551949
94	NC_018497	TGAACT	2	12	187958	187969	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551950
95	NC_018497	CATGAA	3	18	188907	188924	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551951
96	NC_018497	TACACT	2	12	189342	189353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551952
97	NC_018497	GTTAGT	2	12	190777	190788	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551954
98	NC_018497	AAACTA	2	12	191278	191289	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551955
99	NC_018497	AAAACA	2	12	193744	193755	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551960
100	NC_018497	TAAAAC	2	12	197200	197211	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551968
101	NC_018497	TCAAAC	2	12	198545	198556	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551971
102	NC_018497	GGATTA	2	12	199599	199610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551973
103	NC_018497	TTGCCA	2	12	203525	203536	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551980
104	NC_018497	TGGTTT	2	12	206207	206218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402551983
105	NC_018497	CAATGG	2	12	206932	206943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551984
106	NC_018497	CACTTC	2	12	207181	207192	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402551984
107	NC_018497	CCATTG	2	12	207279	207290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551984
108	NC_018497	ATAACC	2	12	208688	208699	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551986
109	NC_018497	TTAAGT	2	12	209068	209079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551986
110	NC_018497	AGTTTT	2	12	211761	211772	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551988
111	NC_018497	TAGTGA	2	12	211884	211895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551988
112	NC_018497	AAAACA	2	12	212534	212545	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551988
113	NC_018497	CTACCC	2	12	213839	213850	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	402551990
114	NC_018497	CTTTAA	2	12	215946	215957	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551995
115	NC_018497	ATAGCT	2	12	216203	216214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551995
116	NC_018497	CCCCAT	2	12	233013	233024	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	402552004
117	NC_018497	AAAACC	2	12	233439	233450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402552004
118	NC_018497	TAAAAA	2	12	239251	239262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402552009
119	NC_018497	AAGATT	2	12	239447	239458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402552009
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.