MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus FRI-35 chromosome

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018491	AATATA	2	12	3923	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018491	CAAAAG	2	12	22409	22420	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018491	TAGAAA	2	12	23563	23574	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018491	ATATTT	2	12	60614	60625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018491	ATAAAA	2	12	65774	65785	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018491	TAAAAA	2	12	90073	90084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018491	GATACC	2	12	134723	134734	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018491	ATAAAA	2	12	146038	146049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018491	TATACA	2	12	199645	199656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018491	TTTGTA	2	12	225621	225632	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018491	CCTTTC	2	12	239823	239834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018491	TATAAT	2	12	250376	250387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018491	ACTTTT	2	12	283802	283813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018491	TTATCC	2	12	295729	295740	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018491	CTATCC	2	12	295741	295752	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018491	ATTTGA	2	12	296122	296133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018491	CTTTTT	2	12	320248	320259	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018491	AATTTT	2	12	344055	344066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018491	TTATTT	2	12	349933	349944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018491	ATAAAA	2	12	354602	354613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018491	TTTTCT	2	12	391714	391725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018491	ATACTT	2	12	397949	397960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018491	TATATT	2	12	427049	427060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018491	TATTTT	2	12	434744	434755	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018491	AAGCGG	2	12	436714	436725	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018491	GCTGGA	2	12	436815	436826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018491	GAAAAA	2	12	446569	446580	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018491	AAATAA	2	12	516683	516694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018491	GAAATG	2	12	521330	521341	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018491	TGAAAG	2	12	524451	524462	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018491	GAAAAG	2	12	532153	532164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018491	AAAAGA	2	12	571436	571447	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018491	AAAATG	2	12	585310	585321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018491	AAAGTA	2	12	592767	592778	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018491	CTTTAT	2	12	603177	603188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018491	TAAAGC	2	12	603319	603330	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018491	TCTCCT	2	12	623815	623826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018491	ATTTAT	2	12	646402	646413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018491	TGTTAT	2	12	649374	649385	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018491	AAAATG	2	12	664691	664702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018491	AAAAAC	2	12	729307	729318	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018491	TAATAT	2	12	752635	752646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018491	ACTTTA	2	12	762010	762021	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018491	TTACAT	2	12	776988	776999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018491	TATTTC	2	12	780305	780316	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018491	ACTTAT	2	12	795082	795093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018491	AAATGT	2	12	795156	795167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018491	GCAACA	2	12	796822	796833	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018491	TTTTAA	2	12	852977	852988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018491	TAAACT	2	12	853351	853362	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018491	TAAAAA	2	12	862747	862758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018491	TCCACC	2	12	874423	874434	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018491	TTTAAG	2	12	875969	875980	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018491	TTTGTT	2	12	882656	882667	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018491	TATCTA	2	12	917884	917895	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018491	AAAAAG	2	12	924808	924819	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018491	AAATTA	2	12	947891	947902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018491	AAAAAG	2	12	973231	973242	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018491	TATACA	2	12	986338	986349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018491	AATGAT	2	12	1038773	1038784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018491	ACCGAT	2	12	1051660	1051671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018491	AATTGG	2	12	1111496	1111507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018491	ATTTTT	2	12	1142350	1142361	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018491	TCAGCT	2	12	1147865	1147876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018491	GAATTA	2	12	1206396	1206407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018491	AAATAT	2	12	1218936	1218947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018491	TCAAAT	2	12	1222215	1222226	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018491	TCTATT	2	12	1223741	1223752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018491	TAAATA	2	12	1225440	1225451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018491	AACAAA	2	12	1284712	1284723	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018491	TAAAAA	2	12	1309312	1309323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018491	TTTATA	2	12	1317584	1317595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018491	ATGAAA	2	12	1351850	1351861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018491	TATTTT	2	12	1373025	1373036	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018491	TACATA	2	12	1388701	1388712	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018491	CAATGT	2	12	1471363	1471374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018491	CTTCTC	2	12	1476231	1476242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018491	TTGACT	2	12	1487684	1487695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018491	AATATA	2	12	1498608	1498619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018491	ATATAA	2	12	1498703	1498714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018491	AAACGA	2	12	1550152	1550163	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018491	AAACGA	2	12	1569930	1569941	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018491	TAATAG	2	12	1578982	1578993	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018491	GAGGTA	2	12	1590914	1590925	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018491	ATATGT	2	12	1614079	1614090	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018491	ATAGTA	2	12	1619068	1619079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018491	TTTCTA	2	12	1619133	1619144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_018491	TGTATT	2	12	1663272	1663283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018491	GTTAAC	2	12	1715335	1715346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018491	TATATG	2	12	1716974	1716985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018491	AAAGTG	2	12	1722079	1722090	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018491	AAGCGG	2	12	1724335	1724346	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018491	ATCTTT	2	12	1761838	1761849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018491	TCCAGC	2	12	1766040	1766051	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018491	TCCAGT	2	12	1774113	1774124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018491	AAGCGG	2	12	1785415	1785426	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018491	AAGCGG	2	12	1786686	1786697	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018491	TATTTG	2	12	1804034	1804045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018491	AGCAAA	2	12	1806697	1806708	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018491	TATTTT	2	12	1813806	1813817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018491	TTGTTA	2	12	1818453	1818464	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018491	GGTGAA	2	12	1858663	1858674	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018491	AAGTGA	2	12	1870767	1870778	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018491	TTTGCT	2	12	1872509	1872520	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018491	ATGTAT	2	12	1893379	1893390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018491	TCTCTT	2	12	1910132	1910143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018491	GAAAAA	2	12	1916620	1916631	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018491	AGAAAA	2	12	1921561	1921572	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018491	TGGTAT	2	12	1937127	1937138	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018491	AAATAT	2	12	1975947	1975958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018491	CTTTTT	2	12	1979358	1979369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018491	TGATGG	2	12	1990999	1991010	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018491	AAAAAG	2	12	1992505	1992516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018491	AAATGA	2	12	1993947	1993958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018491	AATTGC	2	12	2012159	2012170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018491	TTTTTA	2	12	2014757	2014768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018491	AGGGTG	2	12	2022082	2022093	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018491	TCCAGC	2	12	2029624	2029635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018491	CCGCTT	2	12	2029725	2029736	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018491	TCCAGC	2	12	2030400	2030411	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018491	TAAAAG	2	12	2034073	2034084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018491	GAAAAG	2	12	2043159	2043170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018491	ATTTTT	2	12	2077437	2077448	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018491	TAAAGG	2	12	2082104	2082115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018491	AATGGG	2	12	2105353	2105364	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018491	CGCTTT	2	12	2118899	2118910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018491	ATGAAA	2	12	2124917	2124928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018491	CTTTTT	2	12	2126705	2126716	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.