MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p06

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018489	GTT	2	6	28	33	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018489	ATT	2	6	58	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018489	ACA	2	6	261	266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018489	AGG	2	6	622	627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018489	ACT	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018489	CAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018489	TAG	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018489	TAT	2	6	1220	1225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018489	AAT	2	6	1285	1290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018489	TCC	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018489	TTA	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018489	ATA	2	6	2812	2817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018489	TAA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018489	GAT	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018489	GCG	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018489	ATC	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018489	TAG	2	6	3313	3318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018489	GTC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018489	TAG	2	6	3567	3572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018489	ATT	2	6	3587	3592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018489	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018489	TGT	2	6	3700	3705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018489	GGA	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018489	CTA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018489	ACT	2	6	8213	8218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018489	ACA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018489	GTT	2	6	8472	8477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018489	TGT	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018489	GTT	2	6	9238	9243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018489	TTA	2	6	9244	9249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018489	TGA	2	6	9353	9358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018489	GTT	3	9	9383	9391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018489	TCC	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018489	TAT	2	6	9563	9568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018489	GCG	2	6	9670	9675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018489	CGG	2	6	9727	9732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018489	TAT	3	9	9778	9786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018489	ATA	2	6	9831	9836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018489	CCA	2	6	10449	10454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018489	CTT	2	6	10521	10526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018489	GCG	2	6	10567	10572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018489	CCT	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018489	CAT	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018489	ATT	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018489	TAC	2	6	11493	11498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018489	GTT	2	6	11568	11573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018489	ACA	2	6	11586	11591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018489	AAG	2	6	11600	11605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018489	TTA	2	6	12324	12329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018489	AGG	2	6	12336	12341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018489	AGA	2	6	13810	13815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018489	ATA	2	6	13897	13902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018489	TAA	2	6	13960	13965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018489	TAT	2	6	13967	13972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.