MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma genitalium M2321 chromosome

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018495	AAAAGA	2	12	799	810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550800
2	NC_018495	AGAGAT	2	12	2413	2424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402550801
3	NC_018495	AATCTA	2	12	12132	12143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402550809
4	NC_018495	TTTGCT	2	12	14278	14289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402550811
5	NC_018495	AACAAT	2	12	16686	16697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550813
6	NC_018495	GAAAAA	2	12	21541	21552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550815
7	NC_018495	TCAGAA	2	12	22248	22259	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550815
8	NC_018495	GTAAGA	2	12	23741	23752	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402550817
9	NC_018495	AGATAA	2	12	25469	25480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402550818
10	NC_018495	GTCAAG	2	12	27584	27595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402550821
11	NC_018495	AAGTGA	2	12	27888	27899	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402550821
12	NC_018495	TAAAAG	2	12	28585	28596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018495	TCAACT	2	12	32164	32175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550826
14	NC_018495	TTCTTT	2	12	34404	34415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402550827
15	NC_018495	TTATCT	2	12	35608	35619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402550827
16	NC_018495	CTTTTA	2	12	36113	36124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402550827
17	NC_018495	TTTTAG	2	12	36766	36777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018495	TGGTTA	2	12	38394	38405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550828
19	NC_018495	ATGGTG	2	12	38567	38578	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402550828
20	NC_018495	CTAATG	2	12	40701	40712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550831
21	NC_018495	CTTAAT	2	12	44292	44303	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018495	CTAGCA	2	12	45169	45180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402550833
23	NC_018495	TGCTAT	2	12	46176	46187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402550833
24	NC_018495	TCAATA	2	12	46446	46457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402550834
25	NC_018495	AATCTA	2	12	46546	46557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402550834
26	NC_018495	AATTGA	2	12	49855	49866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402550837
27	NC_018495	AATCCT	2	12	52513	52524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550839
28	NC_018495	TTGATT	2	12	52840	52851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550839
29	NC_018495	CAGTAG	2	12	53416	53427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402550840
30	NC_018495	AAATGA	2	12	54491	54502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402550840
31	NC_018495	TGAACT	2	12	55104	55115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550841
32	NC_018495	ATGTTG	2	12	55791	55802	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550842
33	NC_018495	AATTAA	2	12	58649	58660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018495	GCTACT	2	12	62765	62776	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402550848
35	NC_018495	ACTCAA	2	12	63034	63045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402550848
36	NC_018495	TTGTTT	2	12	63434	63445	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402550849
37	NC_018495	TACATC	2	12	66150	66161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550854
38	NC_018495	TACCAA	2	12	68959	68970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402550858
39	NC_018495	AATAAA	2	12	70346	70357	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018495	CAAAGT	2	12	70734	70745	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550859
41	NC_018495	CAAAAT	2	12	72093	72104	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550859
42	NC_018495	GAAAGC	2	12	73452	73463	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402550861
43	NC_018495	ACTTTA	2	12	73945	73956	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402550862
44	NC_018495	TAGCAT	2	12	75614	75625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550862
45	NC_018495	TAACTT	2	12	79895	79906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402550864
46	NC_018495	AAATTA	2	12	81026	81037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402550864
47	NC_018495	AGAACA	2	12	81742	81753	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402550865
48	NC_018495	ATTTGT	2	12	82607	82618	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550866
49	NC_018495	AAAAGA	2	12	84108	84119	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550867
50	NC_018495	CTCCCC	2	12	86034	86045	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
51	NC_018495	TTGATG	2	12	90619	90630	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550873
52	NC_018495	AGCAAA	2	12	91431	91442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402550874
53	NC_018495	CAACAC	2	12	91630	91641	50 %	0 %	0 %	50 %	402550874
54	NC_018495	TTGTGT	2	12	92982	92993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402550875
55	NC_018495	CACAGG	2	12	97039	97050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402550877
56	NC_018495	CACTTT	2	12	100289	100300	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402550879
57	NC_018495	GTTAAT	2	12	101632	101643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550879
58	NC_018495	CTTTTG	2	12	101900	101911	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402550879
59	NC_018495	CATTAA	2	12	102281	102292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402550879
60	NC_018495	TGTTTT	2	12	102824	102835	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402550880
61	NC_018495	TTTAGA	2	12	102978	102989	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018495	TGTTAA	2	12	106666	106677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550884
63	NC_018495	AGTGGT	2	12	106781	106792	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402550884
64	NC_018495	AGATTG	2	12	106845	106856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402550884
65	NC_018495	GACAAA	2	12	108699	108710	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402550884
66	NC_018495	AATGCT	2	12	110944	110955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550888
67	NC_018495	TTAATG	2	12	111633	111644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550888
68	NC_018495	CCAAAA	2	12	114274	114285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402550891
69	NC_018495	AAGAAA	2	12	114948	114959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550893
70	NC_018495	AATTGA	2	12	115486	115497	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402550893
71	NC_018495	TGAACT	2	12	119024	119035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550898
72	NC_018495	TAATAG	2	12	119401	119412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402550898
73	NC_018495	AGAGAA	2	12	122685	122696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402550900
74	NC_018495	ATCAAG	2	12	123138	123149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550900
75	NC_018495	ATCCTA	2	12	123777	123788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550901
76	NC_018495	TTGTTA	2	12	125420	125431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550902
77	NC_018495	AAAGAT	2	12	134914	134925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402550912
78	NC_018495	GTGCTA	2	12	140108	140119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402550918
79	NC_018495	TAAGAG	2	12	140393	140404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402550918
80	NC_018495	TAGTGT	2	12	147091	147102	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550925
81	NC_018495	ATTGTT	2	12	147641	147652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550925
82	NC_018495	TATTGC	2	12	148902	148913	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402550926
83	NC_018495	AAGCTA	2	12	149417	149428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550927
84	NC_018495	TAGATT	2	12	152220	152231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550928
85	NC_018495	AGCAAA	2	12	152637	152648	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402550928
86	NC_018495	CTAAAA	2	12	153102	153113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550930
87	NC_018495	AGTGTT	2	12	155216	155227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550932
88	NC_018495	ATGTTG	2	12	155908	155919	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550933
89	NC_018495	AAAACC	2	12	156477	156488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402550934
90	NC_018495	TGAAAA	2	12	158674	158685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402550938
91	NC_018495	TGCTTG	2	12	161766	161777	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402550942
92	NC_018495	GAATAT	2	12	164543	164554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402550944
93	NC_018495	ATGTTA	2	12	166250	166261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550945
94	NC_018495	CTCCCC	2	12	167620	167631	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_018495	AAACCA	2	12	169480	169491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018495	GGCGAA	2	12	170690	170701	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018495	CAATCC	2	12	174974	174985	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	402550948
98	NC_018495	AAAAGA	2	12	180506	180517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550951
99	NC_018495	AAGAGC	2	12	183611	183622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402550955
100	NC_018495	CTTTAA	2	12	184645	184656	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402550956
101	NC_018495	TTTAAC	2	12	184846	184857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402550957
102	NC_018495	TGAACT	2	12	188068	188079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550959
103	NC_018495	CATGAA	3	18	189017	189034	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550960
104	NC_018495	TACACT	2	12	189452	189463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550961
105	NC_018495	GTTAGT	2	12	190887	190898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550963
106	NC_018495	AAACTA	2	12	191388	191399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550964
107	NC_018495	TAAAAC	2	12	197310	197321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550977
108	NC_018495	TCAAAC	2	12	198655	198666	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402550980
109	NC_018495	GGATTA	2	12	199709	199720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402550982
110	NC_018495	TTGCCA	2	12	203635	203646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402550989
111	NC_018495	TGGTTT	2	12	206317	206328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402550992
112	NC_018495	CAATGG	2	12	207042	207053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402550993
113	NC_018495	CACTTC	2	12	207291	207302	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402550993
114	NC_018495	CCATTG	2	12	207389	207400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402550993
115	NC_018495	ATAACC	2	12	208798	208809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402550995
116	NC_018495	TTAAGT	2	12	209178	209189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550995
117	NC_018495	AGTTTT	2	12	211871	211882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550997
118	NC_018495	TAGTGA	2	12	211994	212005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402550997
119	NC_018495	AAAACA	2	12	212644	212655	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402550997
120	NC_018495	CTCCCC	2	12	213942	213953	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	402550998
121	NC_018495	TCAAAT	2	12	215067	215078	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551000
122	NC_018495	CTTTAA	2	12	216062	216073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551002
123	NC_018495	ATAGCT	2	12	216319	216330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551002
124	NC_018495	AGGTGG	2	12	222338	222349	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	402551007
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126	NC_018495	TAGTGA	2	12	225228	225239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551007
127	NC_018495	AACCAA	2	12	227105	227116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018495	ACCAAG	2	12	228090	228101	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018495	TTGGGA	2	12	228726	228737	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018495	CCCCAT	2	12	233146	233157	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	402551014
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133	NC_018495	TGAACC	2	12	237929	237940	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018495	CAACTC	2	12	238018	238029	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018495	AGTTCA	2	12	238109	238120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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147	NC_018495	TGCTAA	2	12	266827	266838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551042
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150	NC_018495	ACCAAA	2	12	270282	270293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018495	TTTGAT	2	12	271448	271459	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_018495	AAAATA	2	12	309564	309575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_018495	TTTAAA	2	12	380413	380424	50 %	50 %	0 %	0 %	402551130
224	NC_018495	ATTACT	3	18	384413	384430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551132
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227	NC_018495	GCAACA	2	12	386271	386282	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402551132
228	NC_018495	TCCTGA	2	12	386814	386825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402551133
229	NC_018495	TTCAAA	2	12	388031	388042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551135
230	NC_018495	CTAAAG	2	12	389044	389055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551135
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233	NC_018495	TTAGGT	2	12	394561	394572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551139
234	NC_018495	GCAGTT	2	12	398576	398587	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402551142
235	NC_018495	TACCAA	2	12	398722	398733	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551142
236	NC_018495	AGCTGA	2	12	401617	401628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402551144
237	NC_018495	AAAAAT	2	12	406066	406077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402551147
238	NC_018495	TTCAAC	2	12	408510	408521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551149
239	NC_018495	ACTAAA	2	12	409164	409175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402551151
240	NC_018495	ATCTGT	2	12	410412	410423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402551152
241	NC_018495	CTTTTT	2	12	410472	410483	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402551152
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252	NC_018495	AAGATC	2	12	424543	424554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_018495	AAAGTT	2	12	424748	424759	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_018495	CTTCCT	2	12	429967	429978	0 %	50 %	0 %	50 %	402551167
259	NC_018495	TTTGGT	2	12	431601	431612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402551170
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266	NC_018495	TTTTAT	2	12	448847	448858	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_018495	CCTTTT	2	12	452702	452713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_018495	CAAAAC	2	12	458217	458228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_018495	ATCAAA	2	12	459339	459350	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
273	NC_018495	AGCATA	2	12	461801	461812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551197
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275	NC_018495	AAAATA	2	12	463162	463173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_018495	AAAAGA	2	12	463235	463246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_018495	TTTTTA	2	12	531496	531507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_018495	TAAAAA	2	12	531867	531878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402551252
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327	NC_018495	CCTAAA	2	12	534403	534414	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402551256
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339	NC_018495	CTTTTA	2	12	565044	565055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402551287
340	NC_018495	TGAAAT	2	12	566521	566532	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551288
341	NC_018495	AGTATC	2	12	567401	567412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551288
342	NC_018495	TTAGGT	2	12	567781	567792	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551289
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345	NC_018495	CAAAAA	2	12	573174	573185	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402551294
346	NC_018495	TTTTGA	2	12	574889	574900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551294
347	NC_018495	TATCAC	2	12	574989	575000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402551294
348	NC_018495	AATTTT	2	12	577156	577167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
349	NC_018495	TCTTTT	2	12	577629	577640	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402551296
350	NC_018495	ATCAAT	2	12	577733	577744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551296
351	NC_018495	CTAAAT	2	12	577876	577887	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551296
352	NC_018495	GGTTGT	2	12	578672	578683	0 %	50 %	50 %	0 %	402551297
353	NC_018495	TTATTT	2	12	579008	579019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402551297
354	NC_018495	TCAAGA	2	12	579816	579827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551298

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.