MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p06

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018489	GTT	2	6	28	33	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018489	ATT	2	6	58	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018489	ACA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018489	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558810
5	NC_018489	ACA	2	6	409	414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558810
6	NC_018489	AGA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558810
7	NC_018489	AGG	2	6	622	627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018489	AAT	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558811
9	NC_018489	GAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558811
10	NC_018489	ACT	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018489	CAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018489	TAG	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018489	TAT	2	6	1220	1225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018489	AAT	2	6	1285	1290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018489	ACT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558812
16	NC_018489	ATG	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558812
17	NC_018489	GAG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558812
18	NC_018489	AGA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
19	NC_018489	GAA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
20	NC_018489	TAA	2	6	1790	1795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558812
21	NC_018489	AGA	2	6	1862	1867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
22	NC_018489	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558812
23	NC_018489	AAG	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
24	NC_018489	GCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558812
25	NC_018489	TTA	2	6	2326	2331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558812
26	NC_018489	TCC	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018489	TTA	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018489	ATA	2	6	2812	2817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018489	TAA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018489	GAT	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018489	GCG	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018489	ATC	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018489	TAG	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018489	GTC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018489	TAG	2	6	3567	3572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018489	ATT	2	6	3587	3592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018489	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018489	TGT	2	6	3700	3705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018489	GAA	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558813
40	NC_018489	ACA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558813
41	NC_018489	CTA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558813
42	NC_018489	ATT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558813
43	NC_018489	ACA	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558813
44	NC_018489	TGT	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558813
45	NC_018489	TAA	2	6	4084	4089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558813
46	NC_018489	GGA	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018489	TCT	2	6	4200	4205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558814
48	NC_018489	TAG	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558814
49	NC_018489	CAA	2	6	4443	4448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558814
50	NC_018489	TTG	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558814
51	NC_018489	ATA	2	6	4558	4563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558814
52	NC_018489	TAT	2	6	4670	4675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
53	NC_018489	AGG	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558814
54	NC_018489	AAC	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558814
55	NC_018489	TTA	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
56	NC_018489	GTC	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558814
57	NC_018489	TTA	2	6	4867	4872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
58	NC_018489	CTT	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558814
59	NC_018489	ACT	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558814
60	NC_018489	GAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
61	NC_018489	TCT	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
62	NC_018489	TTA	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
63	NC_018489	CAA	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558815
64	NC_018489	AAT	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
65	NC_018489	TTC	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
66	NC_018489	ATG	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
67	NC_018489	TTA	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
68	NC_018489	GAA	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
69	NC_018489	AAC	2	6	6151	6156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558815
70	NC_018489	TTA	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
71	NC_018489	CGA	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558815
72	NC_018489	ATG	3	9	6388	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
73	NC_018489	TAT	2	6	6417	6422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
74	NC_018489	CAT	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
75	NC_018489	TGA	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
76	NC_018489	ATG	2	6	6526	6531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
77	NC_018489	AGA	2	6	6719	6724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
78	NC_018489	CTT	2	6	6744	6749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
79	NC_018489	ATG	3	9	6988	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
80	NC_018489	ATC	2	6	7049	7054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
81	NC_018489	CTT	3	9	7075	7083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
82	NC_018489	TAC	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
83	NC_018489	CTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
84	NC_018489	CAT	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
85	NC_018489	GAA	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
86	NC_018489	TTG	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558815
87	NC_018489	CTC	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558815
88	NC_018489	TGG	2	6	7409	7414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558815
89	NC_018489	AGA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
90	NC_018489	TAA	2	6	7468	7473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
91	NC_018489	TAA	2	6	7646	7651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
92	NC_018489	ATT	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
93	NC_018489	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
94	NC_018489	AGA	2	6	7877	7882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
95	NC_018489	CTA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018489	ACT	2	6	8213	8218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018489	ACA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018489	GTT	2	6	8472	8477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018489	TGT	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018489	ATA	2	6	8795	8800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
101	NC_018489	ATT	2	6	8807	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558816
102	NC_018489	TAA	2	6	8814	8819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
103	NC_018489	TCG	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558816
104	NC_018489	TAA	2	6	8848	8853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
105	NC_018489	ATG	2	6	8898	8903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558816
106	NC_018489	GTT	2	6	9238	9243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018489	TTA	2	6	9244	9249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018489	TGA	2	6	9353	9358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018489	GTT	3	9	9383	9391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018489	TCC	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_018489	TAT	2	6	9563	9568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018489	GCG	2	6	9670	9675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018489	CGG	2	6	9727	9732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018489	TAT	3	9	9778	9786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018489	ATA	2	6	9831	9836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018489	GTT	2	6	9950	9955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558817
117	NC_018489	ATG	2	6	10095	10100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558817
118	NC_018489	CAA	2	6	10243	10248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558817
119	NC_018489	CCA	2	6	10449	10454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018489	CTT	2	6	10521	10526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018489	GCG	2	6	10567	10572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018489	AGA	2	6	10596	10601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558818
123	NC_018489	GTT	2	6	10689	10694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
124	NC_018489	TGT	2	6	10808	10813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
125	NC_018489	GTT	2	6	10842	10847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
126	NC_018489	TTG	2	6	10906	10911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
127	NC_018489	TTA	2	6	10982	10987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558818
128	NC_018489	GTG	2	6	10995	11000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558818
129	NC_018489	GAT	2	6	11066	11071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558818
130	NC_018489	CTT	2	6	11091	11096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558818
131	NC_018489	GTT	2	6	11172	11177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558818
132	NC_018489	ATT	2	6	11182	11187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558818
133	NC_018489	CCT	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_018489	CAT	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018489	ATT	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018489	TAC	2	6	11493	11498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_018489	TAT	2	6	13967	13972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.