MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus FRI-35 plasmid p02

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018493	TTTGA	2	10	382	391	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018493	GTTCC	2	10	1745	1754	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018493	TAAAA	2	10	1767	1776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018493	ATTTT	2	10	1961	1970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018493	TTTTC	2	10	2725	2734	0 %	80 %	0 %	20 %	402552806
6	NC_018493	AGTAA	2	10	3032	3041	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018493	AAATG	2	10	5535	5544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018493	TCAAA	2	10	5848	5857	60 %	20 %	0 %	20 %	402552809
9	NC_018493	ATATA	2	10	5896	5905	60 %	40 %	0 %	0 %	402552809
10	NC_018493	TCATG	2	10	7720	7729	20 %	40 %	20 %	20 %	402552811
11	NC_018493	TACTA	2	10	7821	7830	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018493	GATAC	2	10	7852	7861	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018493	TCGCT	2	10	10188	10197	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018493	ATTTT	2	10	10504	10513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018493	ATATT	2	10	11910	11919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018493	CGGTT	2	10	12793	12802	0 %	40 %	40 %	20 %	402552815
17	NC_018493	AAATC	2	10	13565	13574	60 %	20 %	0 %	20 %	402552816
18	NC_018493	AAATT	2	10	14056	14065	60 %	40 %	0 %	0 %	402552817
19	NC_018493	TAAAA	2	10	14246	14255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018493	GATCT	2	10	14685	14694	20 %	40 %	20 %	20 %	402552818
21	NC_018493	GAATT	2	10	15392	15401	40 %	40 %	20 %	0 %	402552819
22	NC_018493	CATAT	2	10	16082	16091	40 %	40 %	0 %	20 %	402552820
23	NC_018493	ATTTC	2	10	16207	16216	20 %	60 %	0 %	20 %	402552821
24	NC_018493	ATACA	2	10	16247	16256	60 %	20 %	0 %	20 %	402552821
25	NC_018493	TTCGT	2	10	16539	16548	0 %	60 %	20 %	20 %	402552821
26	NC_018493	GATTG	2	10	17109	17118	20 %	40 %	40 %	0 %	402552821
27	NC_018493	TAATA	2	10	17612	17621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018493	AATAC	2	10	18294	18303	60 %	20 %	0 %	20 %	402552822
29	NC_018493	TTTCT	2	10	18573	18582	0 %	80 %	0 %	20 %	402552822
30	NC_018493	AAACA	2	10	18999	19008	80 %	0 %	0 %	20 %	402552823
31	NC_018493	TTTAT	2	10	19187	19196	20 %	80 %	0 %	0 %	402552823
32	NC_018493	ATGAA	2	10	20308	20317	60 %	20 %	20 %	0 %	402552824
33	NC_018493	TTACT	2	10	22820	22829	20 %	60 %	0 %	20 %	402552826
34	NC_018493	AATGT	2	10	23131	23140	40 %	40 %	20 %	0 %	402552826
35	NC_018493	GTTTA	2	10	24242	24251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018493	ATCGT	2	10	26060	26069	20 %	40 %	20 %	20 %	402552828
37	NC_018493	TCGAA	2	10	26264	26273	40 %	20 %	20 %	20 %	402552828
38	NC_018493	TAATT	2	10	27874	27883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018493	ACAAT	2	10	30034	30043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018493	TTCGA	2	10	30135	30144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018493	TTTTA	2	10	30173	30182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018493	ACAAT	2	10	30801	30810	60 %	20 %	0 %	20 %	402552831
43	NC_018493	TTTCG	2	10	32737	32746	0 %	60 %	20 %	20 %	402552834
44	NC_018493	AAATT	2	10	33840	33849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018493	CAAAA	2	10	33870	33879	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018493	TTTTG	2	10	33952	33961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018493	ATTTC	2	10	34128	34137	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018493	TGTAT	2	10	34824	34833	20 %	60 %	20 %	0 %	402552835
49	NC_018493	AAAGA	2	10	36741	36750	80 %	0 %	20 %	0 %	402552837
50	NC_018493	ATAAC	2	10	38043	38052	60 %	20 %	0 %	20 %	402552839
51	NC_018493	TATAA	2	10	38072	38081	60 %	40 %	0 %	0 %	402552839
52	NC_018493	TTCGA	2	10	38192	38201	20 %	40 %	20 %	20 %	402552839
53	NC_018493	TCGTA	2	10	38861	38870	20 %	40 %	20 %	20 %	402552840
54	NC_018493	TTTCA	2	10	39142	39151	20 %	60 %	0 %	20 %	402552840
55	NC_018493	TAATA	2	10	40171	40180	60 %	40 %	0 %	0 %	402552842

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.