MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p08

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018490	CAT	2	6	53	58	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018490	ATT	2	6	101	106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018490	CAA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018490	ATC	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018490	CCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018490	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018490	ATA	2	6	403	408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018490	CAC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018490	CTT	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018490	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018490	TCT	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018490	TCT	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018490	CTG	2	6	1807	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018490	TAT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018490	AGA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018490	GTG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018490	TGG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018490	ATG	2	6	2785	2790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018490	GTA	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018490	AAT	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018490	GCT	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018490	TCA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018490	CTT	2	6	2974	2979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018490	ACA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018490	AAT	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018490	TAT	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018490	ATA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018490	ATA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018490	AAC	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018490	TTC	2	6	4919	4924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018490	GAA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018490	ACC	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018490	ACT	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018490	AAT	3	9	7823	7831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018490	TAA	2	6	7836	7841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018490	CAA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018490	TTA	2	6	7888	7893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018490	TAA	2	6	8006	8011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018490	TCT	2	6	8098	8103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018490	TAA	2	6	8138	8143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018490	AAC	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018490	ATA	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018490	TTC	2	6	8199	8204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.