MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p08

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018490	CCA	2	6	545	550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402574995
2	NC_018490	TGC	2	6	566	571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402574995
3	NC_018490	ATC	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574995
4	NC_018490	TAT	2	6	703	708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574995
5	NC_018490	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574995
6	NC_018490	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574995
7	NC_018490	ATA	2	6	871	876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574995
8	NC_018490	AAG	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574995
9	NC_018490	ATA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574995
10	NC_018490	TGC	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402574995
11	NC_018490	AAC	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574995
12	NC_018490	TCA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574996
13	NC_018490	TTC	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574996
14	NC_018490	AAT	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574996
15	NC_018490	TCA	4	12	3437	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574996
16	NC_018490	TCT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574996
17	NC_018490	ATA	2	6	3515	3520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574996
18	NC_018490	AGA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574997
19	NC_018490	CTA	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574997
20	NC_018490	CAA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574997
21	NC_018490	CAA	2	6	4039	4044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574998
22	NC_018490	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
23	NC_018490	CTT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
24	NC_018490	ATC	3	9	4127	4135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
25	NC_018490	TCA	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
26	NC_018490	CTT	3	9	4183	4191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
27	NC_018490	CAA	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574998
28	NC_018490	TTC	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
29	NC_018490	TAA	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574998
30	NC_018490	TTA	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574998
31	NC_018490	GAC	2	6	4573	4578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402574998
32	NC_018490	TCT	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
33	NC_018490	TGT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402574998
34	NC_018490	TTG	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402574998
35	NC_018490	TCA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
36	NC_018490	ATT	2	6	4776	4781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574998
37	NC_018490	ATT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
38	NC_018490	TTC	2	6	5097	5102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
39	NC_018490	ATT	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
40	NC_018490	TTC	2	6	5231	5236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
41	NC_018490	CAA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574999
42	NC_018490	AAT	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
43	NC_018490	ATC	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
44	NC_018490	AAT	2	6	5663	5668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
45	NC_018490	CAT	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
46	NC_018490	TCA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
47	NC_018490	AGA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574999
48	NC_018490	AAT	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
49	NC_018490	CTA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
50	NC_018490	TCA	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
51	NC_018490	CTA	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
52	NC_018490	AGA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574999
53	NC_018490	TCA	2	6	6192	6197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
54	NC_018490	ATG	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402574999
55	NC_018490	ACT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
56	NC_018490	TAA	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
57	NC_018490	TCT	2	6	6579	6584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
58	NC_018490	CTT	2	6	6632	6637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
59	NC_018490	TAA	2	6	6715	6720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
60	NC_018490	CAA	2	6	6730	6735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574999
61	NC_018490	TTC	2	6	6743	6748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
62	NC_018490	ATT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
63	NC_018490	ATC	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
64	NC_018490	TAA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
65	NC_018490	CAT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
66	NC_018490	TTA	2	6	7233	7238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
67	NC_018490	AAT	2	6	7350	7355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575000
68	NC_018490	TAT	2	6	7414	7419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575000
69	NC_018490	AGA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575000
70	NC_018490	AGA	2	6	7670	7675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575000
71	NC_018490	TGT	2	6	8301	8306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402575001
72	NC_018490	ATC	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575001
73	NC_018490	CAC	2	6	8441	8446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402575001
74	NC_018490	CAT	2	6	8471	8476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575001
75	NC_018490	TAA	2	6	8499	8504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575001
76	NC_018490	TTC	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402575001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.