MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma genitalium M6282 chromosome

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018496	AAAAGA	2	12	799	810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551300
2	NC_018496	AGAGAT	2	12	2413	2424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551301
3	NC_018496	TTTGCT	2	12	14275	14286	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402551308
4	NC_018496	AACAAT	2	12	16683	16694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551310
5	NC_018496	GAAAAA	2	12	21538	21549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551312
6	NC_018496	AGATAA	2	12	25465	25476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551315
7	NC_018496	GTCAAG	2	12	27580	27591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551318
8	NC_018496	AAGTGA	2	12	27884	27895	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551318
9	NC_018496	TCAACT	2	12	32160	32171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551323
10	NC_018496	TTCTTT	2	12	34400	34411	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402551324
11	NC_018496	TTATCT	2	12	35604	35615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551324
12	NC_018496	CTTTTA	2	12	36109	36120	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551324
13	NC_018496	CTAATG	2	12	40698	40709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551327
14	NC_018496	CTAGCA	2	12	45166	45177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402551329
15	NC_018496	TGCTAT	2	12	46173	46184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402551329
16	NC_018496	TCAATA	2	12	46443	46454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551330
17	NC_018496	AATCTA	2	12	46543	46554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551330
18	NC_018496	AATTGA	2	12	49853	49864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551333
19	NC_018496	AATCCT	2	12	52509	52520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551335
20	NC_018496	TTGATT	2	12	52836	52847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551335
21	NC_018496	CAGTAG	2	12	53412	53423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551336
22	NC_018496	AAATGA	2	12	54487	54498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551336
23	NC_018496	TGAACT	2	12	55100	55111	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551337
24	NC_018496	ATGTTG	2	12	55787	55798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551338
25	NC_018496	AATTAA	2	12	58644	58655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402551340
26	NC_018496	GCTACT	2	12	62761	62772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551344
27	NC_018496	ACTCAA	2	12	63030	63041	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551344
28	NC_018496	TTGTTT	2	12	63430	63441	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402551345
29	NC_018496	TACATC	2	12	66146	66157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551350
30	NC_018496	TACCAA	2	12	68955	68966	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551354
31	NC_018496	GAAAGC	2	12	73448	73459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402551356
32	NC_018496	ACTTTA	2	12	73941	73952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551357
33	NC_018496	TAGCAT	2	12	75610	75621	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551357
34	NC_018496	TAACTT	2	12	79891	79902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551359
35	NC_018496	AAATTA	2	12	81022	81033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402551359
36	NC_018496	AGAACA	2	12	81738	81749	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551360
37	NC_018496	ATTTGT	2	12	82603	82614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551361
38	NC_018496	AAAAGA	2	12	84104	84115	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551362
39	NC_018496	TTGATG	2	12	90620	90631	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551366
40	NC_018496	AGCAAA	2	12	91432	91443	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551367
41	NC_018496	AACACC	2	12	91632	91643	50 %	0 %	0 %	50 %	402551367
42	NC_018496	CACAGG	2	12	97038	97049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402551368
43	NC_018496	TGTTTT	2	12	102819	102830	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402551370
44	NC_018496	TGTTAA	2	12	106660	106671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551374
45	NC_018496	AGTGGT	2	12	106775	106786	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402551374
46	NC_018496	AGATTG	2	12	106839	106850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551374
47	NC_018496	GACAAA	2	12	108693	108704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551374
48	NC_018496	AATGCT	2	12	110937	110948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551380
49	NC_018496	TTAATG	2	12	111626	111637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551380
50	NC_018496	TAATAG	2	12	119391	119402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551387
51	NC_018496	AGAGAA	2	12	122675	122686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402551389
52	NC_018496	ATCAAG	2	12	123128	123139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551389
53	NC_018496	ATCCTA	2	12	123767	123778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551390
54	NC_018496	TTGTTA	2	12	125410	125421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551391
55	NC_018496	AAAGAT	2	12	134904	134915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551401
56	NC_018496	GTGCTA	2	12	140098	140109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402551407
57	NC_018496	TAAGAG	2	12	140383	140394	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551407
58	NC_018496	TAGTGT	2	12	147081	147092	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551414
59	NC_018496	ATTGTT	2	12	147631	147642	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551414
60	NC_018496	TATTGC	2	12	148892	148903	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402551415
61	NC_018496	TAGATT	2	12	152209	152220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551416
62	NC_018496	AGCAAA	2	12	152626	152637	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402551416
63	NC_018496	CTAAAA	2	12	153091	153102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551418
64	NC_018496	AGTGTT	2	12	155205	155216	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551420
65	NC_018496	ATGTTG	2	12	155897	155908	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551421
66	NC_018496	AAAACC	2	12	156466	156477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402551422
67	NC_018496	TGAAAA	2	12	158663	158674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551426
68	NC_018496	TGCTTG	2	12	161756	161767	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402551430
69	NC_018496	GAATAT	2	12	164533	164544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551432
70	NC_018496	TGGAAG	2	12	167233	167244	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402551434
71	NC_018496	AAAAGA	2	12	180218	180229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551441
72	NC_018496	AAGAGC	2	12	183326	183337	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402551445
73	NC_018496	CTTTAA	2	12	184360	184371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551446
74	NC_018496	TTTAAC	2	12	184561	184572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551447
75	NC_018496	TGAACT	2	12	187781	187792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551449
76	NC_018496	CATGAA	3	18	188721	188738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551450
77	NC_018496	TACACT	2	12	189156	189167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551451
78	NC_018496	GTTAGT	2	12	190591	190602	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551453
79	NC_018496	AAACTA	2	12	191092	191103	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551454
80	NC_018496	AAAACA	2	12	193558	193569	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551459
81	NC_018496	TAAAAC	2	12	197014	197025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551467
82	NC_018496	TAAAGG	2	12	197743	197754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551468
83	NC_018496	TTGCCA	2	12	203340	203351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551478
84	NC_018496	TGGTTT	2	12	206022	206033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402551481
85	NC_018496	CAATGG	2	12	206747	206758	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551482
86	NC_018496	CACTTC	2	12	206996	207007	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402551482
87	NC_018496	CCATTG	2	12	207094	207105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551482
88	NC_018496	ATAACC	2	12	208503	208514	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551484
89	NC_018496	TTAAGT	2	12	208883	208894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551484
90	NC_018496	AGTTTT	2	12	211576	211587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551486
91	NC_018496	TAGTGA	2	12	211699	211710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551486
92	NC_018496	AAAACA	2	12	212349	212360	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551486
93	NC_018496	CTCCCC	2	12	213654	213665	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	402551487
94	NC_018496	CTTTAA	2	12	215781	215792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551491
95	NC_018496	ATAGCT	2	12	216038	216049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551491
96	NC_018496	ACCAAG	2	12	227809	227820	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402551496
97	NC_018496	TTGGGA	2	12	228445	228456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402551496
98	NC_018496	CCCCAT	2	12	232773	232784	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	402551503
99	NC_018496	AAAACC	2	12	233199	233210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402551503
100	NC_018496	TAAAAA	2	12	238963	238974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402551507
101	NC_018496	AAGATT	2	12	239159	239170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551507
102	NC_018496	GAAGTG	2	12	240588	240599	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402551509
103	NC_018496	AAAAGA	2	12	240746	240757	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551509
104	NC_018496	AAAAAC	2	12	246612	246623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551512
105	NC_018496	TGAAAT	2	12	247116	247127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551513
106	NC_018496	AACCAA	2	12	264295	264306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402551528
107	NC_018496	TGATCC	2	12	264609	264620	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551528
108	NC_018496	TGAAGT	2	12	264951	264962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551528
109	NC_018496	ATAGTG	2	12	265158	265169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551528
110	NC_018496	AACCCA	2	12	265476	265487	50 %	0 %	0 %	50 %	402551529
111	NC_018496	TGCTAA	2	12	266407	266418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551531
112	NC_018496	GTTTTA	2	12	266950	266961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551532
113	NC_018496	ATGAAA	2	12	268776	268787	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402551534
114	NC_018496	ACCAAA	2	12	269862	269873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402551534
115	NC_018496	CTCCCC	2	12	272895	272906	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	402551535
116	NC_018496	ATTTAG	2	12	273320	273331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551536
117	NC_018496	TACAGA	2	12	273372	273383	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551536
118	NC_018496	GGAGCG	2	12	276916	276927	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	402551540
119	NC_018496	TGATAA	2	12	278049	278060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551540
120	NC_018496	GATTAA	2	12	278721	278732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551541
121	NC_018496	TAAACT	2	12	280371	280382	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551545
122	NC_018496	AAAATT	2	12	281475	281486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402551546
123	NC_018496	GTGCTG	2	12	285019	285030	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	402551548
124	NC_018496	GGAGAT	2	12	286415	286426	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402551550
125	NC_018496	TAATGA	2	12	291451	291462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551552
126	NC_018496	TAAAAA	2	12	291562	291573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402551552
127	NC_018496	TCAAAA	2	12	292540	292551	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551552
128	NC_018496	CTTAAA	2	12	294639	294650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551555
129	NC_018496	TATCTC	2	12	299046	299057	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402551558
130	NC_018496	CATTTT	2	12	301680	301691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551560
131	NC_018496	TATCAG	2	12	301872	301883	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551560
132	NC_018496	AATGTT	2	12	311582	311593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551565
133	NC_018496	TGGAAG	2	12	312415	312426	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402551566
134	NC_018496	TGATAT	3	18	316266	316283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551570
135	NC_018496	TTTATT	2	12	317363	317374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402551570
136	NC_018496	TCAAGT	2	12	318788	318799	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551572
137	NC_018496	AGAGAT	2	12	319307	319318	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402551572
138	NC_018496	TTGATA	2	12	320216	320227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402551573
139	NC_018496	TTAGTG	2	12	320267	320278	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551573
140	NC_018496	AAAATC	2	12	321463	321474	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551575
141	NC_018496	TTTGGA	2	12	322600	322611	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551576
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144	NC_018496	TTCACT	2	12	326209	326220	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402551579
145	NC_018496	TCTGTT	2	12	331769	331780	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402551584
146	NC_018496	TCATTT	2	12	332560	332571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551584
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170	NC_018496	TCACTA	2	12	370358	370369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551613
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219	NC_018496	CAAATT	2	12	466593	466604	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551686
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224	NC_018496	TGCTTT	2	12	480832	480843	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402551698
225	NC_018496	AGCATA	2	12	481150	481161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551698
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227	NC_018496	ATCAAA	2	12	484046	484057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551700
228	NC_018496	CAGGTT	2	12	485412	485423	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402551701
229	NC_018496	AGTTTG	2	12	485677	485688	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551701
230	NC_018496	TAGTTT	2	12	486933	486944	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551701
231	NC_018496	TTCTGT	2	12	487177	487188	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402551701
232	NC_018496	TTTTTC	2	12	487960	487971	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402551701
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.