MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma genitalium M6282 chromosome

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018496	AAAAGA	2	12	799	810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551300
2	NC_018496	AGAGAT	2	12	2413	2424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551301
3	NC_018496	AATCTA	2	12	12131	12142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018496	TTTGCT	2	12	14275	14286	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402551308
5	NC_018496	AACAAT	2	12	16683	16694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551310
6	NC_018496	GAAAAA	2	12	21538	21549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551312
7	NC_018496	AGATAA	2	12	25465	25476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551315
8	NC_018496	GTCAAG	2	12	27580	27591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551318
9	NC_018496	AAGTGA	2	12	27884	27895	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551318
10	NC_018496	TAAAAG	2	12	28581	28592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018496	TCAACT	2	12	32160	32171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551323
12	NC_018496	TTCTTT	2	12	34400	34411	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402551324
13	NC_018496	TTATCT	2	12	35604	35615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551324
14	NC_018496	CTTTTA	2	12	36109	36120	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551324
15	NC_018496	TTTTAG	2	12	36762	36773	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018496	TGGTTA	2	12	38392	38403	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018496	ATGGTG	2	12	38564	38575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018496	CTAATG	2	12	40698	40709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551327
19	NC_018496	CTAGCA	2	12	45166	45177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402551329
20	NC_018496	TGCTAT	2	12	46173	46184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402551329
21	NC_018496	TCAATA	2	12	46443	46454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551330
22	NC_018496	AATCTA	2	12	46543	46554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551330
23	NC_018496	AATTGA	2	12	49853	49864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551333
24	NC_018496	AATCCT	2	12	52509	52520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551335
25	NC_018496	TTGATT	2	12	52836	52847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551335
26	NC_018496	CAGTAG	2	12	53412	53423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551336
27	NC_018496	AAATGA	2	12	54487	54498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551336
28	NC_018496	TGAACT	2	12	55100	55111	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551337
29	NC_018496	ATGTTG	2	12	55787	55798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551338
30	NC_018496	AATTAA	2	12	58644	58655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402551340
31	NC_018496	GCTACT	2	12	62761	62772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551344
32	NC_018496	ACTCAA	2	12	63030	63041	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551344
33	NC_018496	TTGTTT	2	12	63430	63441	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402551345
34	NC_018496	TACATC	2	12	66146	66157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551350
35	NC_018496	TACCAA	2	12	68955	68966	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551354
36	NC_018496	AATAAA	2	12	70342	70353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018496	CAAAGT	2	12	70730	70741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018496	CAAAAT	2	12	72089	72100	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018496	GAAAGC	2	12	73448	73459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402551356
40	NC_018496	ACTTTA	2	12	73941	73952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551357
41	NC_018496	TAGCAT	2	12	75610	75621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551357
42	NC_018496	TAACTT	2	12	79891	79902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551359
43	NC_018496	AAATTA	2	12	81022	81033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402551359
44	NC_018496	AGAACA	2	12	81738	81749	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551360
45	NC_018496	ATTTGT	2	12	82603	82614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551361
46	NC_018496	AAAAGA	2	12	84104	84115	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551362
47	NC_018496	CTACTT	2	12	86043	86054	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018496	TTGATG	2	12	90620	90631	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551366
49	NC_018496	AGCAAA	2	12	91432	91443	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551367
50	NC_018496	AACACC	2	12	91632	91643	50 %	0 %	0 %	50 %	402551367
51	NC_018496	TTGTGT	2	12	92983	92994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018496	ACTGCA	2	12	93484	93495	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018496	CACAGG	2	12	97038	97049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402551368
54	NC_018496	TTTTAC	2	12	99830	99841	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018496	CACTTT	2	12	100288	100299	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018496	GTTAAT	2	12	101631	101642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018496	CTTTTG	2	12	101899	101910	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018496	CATTAA	2	12	102276	102287	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018496	TGTTTT	2	12	102819	102830	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402551370
60	NC_018496	TTTAGA	2	12	102973	102984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018496	TGTTAA	2	12	106660	106671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551374
62	NC_018496	AGTGGT	2	12	106775	106786	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402551374
63	NC_018496	AGATTG	2	12	106839	106850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551374
64	NC_018496	GACAAA	2	12	108693	108704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551374
65	NC_018496	AATGCT	2	12	110937	110948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551380
66	NC_018496	TTAATG	2	12	111626	111637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551380
67	NC_018496	CCAAAA	2	12	114265	114276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018496	AAGAAA	2	12	114939	114950	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018496	AATTGA	2	12	115477	115488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018496	TAATAG	2	12	119391	119402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551387
71	NC_018496	AGAGAA	2	12	122675	122686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402551389
72	NC_018496	ATCAAG	2	12	123128	123139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551389
73	NC_018496	ATCCTA	2	12	123767	123778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551390
74	NC_018496	TTGTTA	2	12	125410	125421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551391
75	NC_018496	AAAGAT	2	12	134904	134915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551401
76	NC_018496	GTGCTA	2	12	140098	140109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402551407
77	NC_018496	TAAGAG	2	12	140383	140394	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551407
78	NC_018496	TAGTGT	2	12	147081	147092	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551414
79	NC_018496	ATTGTT	2	12	147631	147642	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551414
80	NC_018496	TATTGC	2	12	148892	148903	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402551415
81	NC_018496	AAGCTA	2	12	149407	149418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018496	TAGATT	2	12	152209	152220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551416
83	NC_018496	AGCAAA	2	12	152626	152637	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551416
84	NC_018496	CTAAAA	2	12	153091	153102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551418
85	NC_018496	AGTGTT	2	12	155205	155216	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551420
86	NC_018496	ATGTTG	2	12	155897	155908	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551421
87	NC_018496	AAAACC	2	12	156466	156477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402551422
88	NC_018496	TGAAAA	2	12	158663	158674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551426
89	NC_018496	TGCTTG	2	12	161756	161767	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402551430
90	NC_018496	GAATAT	2	12	164533	164544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551432
91	NC_018496	TGGAAG	2	12	167233	167244	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402551434
92	NC_018496	CTCCCC	2	12	167617	167628	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
93	NC_018496	GGCGAA	2	12	170404	170415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018496	AAAAGA	2	12	180218	180229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551441
95	NC_018496	AAGAGC	2	12	183326	183337	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402551445
96	NC_018496	CTTTAA	2	12	184360	184371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551446
97	NC_018496	TTTAAC	2	12	184561	184572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551447
98	NC_018496	TGAACT	2	12	187781	187792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551449
99	NC_018496	CATGAA	3	18	188721	188738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551450
100	NC_018496	TACACT	2	12	189156	189167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551451
101	NC_018496	GTTAGT	2	12	190591	190602	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551453
102	NC_018496	AAACTA	2	12	191092	191103	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551454
103	NC_018496	AAAACA	2	12	193558	193569	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551459
104	NC_018496	TAAAAC	2	12	197014	197025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551467
105	NC_018496	TAAAGG	2	12	197743	197754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551468
106	NC_018496	GGATTA	2	12	199413	199424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018496	TTGCCA	2	12	203340	203351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551478
108	NC_018496	TGGTTT	2	12	206022	206033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402551481
109	NC_018496	CAATGG	2	12	206747	206758	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551482
110	NC_018496	CACTTC	2	12	206996	207007	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402551482
111	NC_018496	CCATTG	2	12	207094	207105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551482
112	NC_018496	ATAACC	2	12	208503	208514	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551484
113	NC_018496	TTAAGT	2	12	208883	208894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551484
114	NC_018496	AGTTTT	2	12	211576	211587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551486
115	NC_018496	TAGTGA	2	12	211699	211710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551486
116	NC_018496	AAAACA	2	12	212349	212360	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551486
117	NC_018496	CTCCCC	2	12	213654	213665	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	402551487
118	NC_018496	CTTTAA	2	12	215781	215792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551491
119	NC_018496	ATAGCT	2	12	216038	216049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551491
120	NC_018496	TGGAAG	2	12	221904	221915	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018496	TAGTGA	2	12	224962	224973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018496	ACCAAG	2	12	227809	227820	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402551496
123	NC_018496	TTGGGA	2	12	228445	228456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402551496
124	NC_018496	CCCCAT	2	12	232773	232784	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	402551503
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126	NC_018496	AACCAA	2	12	237350	237361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018496	TGAACC	2	12	237556	237567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018496	AGTTCA	2	12	237689	237700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018496	TAAAAA	2	12	238963	238974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402551507
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140	NC_018496	ATCTAA	2	12	265905	265916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_018496	TGCTAA	2	12	266407	266418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551531
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146	NC_018496	GTTTTT	2	12	271636	271647	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_018496	TGATTG	2	12	290111	290122	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_018496	ATTACT	4	24	383983	384006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551621
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230	NC_018496	AAAGAT	2	12	392147	392158	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
231	NC_018496	AAAGAA	2	12	392309	392320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
232	NC_018496	TTAGGT	2	12	394135	394146	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551627
233	NC_018496	GCAGTT	2	12	398149	398160	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402551630
234	NC_018496	TACCAA	2	12	398295	398306	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551630
235	NC_018496	AGCTGA	2	12	401186	401197	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551632
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237	NC_018496	TTCAAC	2	12	408079	408090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551636
238	NC_018496	ACTAAA	2	12	408733	408744	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551638
239	NC_018496	ATCTGT	2	12	409981	409992	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402551639
240	NC_018496	CTTTTT	2	12	410041	410052	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402551639
241	NC_018496	CCAATT	2	12	413365	413376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551641
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251	NC_018496	AAGATC	2	12	424110	424121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_018496	AAAGTT	2	12	424315	424326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_018496	AAGAAT	2	12	426737	426748	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551652
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265	NC_018496	TTTTAT	2	12	448375	448386	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_018496	AAAATA	2	12	462691	462702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_018496	AAAATT	2	12	478280	478291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_018496	TGCTTT	2	12	480832	480843	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402551698
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289	NC_018496	TTTTAG	2	12	482907	482918	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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318	NC_018496	CCTGAT	2	12	526319	526330	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551733
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322	NC_018496	TTTTTA	2	12	531022	531033	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_018496	TAAAAA	2	12	531392	531403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402551737
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337	NC_018496	TCTTTA	2	12	562466	562477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551769
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340	NC_018496	AGTATC	2	12	566928	566939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551773
341	NC_018496	TTAGGT	2	12	567308	567319	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551774
342	NC_018496	GTTTTT	2	12	569021	569032	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402551776
343	NC_018496	ACCTGA	2	12	570038	570049	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402551778
344	NC_018496	AATGAA	2	12	570761	570772	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551779
345	NC_018496	CAAAAA	2	12	572701	572712	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551779
346	NC_018496	TTTTGA	2	12	574416	574427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551779
347	NC_018496	TATCAC	2	12	574516	574527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551779
348	NC_018496	AATTTT	2	12	576683	576694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
349	NC_018496	TCTTTT	2	12	577156	577167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402551781
350	NC_018496	ATCAAT	2	12	577260	577271	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551781
351	NC_018496	CTAAAT	2	12	577403	577414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551781
352	NC_018496	TTATTT	2	12	578535	578546	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402551782
353	NC_018496	TCAAGA	2	12	579343	579354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551783

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.