MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018488	TCTG	2	8	279	286	0 %	50 %	25 %	25 %	402558330
2	NC_018488	AAAT	2	8	710	717	75 %	25 %	0 %	0 %	402558330
3	NC_018488	ATTT	2	8	1100	1107	25 %	75 %	0 %	0 %	402558331
4	NC_018488	GTAT	2	8	1787	1794	25 %	50 %	25 %	0 %	402558331
5	NC_018488	GAAT	2	8	2521	2528	50 %	25 %	25 %	0 %	402558332
6	NC_018488	TAAA	2	8	2689	2696	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
7	NC_018488	AAAT	2	8	3373	3380	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
8	NC_018488	AAAT	2	8	3566	3573	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
9	NC_018488	AGGA	2	8	3676	3683	50 %	0 %	50 %	0 %	402558332
10	NC_018488	TAAT	2	8	3955	3962	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
11	NC_018488	TAAA	2	8	4354	4361	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
12	NC_018488	TTTG	2	8	4794	4801	0 %	75 %	25 %	0 %	402558333
13	NC_018488	CCAT	2	8	5008	5015	25 %	25 %	0 %	50 %	402558333
14	NC_018488	TAAT	2	8	5142	5149	50 %	50 %	0 %	0 %	402558333
15	NC_018488	TGAA	2	8	5819	5826	50 %	25 %	25 %	0 %	402558334
16	NC_018488	TTGT	2	8	6105	6112	0 %	75 %	25 %	0 %	402558335
17	NC_018488	AACA	2	8	7989	7996	75 %	0 %	0 %	25 %	402558336
18	NC_018488	CTAA	2	8	8258	8265	50 %	25 %	0 %	25 %	402558336
19	NC_018488	CATT	2	8	9186	9193	25 %	50 %	0 %	25 %	402558337
20	NC_018488	TAAA	2	8	9214	9221	75 %	25 %	0 %	0 %	402558337
21	NC_018488	GATG	2	8	9933	9940	25 %	25 %	50 %	0 %	402558338
22	NC_018488	ATTA	2	8	10207	10214	50 %	50 %	0 %	0 %	402558339
23	NC_018488	CTTT	2	8	10536	10543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018488	AGTG	2	8	10567	10574	25 %	25 %	50 %	0 %	402558340
25	NC_018488	AACC	2	8	10820	10827	50 %	0 %	0 %	50 %	402558340
26	NC_018488	AAAG	2	8	10897	10904	75 %	0 %	25 %	0 %	402558340
27	NC_018488	AGAT	2	8	11275	11282	50 %	25 %	25 %	0 %	402558341
28	NC_018488	TATT	2	8	11373	11380	25 %	75 %	0 %	0 %	402558341
29	NC_018488	ATGA	2	8	11417	11424	50 %	25 %	25 %	0 %	402558341
30	NC_018488	TCTT	2	8	11840	11847	0 %	75 %	0 %	25 %	402558342
31	NC_018488	ATTT	2	8	12027	12034	25 %	75 %	0 %	0 %	402558342
32	NC_018488	GAAT	2	8	12367	12374	50 %	25 %	25 %	0 %	402558342
33	NC_018488	TCTT	2	8	12407	12414	0 %	75 %	0 %	25 %	402558342
34	NC_018488	TGTT	2	8	12469	12476	0 %	75 %	25 %	0 %	402558342
35	NC_018488	TACT	2	8	12815	12822	25 %	50 %	0 %	25 %	402558343
36	NC_018488	TAGT	2	8	12827	12834	25 %	50 %	25 %	0 %	402558343
37	NC_018488	TTAC	2	8	13073	13080	25 %	50 %	0 %	25 %	402558343
38	NC_018488	ATTT	2	8	13239	13246	25 %	75 %	0 %	0 %	402558344
39	NC_018488	TGAG	2	8	13339	13346	25 %	25 %	50 %	0 %	402558344
40	NC_018488	TTGT	2	8	14131	14138	0 %	75 %	25 %	0 %	402558346
41	NC_018488	ATAA	2	8	14431	14438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018488	TATT	2	8	14439	14446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018488	ATAA	2	8	14483	14490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018488	ATAA	2	8	14517	14524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018488	AGAA	2	8	14537	14544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018488	ATTT	2	8	14650	14657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018488	ATGG	2	8	14805	14812	25 %	25 %	50 %	0 %	402558348
48	NC_018488	TAAT	2	8	15080	15087	50 %	50 %	0 %	0 %	402558349
49	NC_018488	CAGA	2	8	15344	15351	50 %	0 %	25 %	25 %	402558349
50	NC_018488	AAAC	2	8	16054	16061	75 %	0 %	0 %	25 %	402558351
51	NC_018488	TTAC	2	8	16318	16325	25 %	50 %	0 %	25 %	402558351
52	NC_018488	AGAT	2	8	16436	16443	50 %	25 %	25 %	0 %	402558352
53	NC_018488	ATGG	2	8	16901	16908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018488	ATTT	2	8	16980	16987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018488	AAGC	2	8	17147	17154	50 %	0 %	25 %	25 %	402558353
56	NC_018488	TAAA	2	8	17299	17306	75 %	25 %	0 %	0 %	402558353
57	NC_018488	AAAT	2	8	17674	17681	75 %	25 %	0 %	0 %	402558354
58	NC_018488	TAAA	2	8	17959	17966	75 %	25 %	0 %	0 %	402558355
59	NC_018488	TTTC	2	8	18002	18009	0 %	75 %	0 %	25 %	402558355
60	NC_018488	TCTA	2	8	18043	18050	25 %	50 %	0 %	25 %	402558355
61	NC_018488	AAGT	2	8	18083	18090	50 %	25 %	25 %	0 %	402558355
62	NC_018488	AGAA	2	8	18332	18339	75 %	0 %	25 %	0 %	402558355
63	NC_018488	AATT	2	8	18361	18368	50 %	50 %	0 %	0 %	402558355
64	NC_018488	TAAT	2	8	18511	18518	50 %	50 %	0 %	0 %	402558355
65	NC_018488	AAAT	2	8	18633	18640	75 %	25 %	0 %	0 %	402558355
66	NC_018488	GATG	2	8	18736	18743	25 %	25 %	50 %	0 %	402558356
67	NC_018488	CTTT	2	8	18821	18828	0 %	75 %	0 %	25 %	402558356
68	NC_018488	GGAA	2	8	19018	19025	50 %	0 %	50 %	0 %	402558356
69	NC_018488	GAAC	2	8	19623	19630	50 %	0 %	25 %	25 %	402558357
70	NC_018488	AATT	2	8	20306	20313	50 %	50 %	0 %	0 %	402558358
71	NC_018488	AAAT	2	8	20899	20906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018488	AATT	3	12	21105	21116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018488	ATTT	2	8	21194	21201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018488	AGTA	2	8	21579	21586	50 %	25 %	25 %	0 %	402558359
75	NC_018488	AAGG	2	8	21732	21739	50 %	0 %	50 %	0 %	402558359
76	NC_018488	CTTA	2	8	22001	22008	25 %	50 %	0 %	25 %	402558359
77	NC_018488	GAAA	2	8	22203	22210	75 %	0 %	25 %	0 %	402558359
78	NC_018488	AGGA	2	8	22318	22325	50 %	0 %	50 %	0 %	402558359
79	NC_018488	TGAT	2	8	22438	22445	25 %	50 %	25 %	0 %	402558359
80	NC_018488	GAAA	2	8	22876	22883	75 %	0 %	25 %	0 %	402558359
81	NC_018488	CAAA	2	8	23145	23152	75 %	0 %	0 %	25 %	402558359
82	NC_018488	ATAG	2	8	23190	23197	50 %	25 %	25 %	0 %	402558359
83	NC_018488	TTCT	2	8	23305	23312	0 %	75 %	0 %	25 %	402558359
84	NC_018488	AGCT	2	8	23317	23324	25 %	25 %	25 %	25 %	402558359
85	NC_018488	GTCA	2	8	23500	23507	25 %	25 %	25 %	25 %	402558360
86	NC_018488	AGGT	2	8	23852	23859	25 %	25 %	50 %	0 %	402558360
87	NC_018488	CTCC	2	8	24369	24376	0 %	25 %	0 %	75 %	402558360
88	NC_018488	AAAG	2	8	24765	24772	75 %	0 %	25 %	0 %	402558360
89	NC_018488	ATTG	2	8	25285	25292	25 %	50 %	25 %	0 %	402558361
90	NC_018488	TTTA	2	8	25300	25307	25 %	75 %	0 %	0 %	402558361
91	NC_018488	GATT	2	8	26138	26145	25 %	50 %	25 %	0 %	402558361
92	NC_018488	TGCT	2	8	26986	26993	0 %	50 %	25 %	25 %	402558361
93	NC_018488	TTTG	2	8	27020	27027	0 %	75 %	25 %	0 %	402558361
94	NC_018488	CATA	2	8	27453	27460	50 %	25 %	0 %	25 %	402558361
95	NC_018488	CCAG	2	8	27745	27752	25 %	0 %	25 %	50 %	402558361
96	NC_018488	TCGA	2	8	28228	28235	25 %	25 %	25 %	25 %	402558362
97	NC_018488	TCAT	2	8	28343	28350	25 %	50 %	0 %	25 %	402558362
98	NC_018488	GATA	2	8	28354	28361	50 %	25 %	25 %	0 %	402558362
99	NC_018488	TATT	2	8	28851	28858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018488	TTAA	2	8	29226	29233	50 %	50 %	0 %	0 %	402558363
101	NC_018488	GAAG	2	8	29283	29290	50 %	0 %	50 %	0 %	402558363
102	NC_018488	CAAA	2	8	29993	30000	75 %	0 %	0 %	25 %	402558364
103	NC_018488	GATA	2	8	30107	30114	50 %	25 %	25 %	0 %	402558364
104	NC_018488	GAAT	2	8	30299	30306	50 %	25 %	25 %	0 %	402558365
105	NC_018488	AGTC	2	8	30321	30328	25 %	25 %	25 %	25 %	402558365
106	NC_018488	ACTT	2	8	31152	31159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018488	AAAT	2	8	31731	31738	75 %	25 %	0 %	0 %	402558366
108	NC_018488	AGTA	2	8	32258	32265	50 %	25 %	25 %	0 %	402558366
109	NC_018488	AGAA	2	8	32288	32295	75 %	0 %	25 %	0 %	402558366
110	NC_018488	TCTA	2	8	32379	32386	25 %	50 %	0 %	25 %	402558367
111	NC_018488	AACA	2	8	33092	33099	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018488	ATAA	2	8	33353	33360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018488	ATAA	2	8	33463	33470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018488	ATGA	2	8	33547	33554	50 %	25 %	25 %	0 %	402558369
115	NC_018488	TAAT	2	8	33779	33786	50 %	50 %	0 %	0 %	402558369
116	NC_018488	AGGA	2	8	33973	33980	50 %	0 %	50 %	0 %	402558370
117	NC_018488	AAAG	2	8	34103	34110	75 %	0 %	25 %	0 %	402558370
118	NC_018488	AACA	2	8	34214	34221	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018488	AACA	2	8	34653	34660	75 %	0 %	0 %	25 %	402558371
120	NC_018488	CAAT	2	8	35457	35464	50 %	25 %	0 %	25 %	402558373
121	NC_018488	ATAA	2	8	35706	35713	75 %	25 %	0 %	0 %	402558373
122	NC_018488	GTTG	2	8	35835	35842	0 %	50 %	50 %	0 %	402558374
123	NC_018488	GTTT	2	8	35907	35914	0 %	75 %	25 %	0 %	402558374
124	NC_018488	AATT	2	8	36199	36206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018488	ATTT	2	8	36379	36386	25 %	75 %	0 %	0 %	402558375
126	NC_018488	AATA	2	8	36602	36609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018488	GTAT	2	8	36655	36662	25 %	50 %	25 %	0 %	402558376
128	NC_018488	ATAA	2	8	36753	36760	75 %	25 %	0 %	0 %	402558376
129	NC_018488	GAAA	2	8	37112	37119	75 %	0 %	25 %	0 %	402558376
130	NC_018488	ATTC	2	8	38113	38120	25 %	50 %	0 %	25 %	402558377
131	NC_018488	TGAT	2	8	38688	38695	25 %	50 %	25 %	0 %	402558377
132	NC_018488	CACC	2	8	38765	38772	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_018488	TTTA	2	8	38890	38897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018488	AAGG	2	8	39294	39301	50 %	0 %	50 %	0 %	402558378
135	NC_018488	AAAT	2	8	40095	40102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018488	ATTT	2	8	40110	40117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018488	ATTA	2	8	40343	40350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018488	TTTA	2	8	40367	40374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018488	AGGC	2	8	40783	40790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018488	GTTT	2	8	41009	41016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018488	TTTA	2	8	41157	41164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018488	ATAA	2	8	41173	41180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018488	ATGT	2	8	41689	41696	25 %	50 %	25 %	0 %	402558380
144	NC_018488	AAAT	2	8	41863	41870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018488	ATAA	3	12	41916	41927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018488	CATA	2	8	42417	42424	50 %	25 %	0 %	25 %	402558382
147	NC_018488	CAAA	2	8	42793	42800	75 %	0 %	0 %	25 %	402558383
148	NC_018488	GTTC	2	8	42813	42820	0 %	50 %	25 %	25 %	402558383
149	NC_018488	TGAT	2	8	42957	42964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018488	AAAT	2	8	43111	43118	75 %	25 %	0 %	0 %	402558384
151	NC_018488	GAAA	2	8	43473	43480	75 %	0 %	25 %	0 %	402558384
152	NC_018488	AATT	2	8	43570	43577	50 %	50 %	0 %	0 %	402558384
153	NC_018488	AAAT	2	8	43728	43735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018488	ATCC	2	8	43842	43849	25 %	25 %	0 %	50 %	402558385
155	NC_018488	TTTG	2	8	44249	44256	0 %	75 %	25 %	0 %	402558385
156	NC_018488	CTTC	2	8	44313	44320	0 %	50 %	0 %	50 %	402558385
157	NC_018488	TTTA	2	8	44824	44831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018488	ATTT	2	8	44966	44973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018488	AGGA	2	8	45883	45890	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
160	NC_018488	TATT	2	8	46186	46193	25 %	75 %	0 %	0 %	402558386
161	NC_018488	ATGA	2	8	46320	46327	50 %	25 %	25 %	0 %	402558386
162	NC_018488	TTAT	2	8	46505	46512	25 %	75 %	0 %	0 %	402558386
163	NC_018488	GTTT	2	8	46962	46969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018488	TTTA	2	8	47012	47019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018488	TATG	2	8	47318	47325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018488	AAAC	2	8	47499	47506	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
167	NC_018488	TAAG	2	8	47665	47672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018488	TGAA	2	8	48842	48849	50 %	25 %	25 %	0 %	402558389
169	NC_018488	AATG	2	8	49353	49360	50 %	25 %	25 %	0 %	402558389
170	NC_018488	CTTT	2	8	49496	49503	0 %	75 %	0 %	25 %	402558389
171	NC_018488	TAAA	2	8	49517	49524	75 %	25 %	0 %	0 %	402558389
172	NC_018488	ATGG	2	8	49783	49790	25 %	25 %	50 %	0 %	402558389
173	NC_018488	TAAA	2	8	50009	50016	75 %	25 %	0 %	0 %	402558389
174	NC_018488	AATT	2	8	50222	50229	50 %	50 %	0 %	0 %	402558390
175	NC_018488	TAAT	2	8	50939	50946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018488	AATG	2	8	51254	51261	50 %	25 %	25 %	0 %	402558391
177	NC_018488	TGAT	2	8	51276	51283	25 %	50 %	25 %	0 %	402558391
178	NC_018488	AGTT	2	8	51464	51471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
179	NC_018488	AGGC	2	8	51811	51818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
180	NC_018488	ATGG	2	8	52076	52083	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018488	AAAC	2	8	52104	52111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_018488	GTTT	2	8	52126	52133	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018488	TTAT	2	8	52243	52250	25 %	75 %	0 %	0 %	402558392
184	NC_018488	TCTT	2	8	52527	52534	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_018488	AATA	2	8	52551	52558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018488	TTTA	2	8	53318	53325	25 %	75 %	0 %	0 %	402558394
187	NC_018488	ATGA	2	8	53830	53837	50 %	25 %	25 %	0 %	402558394
188	NC_018488	TTAT	2	8	54165	54172	25 %	75 %	0 %	0 %	402558394
189	NC_018488	GAAA	2	8	54231	54238	75 %	0 %	25 %	0 %	402558394
190	NC_018488	TGGA	2	8	54873	54880	25 %	25 %	50 %	0 %	402558394
191	NC_018488	GAAC	2	8	55346	55353	50 %	0 %	25 %	25 %	402558394
192	NC_018488	TAAA	2	8	55589	55596	75 %	25 %	0 %	0 %	402558394
193	NC_018488	TTTA	2	8	55910	55917	25 %	75 %	0 %	0 %	402558395
194	NC_018488	TTTA	2	8	56008	56015	25 %	75 %	0 %	0 %	402558395
195	NC_018488	GAAA	2	8	56060	56067	75 %	0 %	25 %	0 %	402558395
196	NC_018488	ACAT	2	8	56279	56286	50 %	25 %	0 %	25 %	402558395
197	NC_018488	TTAT	2	8	56326	56333	25 %	75 %	0 %	0 %	402558395
198	NC_018488	AAAG	2	8	56669	56676	75 %	0 %	25 %	0 %	402558395
199	NC_018488	ATTG	2	8	56786	56793	25 %	50 %	25 %	0 %	402558395
200	NC_018488	AGTT	2	8	57058	57065	25 %	50 %	25 %	0 %	402558395
201	NC_018488	AAAG	2	8	57575	57582	75 %	0 %	25 %	0 %	402558395
202	NC_018488	AAAG	2	8	57747	57754	75 %	0 %	25 %	0 %	402558395
203	NC_018488	GAAA	2	8	57788	57795	75 %	0 %	25 %	0 %	402558396
204	NC_018488	TTAA	2	8	58134	58141	50 %	50 %	0 %	0 %	402558396
205	NC_018488	GAAT	2	8	58392	58399	50 %	25 %	25 %	0 %	402558397
206	NC_018488	ATGG	2	8	60939	60946	25 %	25 %	50 %	0 %	402558400
207	NC_018488	ATTG	2	8	60954	60961	25 %	50 %	25 %	0 %	402558400
208	NC_018488	ATCT	2	8	61366	61373	25 %	50 %	0 %	25 %	402558400
209	NC_018488	ATAC	2	8	61836	61843	50 %	25 %	0 %	25 %	402558400
210	NC_018488	TATT	2	8	61873	61880	25 %	75 %	0 %	0 %	402558400
211	NC_018488	ATTA	2	8	61928	61935	50 %	50 %	0 %	0 %	402558400
212	NC_018488	GTTT	2	8	62010	62017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
213	NC_018488	ACAA	2	8	62390	62397	75 %	0 %	0 %	25 %	402558401
214	NC_018488	AAAC	2	8	62420	62427	75 %	0 %	0 %	25 %	402558401
215	NC_018488	GATG	2	8	62593	62600	25 %	25 %	50 %	0 %	402558401
216	NC_018488	AGAA	2	8	62622	62629	75 %	0 %	25 %	0 %	402558401
217	NC_018488	AATT	2	8	62733	62740	50 %	50 %	0 %	0 %	402558401
218	NC_018488	GAAT	2	8	63066	63073	50 %	25 %	25 %	0 %	402558401
219	NC_018488	TAAA	2	8	63372	63379	75 %	25 %	0 %	0 %	402558401
220	NC_018488	TTAT	3	12	63645	63656	25 %	75 %	0 %	0 %	402558402
221	NC_018488	AATG	2	8	63732	63739	50 %	25 %	25 %	0 %	402558402
222	NC_018488	AGAA	2	8	63828	63835	75 %	0 %	25 %	0 %	402558402
223	NC_018488	GGAT	2	8	64075	64082	25 %	25 %	50 %	0 %	402558403
224	NC_018488	AAGC	2	8	64182	64189	50 %	0 %	25 %	25 %	402558403
225	NC_018488	GATA	2	8	64322	64329	50 %	25 %	25 %	0 %	402558403
226	NC_018488	AAGA	2	8	65340	65347	75 %	0 %	25 %	0 %	402558403

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.