MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018492	TCACAT	2	12	1342	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402557994
2	NC_018492	CTGTAA	2	12	1454	1465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402557994
3	NC_018492	GATCCA	2	12	2675	2686	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402557995
4	NC_018492	AGAAAA	2	12	5565	5576	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402557997
5	NC_018492	ATAAAT	2	12	6338	6349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402557998
6	NC_018492	TTCATG	2	12	7064	7075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402557999
7	NC_018492	ATTTTC	2	12	8458	8469	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558000
8	NC_018492	TCTAAA	2	12	10395	10406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558001
9	NC_018492	TCAAAA	2	12	11019	11030	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402558001
10	NC_018492	ATTAGC	2	12	15614	15625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558005
11	NC_018492	TAGACG	2	12	27456	27467	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558015
12	NC_018492	CCCTTT	2	12	30977	30988	0 %	50 %	0 %	50 %	402558018
13	NC_018492	ATTCTG	2	12	36603	36614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558022
14	NC_018492	TCTTTT	2	12	37007	37018	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558023
15	NC_018492	CATGGG	2	12	38876	38887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	402558026
16	NC_018492	AGTTAA	2	12	44009	44020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558030
17	NC_018492	ATCTCT	2	12	47941	47952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402558032
18	NC_018492	GCAATT	2	12	49553	49564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558033
19	NC_018492	AATTTG	2	12	50384	50395	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558034
20	NC_018492	AATTGA	2	12	50495	50506	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558035
21	NC_018492	GGTATT	2	12	54134	54145	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558039
22	NC_018492	ACAAAG	2	12	60834	60845	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558045
23	NC_018492	CTTATT	2	12	61199	61210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558045
24	NC_018492	ACAAGA	2	12	63429	63440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558047
25	NC_018492	TTCTTT	2	12	67979	67990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558053
26	NC_018492	TCATTT	2	12	70458	70469	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558057
27	NC_018492	AAAGAT	2	12	73521	73532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558065
28	NC_018492	TGCAGC	2	12	74188	74199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	402558067
29	NC_018492	TTCCTC	2	12	75677	75688	0 %	50 %	0 %	50 %	402558068
30	NC_018492	GTATAG	2	12	76970	76981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558068
31	NC_018492	TGTGTA	2	12	82910	82921	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558075
32	NC_018492	TTGTTC	2	12	83616	83627	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402558077
33	NC_018492	TAAGAG	2	12	84366	84377	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558078
34	NC_018492	TTTCCA	2	12	85228	85239	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402558079
35	NC_018492	GTCATT	2	12	85396	85407	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558080
36	NC_018492	TGTTCT	2	12	86176	86187	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402558082
37	NC_018492	TCTTTT	2	12	87325	87336	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558083
38	NC_018492	TCTAAT	2	12	88135	88146	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558084
39	NC_018492	TGTTTT	2	12	89480	89491	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402558087
40	NC_018492	CTTTTT	2	12	91422	91433	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558088
41	NC_018492	TTTGAT	2	12	92380	92391	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402558089
42	NC_018492	TTGCGT	2	12	93200	93211	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402558089
43	NC_018492	GACTAA	2	12	95699	95710	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558089
44	NC_018492	TTTTCA	2	12	98156	98167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558091
45	NC_018492	TTTGAA	2	12	99992	100003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558094
46	NC_018492	AAGGTT	2	12	105982	105993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558100
47	NC_018492	ACAATC	2	12	108155	108166	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402558104
48	NC_018492	CTTCCG	2	12	109267	109278	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	402558105
49	NC_018492	CTTTCC	2	12	109550	109561	0 %	50 %	0 %	50 %	402558105
50	NC_018492	ATTTCT	2	12	109704	109715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558105
51	NC_018492	TACAAA	2	12	110364	110375	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402558106
52	NC_018492	ATCTGT	2	12	111048	111059	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558106
53	NC_018492	TCCCTG	2	12	115429	115440	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	402558113
54	NC_018492	CTCTCC	2	12	115751	115762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558113
55	NC_018492	CTGGAT	2	12	121692	121703	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558120
56	NC_018492	GCATCT	2	12	123986	123997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558121
57	NC_018492	ACCAAA	2	12	124054	124065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558121
58	NC_018492	TGCTCC	2	12	124192	124203	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	402558121
59	NC_018492	TGCTGT	2	12	124231	124242	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402558121
60	NC_018492	TTTGTT	2	12	128790	128801	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402558126
61	NC_018492	TATCAA	2	12	131807	131818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558128
62	NC_018492	TCACCA	2	12	132499	132510	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	402558129
63	NC_018492	TTTCAC	2	12	146901	146912	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402558143
64	NC_018492	ACGATT	2	12	152052	152063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558150
65	NC_018492	ATCATT	2	12	157902	157913	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558159
66	NC_018492	CAGACG	2	12	167755	167766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558168
67	NC_018492	CTAGAG	2	12	168255	168266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558168
68	NC_018492	AACAAG	2	12	170591	170602	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558169
69	NC_018492	AATTGA	2	12	171546	171557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558170
70	NC_018492	AATGAA	2	12	171565	171576	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558170
71	NC_018492	AAAGGA	2	12	173161	173172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558173
72	NC_018492	TGGTTC	2	12	173562	173573	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402558173
73	NC_018492	GGAAAG	2	12	174214	174225	50 %	0 %	50 %	0 %	402558174
74	NC_018492	CTTCAT	2	12	174998	175009	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402558175
75	NC_018492	AATTTA	2	12	189212	189223	50 %	50 %	0 %	0 %	402558191
76	NC_018492	CCTTGA	2	12	190107	190118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558191
77	NC_018492	TTCAAT	2	12	195960	195971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558197
78	NC_018492	TTATAT	2	12	202049	202060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558204
79	NC_018492	CCAAAT	2	12	203834	203845	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402558205
80	NC_018492	TACAGG	2	12	204427	204438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558205
81	NC_018492	AATTCT	2	12	205106	205117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558205
82	NC_018492	TCCAAA	2	12	205411	205422	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402558205
83	NC_018492	CAAGTA	2	12	206975	206986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558205
84	NC_018492	AATCCA	2	12	206999	207010	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402558205
85	NC_018492	AATGCA	2	12	207737	207748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558205
86	NC_018492	TTACAA	2	12	211173	211184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558205
87	NC_018492	TGAATA	2	12	215758	215769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558205
88	NC_018492	ATTACG	2	12	216305	216316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558205

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.