MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p08

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018490	CAT	2	6	53	58	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018490	ATT	2	6	101	106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018490	CAA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018490	ATC	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018490	CCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018490	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018490	ATA	2	6	403	408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018490	CAC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018490	CCA	2	6	545	550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402574995
10	NC_018490	TGC	2	6	566	571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402574995
11	NC_018490	ATC	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574995
12	NC_018490	TAT	2	6	703	708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574995
13	NC_018490	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574995
14	NC_018490	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574995
15	NC_018490	ATA	2	6	871	876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574995
16	NC_018490	AAG	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574995
17	NC_018490	ATA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574995
18	NC_018490	TGC	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402574995
19	NC_018490	AAC	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574995
20	NC_018490	CTT	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018490	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018490	TCT	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018490	TCT	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018490	CTG	2	6	1807	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018490	TAT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018490	AGA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018490	GTG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018490	TGG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018490	ATG	2	6	2785	2790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018490	GTA	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018490	AAT	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018490	GCT	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018490	TCA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018490	CTT	2	6	2974	2979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018490	ACA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018490	AAT	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018490	TCA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574996
38	NC_018490	TTC	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574996
39	NC_018490	AAT	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574996
40	NC_018490	TCA	4	12	3437	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574996
41	NC_018490	TCT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574996
42	NC_018490	ATA	2	6	3515	3520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574996
43	NC_018490	TAT	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018490	ATA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018490	AGA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574997
46	NC_018490	CTA	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574997
47	NC_018490	CAA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574997
48	NC_018490	ATA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018490	CAA	2	6	4039	4044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574998
50	NC_018490	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
51	NC_018490	CTT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
52	NC_018490	ATC	3	9	4127	4135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
53	NC_018490	TCA	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
54	NC_018490	CTT	3	9	4183	4191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
55	NC_018490	CAA	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574998
56	NC_018490	TTC	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
57	NC_018490	TAA	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574998
58	NC_018490	TTA	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574998
59	NC_018490	GAC	2	6	4573	4578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402574998
60	NC_018490	TCT	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
61	NC_018490	TGT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402574998
62	NC_018490	TTG	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402574998
63	NC_018490	TCA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
64	NC_018490	ATT	2	6	4776	4781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574998
65	NC_018490	AAC	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018490	TTC	2	6	4919	4924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018490	GAA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018490	ATT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
69	NC_018490	TTC	2	6	5097	5102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
70	NC_018490	ATT	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
71	NC_018490	TTC	2	6	5231	5236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
72	NC_018490	CAA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574999
73	NC_018490	AAT	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
74	NC_018490	ATC	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
75	NC_018490	AAT	2	6	5663	5668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
76	NC_018490	CAT	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
77	NC_018490	TCA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
78	NC_018490	AGA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574999
79	NC_018490	AAT	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
80	NC_018490	CTA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
81	NC_018490	TCA	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
82	NC_018490	CTA	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
83	NC_018490	AGA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574999
84	NC_018490	TCA	2	6	6192	6197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
85	NC_018490	ATG	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402574999
86	NC_018490	ACT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
87	NC_018490	TAA	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
88	NC_018490	TCT	2	6	6579	6584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
89	NC_018490	CTT	2	6	6632	6637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
90	NC_018490	TAA	2	6	6715	6720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
91	NC_018490	CAA	2	6	6730	6735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574999
92	NC_018490	TTC	2	6	6743	6748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
93	NC_018490	ATT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
94	NC_018490	ATC	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
95	NC_018490	TAA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
96	NC_018490	CAT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
97	NC_018490	TTA	2	6	7233	7238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
98	NC_018490	AAT	2	6	7350	7355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575000
99	NC_018490	TAT	2	6	7414	7419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575000
100	NC_018490	AGA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575000
101	NC_018490	AGA	2	6	7670	7675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575000
102	NC_018490	ACC	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018490	ACT	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018490	AAT	3	9	7823	7831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018490	TAA	2	6	7836	7841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018490	CAA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018490	TTA	2	6	7888	7893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018490	TAA	2	6	8006	8011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018490	TCT	2	6	8098	8103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018490	TAA	2	6	8138	8143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018490	AAC	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018490	ATA	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018490	TTC	2	6	8199	8204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018490	TGT	2	6	8301	8306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402575001
115	NC_018490	ATC	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575001
116	NC_018490	CAC	2	6	8441	8446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402575001
117	NC_018490	CAT	2	6	8471	8476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575001
118	NC_018490	TAA	2	6	8499	8504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575001
119	NC_018490	TTC	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402575001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.