MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma genitalium M6320 chromosome

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018497	AAAAC	2	10	15234	15243	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018497	TTTAA	2	10	15493	15502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018497	AATTA	2	10	28563	28572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018497	TTATT	2	10	84528	84537	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018497	AATTA	2	10	87924	87933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018497	AAGAA	2	10	93437	93446	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018497	GATTT	2	10	94132	94141	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018497	GAAAA	2	10	121418	121427	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018497	ATCCA	2	10	131162	131171	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018497	TCGTG	2	10	170915	170924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018497	CAATA	2	10	171569	171578	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018497	GAAAA	2	10	171790	171799	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018497	CTCAT	2	10	174096	174105	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018497	TTTCG	2	10	186423	186432	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018497	GAAAC	2	10	224212	224221	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018497	AAACA	2	10	225000	225009	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018497	AAACC	2	10	225320	225329	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_018497	TTAGA	2	10	225337	225346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018497	AACAG	2	10	225627	225636	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018497	AACCA	2	10	225677	225686	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018497	TTCCA	2	10	226840	226849	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_018497	TGGTG	2	10	228731	228740	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018497	GTTTT	2	10	229256	229265	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018497	GGGAA	2	10	231245	231254	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018497	TTAAT	2	10	231743	231752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018497	AAACT	2	10	231756	231765	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018497	TCATT	2	10	266393	266402	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018497	AAACA	2	10	268409	268418	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018497	ACTGA	2	10	268448	268457	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018497	TTAAT	2	10	270169	270178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018497	TTTAC	2	10	289378	289387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018497	AATTA	2	10	295574	295583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018497	TTTTA	2	10	305659	305668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018497	AAAAC	2	10	305731	305740	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018497	AAAAC	2	10	305900	305909	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018497	TTATT	2	10	308998	309007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018497	AATTG	2	10	309289	309298	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018497	TCACT	2	10	329024	329033	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018497	GTTGT	2	10	329236	329245	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018497	AAAAC	2	10	341810	341819	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018497	TAAAT	2	10	343550	343559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018497	CAAAA	2	10	344844	344853	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018497	ATTTA	2	10	346472	346481	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018497	AGTTT	2	10	352039	352048	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018497	ATCTT	2	10	352845	352854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018497	TAAAT	2	10	362606	362615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018497	TTTAA	2	10	364308	364317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018497	TTCAT	2	10	366490	366499	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018497	TGTTC	2	10	366566	366575	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018497	TAAAT	2	10	367165	367174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018497	TGTAA	2	10	367687	367696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018497	ATCAT	2	10	368119	368128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018497	TAAAC	2	10	368369	368378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018497	TTTAA	2	10	371751	371760	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018497	TCGCT	2	10	391172	391181	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_018497	AAAGC	2	10	398588	398597	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018497	AATTA	2	10	408738	408747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018497	CTCTT	2	10	411179	411188	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018497	CATTC	2	10	411189	411198	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_018497	AAAGC	2	10	411708	411717	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018497	GTTTG	2	10	428026	428035	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018497	TTCCA	2	10	428977	428986	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_018497	TCTCC	2	10	448581	448590	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_018497	TTAAA	2	10	450874	450883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018497	GTTAT	2	10	459238	459247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018497	GAAAA	2	10	462711	462720	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018497	AATTA	2	10	463403	463412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018497	TTAAA	2	10	477221	477230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018497	GAAAA	2	10	478297	478306	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018497	TCAAA	2	10	483614	483623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018497	TTTGT	2	10	493249	493258	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018497	TTTTC	2	10	508742	508751	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018497	TAACA	2	10	512902	512911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018497	ATTGC	2	10	512915	512924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018497	TAAAT	2	10	514541	514550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018497	AAATG	2	10	515941	515950	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018497	TAAAT	2	10	521159	521168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018497	AAATT	2	10	533494	533503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018497	TTTTC	2	10	538046	538055	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018497	AATTG	2	10	544128	544137	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018497	AATTA	2	10	547710	547719	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018497	ATTAC	2	10	547999	548008	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018497	AACAA	2	10	548314	548323	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018497	AAAAG	2	10	548401	548410	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018497	TTTAA	2	10	551274	551283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018497	ATTTT	2	10	551754	551763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018497	AACAA	2	10	551835	551844	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018497	AACAT	2	10	552735	552744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018497	AAAAT	2	10	563677	563686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.