MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma genitalium M2321 chromosome

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018495	AAAAGA	2	12	799	810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550800
2	NC_018495	AGAGAT	2	12	2413	2424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402550801
3	NC_018495	AATCTA	2	12	12132	12143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402550809
4	NC_018495	TTTGCT	2	12	14278	14289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402550811
5	NC_018495	AACAAT	2	12	16686	16697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550813
6	NC_018495	GAAAAA	2	12	21541	21552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550815
7	NC_018495	TCAGAA	2	12	22248	22259	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550815
8	NC_018495	GTAAGA	2	12	23741	23752	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402550817
9	NC_018495	AGATAA	2	12	25469	25480	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402550818
10	NC_018495	GTCAAG	2	12	27584	27595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402550821
11	NC_018495	AAGTGA	2	12	27888	27899	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402550821
12	NC_018495	TCAACT	2	12	32164	32175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550826
13	NC_018495	TTCTTT	2	12	34404	34415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402550827
14	NC_018495	TTATCT	2	12	35608	35619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402550827
15	NC_018495	CTTTTA	2	12	36113	36124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402550827
16	NC_018495	TGGTTA	2	12	38394	38405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550828
17	NC_018495	ATGGTG	2	12	38567	38578	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402550828
18	NC_018495	CTAATG	2	12	40701	40712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550831
19	NC_018495	CTAGCA	2	12	45169	45180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402550833
20	NC_018495	TGCTAT	2	12	46176	46187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402550833
21	NC_018495	TCAATA	2	12	46446	46457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402550834
22	NC_018495	AATCTA	2	12	46546	46557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402550834
23	NC_018495	AATTGA	2	12	49855	49866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402550837
24	NC_018495	AATCCT	2	12	52513	52524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550839
25	NC_018495	TTGATT	2	12	52840	52851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550839
26	NC_018495	CAGTAG	2	12	53416	53427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402550840
27	NC_018495	AAATGA	2	12	54491	54502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402550840
28	NC_018495	TGAACT	2	12	55104	55115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550841
29	NC_018495	ATGTTG	2	12	55791	55802	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550842
30	NC_018495	GCTACT	2	12	62765	62776	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402550848
31	NC_018495	ACTCAA	2	12	63034	63045	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402550848
32	NC_018495	TTGTTT	2	12	63434	63445	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402550849
33	NC_018495	TACATC	2	12	66150	66161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550854
34	NC_018495	TACCAA	2	12	68959	68970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402550858
35	NC_018495	CAAAGT	2	12	70734	70745	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550859
36	NC_018495	CAAAAT	2	12	72093	72104	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550859
37	NC_018495	GAAAGC	2	12	73452	73463	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402550861
38	NC_018495	ACTTTA	2	12	73945	73956	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402550862
39	NC_018495	TAGCAT	2	12	75614	75625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550862
40	NC_018495	TAACTT	2	12	79895	79906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402550864
41	NC_018495	AAATTA	2	12	81026	81037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402550864
42	NC_018495	AGAACA	2	12	81742	81753	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402550865
43	NC_018495	ATTTGT	2	12	82607	82618	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550866
44	NC_018495	AAAAGA	2	12	84108	84119	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550867
45	NC_018495	TTGATG	2	12	90619	90630	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550873
46	NC_018495	AGCAAA	2	12	91431	91442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402550874
47	NC_018495	CAACAC	2	12	91630	91641	50 %	0 %	0 %	50 %	402550874
48	NC_018495	TTGTGT	2	12	92982	92993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402550875
49	NC_018495	CACAGG	2	12	97039	97050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402550877
50	NC_018495	CACTTT	2	12	100289	100300	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402550879
51	NC_018495	GTTAAT	2	12	101632	101643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550879
52	NC_018495	CTTTTG	2	12	101900	101911	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402550879
53	NC_018495	CATTAA	2	12	102281	102292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402550879
54	NC_018495	TGTTTT	2	12	102824	102835	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402550880
55	NC_018495	TGTTAA	2	12	106666	106677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550884
56	NC_018495	AGTGGT	2	12	106781	106792	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402550884
57	NC_018495	AGATTG	2	12	106845	106856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402550884
58	NC_018495	GACAAA	2	12	108699	108710	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402550884
59	NC_018495	AATGCT	2	12	110944	110955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550888
60	NC_018495	TTAATG	2	12	111633	111644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550888
61	NC_018495	CCAAAA	2	12	114274	114285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402550891
62	NC_018495	AAGAAA	2	12	114948	114959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550893
63	NC_018495	AATTGA	2	12	115486	115497	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402550893
64	NC_018495	TGAACT	2	12	119024	119035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550898
65	NC_018495	TAATAG	2	12	119401	119412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402550898
66	NC_018495	AGAGAA	2	12	122685	122696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402550900
67	NC_018495	ATCAAG	2	12	123138	123149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550900
68	NC_018495	ATCCTA	2	12	123777	123788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550901
69	NC_018495	TTGTTA	2	12	125420	125431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550902
70	NC_018495	AAAGAT	2	12	134914	134925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402550912
71	NC_018495	GTGCTA	2	12	140108	140119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402550918
72	NC_018495	TAAGAG	2	12	140393	140404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402550918
73	NC_018495	TAGTGT	2	12	147091	147102	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550925
74	NC_018495	ATTGTT	2	12	147641	147652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550925
75	NC_018495	TATTGC	2	12	148902	148913	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402550926
76	NC_018495	AAGCTA	2	12	149417	149428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550927
77	NC_018495	TAGATT	2	12	152220	152231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550928
78	NC_018495	AGCAAA	2	12	152637	152648	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402550928
79	NC_018495	CTAAAA	2	12	153102	153113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550930
80	NC_018495	AGTGTT	2	12	155216	155227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550932
81	NC_018495	ATGTTG	2	12	155908	155919	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550933
82	NC_018495	AAAACC	2	12	156477	156488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402550934
83	NC_018495	TGAAAA	2	12	158674	158685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402550938
84	NC_018495	TGCTTG	2	12	161766	161777	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402550942
85	NC_018495	GAATAT	2	12	164543	164554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402550944
86	NC_018495	ATGTTA	2	12	166250	166261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550945
87	NC_018495	CAATCC	2	12	174974	174985	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	402550948
88	NC_018495	AAAAGA	2	12	180506	180517	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402550951
89	NC_018495	AAGAGC	2	12	183611	183622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402550955
90	NC_018495	CTTTAA	2	12	184645	184656	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402550956
91	NC_018495	TTTAAC	2	12	184846	184857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402550957
92	NC_018495	TGAACT	2	12	188068	188079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402550959
93	NC_018495	CATGAA	3	18	189017	189034	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402550960
94	NC_018495	TACACT	2	12	189452	189463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402550961
95	NC_018495	GTTAGT	2	12	190887	190898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402550963
96	NC_018495	AAACTA	2	12	191388	191399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550964
97	NC_018495	TAAAAC	2	12	197310	197321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402550977
98	NC_018495	TCAAAC	2	12	198655	198666	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402550980
99	NC_018495	GGATTA	2	12	199709	199720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402550982
100	NC_018495	TTGCCA	2	12	203635	203646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402550989
101	NC_018495	TGGTTT	2	12	206317	206328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402550992
102	NC_018495	CAATGG	2	12	207042	207053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402550993
103	NC_018495	CACTTC	2	12	207291	207302	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402550993
104	NC_018495	CCATTG	2	12	207389	207400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402550993
105	NC_018495	ATAACC	2	12	208798	208809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402550995
106	NC_018495	TTAAGT	2	12	209178	209189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402550995
107	NC_018495	AGTTTT	2	12	211871	211882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402550997
108	NC_018495	TAGTGA	2	12	211994	212005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402550997
109	NC_018495	AAAACA	2	12	212644	212655	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402550997
110	NC_018495	CTCCCC	2	12	213942	213953	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	402550998
111	NC_018495	TCAAAT	2	12	215067	215078	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551000
112	NC_018495	CTTTAA	2	12	216062	216073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402551002
113	NC_018495	ATAGCT	2	12	216319	216330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551002
114	NC_018495	AGGTGG	2	12	222338	222349	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	402551007
115	NC_018495	CTCCCC	2	12	223848	223859	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	402551007
116	NC_018495	TAGTGA	2	12	225228	225239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551007
117	NC_018495	CCCCAT	2	12	233146	233157	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	402551014
118	NC_018495	AAAACC	2	12	233572	233583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402551014
119	NC_018495	TAAAAA	2	12	239383	239394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402551018
120	NC_018495	AAGATT	2	12	239579	239590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402551018
121	NC_018495	GAAGTG	2	12	241008	241019	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402551020
122	NC_018495	AAAAGA	2	12	241166	241177	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551020
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129	NC_018495	TGCTAA	2	12	266827	266838	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402551042
130	NC_018495	GTTTTA	2	12	267370	267381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402551043
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132	NC_018495	TACAGA	2	12	273790	273801	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551046
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141	NC_018495	TGATTG	2	12	290531	290542	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402551061
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143	NC_018495	TAAAAA	2	12	291982	291993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402551063
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230	NC_018495	AAAGAA	2	12	449008	449019	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402551181
231	NC_018495	AGTATG	2	12	449644	449655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402551182
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233	NC_018495	AGCATA	2	12	461801	461812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402551197
234	NC_018495	CAAATT	2	12	467064	467075	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402551200
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.