MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018488	TCTG	2	8	279	286	0 %	50 %	25 %	25 %	402558330
2	NC_018488	AAAT	2	8	710	717	75 %	25 %	0 %	0 %	402558330
3	NC_018488	ATTT	2	8	1100	1107	25 %	75 %	0 %	0 %	402558331
4	NC_018488	GTAT	2	8	1787	1794	25 %	50 %	25 %	0 %	402558331
5	NC_018488	GAAT	2	8	2521	2528	50 %	25 %	25 %	0 %	402558332
6	NC_018488	TAAA	2	8	2689	2696	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
7	NC_018488	AAAT	2	8	3373	3380	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
8	NC_018488	AAAT	2	8	3566	3573	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
9	NC_018488	AGGA	2	8	3676	3683	50 %	0 %	50 %	0 %	402558332
10	NC_018488	TAAT	2	8	3955	3962	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
11	NC_018488	TAAA	2	8	4354	4361	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
12	NC_018488	TTTG	2	8	4794	4801	0 %	75 %	25 %	0 %	402558333
13	NC_018488	CCAT	2	8	5008	5015	25 %	25 %	0 %	50 %	402558333
14	NC_018488	TAAT	2	8	5142	5149	50 %	50 %	0 %	0 %	402558333
15	NC_018488	TGAA	2	8	5819	5826	50 %	25 %	25 %	0 %	402558334
16	NC_018488	TTGT	2	8	6105	6112	0 %	75 %	25 %	0 %	402558335
17	NC_018488	AACA	2	8	7989	7996	75 %	0 %	0 %	25 %	402558336
18	NC_018488	CTAA	2	8	8258	8265	50 %	25 %	0 %	25 %	402558336
19	NC_018488	CATT	2	8	9186	9193	25 %	50 %	0 %	25 %	402558337
20	NC_018488	TAAA	2	8	9214	9221	75 %	25 %	0 %	0 %	402558337
21	NC_018488	GATG	2	8	9933	9940	25 %	25 %	50 %	0 %	402558338
22	NC_018488	ATTA	2	8	10207	10214	50 %	50 %	0 %	0 %	402558339
23	NC_018488	AGTG	2	8	10567	10574	25 %	25 %	50 %	0 %	402558340
24	NC_018488	AACC	2	8	10820	10827	50 %	0 %	0 %	50 %	402558340
25	NC_018488	AAAG	2	8	10897	10904	75 %	0 %	25 %	0 %	402558340
26	NC_018488	AGAT	2	8	11275	11282	50 %	25 %	25 %	0 %	402558341
27	NC_018488	TATT	2	8	11373	11380	25 %	75 %	0 %	0 %	402558341
28	NC_018488	ATGA	2	8	11417	11424	50 %	25 %	25 %	0 %	402558341
29	NC_018488	TCTT	2	8	11840	11847	0 %	75 %	0 %	25 %	402558342
30	NC_018488	ATTT	2	8	12027	12034	25 %	75 %	0 %	0 %	402558342
31	NC_018488	GAAT	2	8	12367	12374	50 %	25 %	25 %	0 %	402558342
32	NC_018488	TCTT	2	8	12407	12414	0 %	75 %	0 %	25 %	402558342
33	NC_018488	TGTT	2	8	12469	12476	0 %	75 %	25 %	0 %	402558342
34	NC_018488	TACT	2	8	12815	12822	25 %	50 %	0 %	25 %	402558343
35	NC_018488	TAGT	2	8	12827	12834	25 %	50 %	25 %	0 %	402558343
36	NC_018488	TTAC	2	8	13073	13080	25 %	50 %	0 %	25 %	402558343
37	NC_018488	ATTT	2	8	13239	13246	25 %	75 %	0 %	0 %	402558344
38	NC_018488	TGAG	2	8	13339	13346	25 %	25 %	50 %	0 %	402558344
39	NC_018488	TTGT	2	8	14131	14138	0 %	75 %	25 %	0 %	402558346
40	NC_018488	ATGG	2	8	14805	14812	25 %	25 %	50 %	0 %	402558348
41	NC_018488	TAAT	2	8	15080	15087	50 %	50 %	0 %	0 %	402558349
42	NC_018488	CAGA	2	8	15344	15351	50 %	0 %	25 %	25 %	402558349
43	NC_018488	AAAC	2	8	16054	16061	75 %	0 %	0 %	25 %	402558351
44	NC_018488	TTAC	2	8	16318	16325	25 %	50 %	0 %	25 %	402558351
45	NC_018488	AGAT	2	8	16436	16443	50 %	25 %	25 %	0 %	402558352
46	NC_018488	AAGC	2	8	17147	17154	50 %	0 %	25 %	25 %	402558353
47	NC_018488	TAAA	2	8	17299	17306	75 %	25 %	0 %	0 %	402558353
48	NC_018488	AAAT	2	8	17674	17681	75 %	25 %	0 %	0 %	402558354
49	NC_018488	TAAA	2	8	17959	17966	75 %	25 %	0 %	0 %	402558355
50	NC_018488	TTTC	2	8	18002	18009	0 %	75 %	0 %	25 %	402558355
51	NC_018488	TCTA	2	8	18043	18050	25 %	50 %	0 %	25 %	402558355
52	NC_018488	AAGT	2	8	18083	18090	50 %	25 %	25 %	0 %	402558355
53	NC_018488	AGAA	2	8	18332	18339	75 %	0 %	25 %	0 %	402558355
54	NC_018488	AATT	2	8	18361	18368	50 %	50 %	0 %	0 %	402558355
55	NC_018488	TAAT	2	8	18511	18518	50 %	50 %	0 %	0 %	402558355
56	NC_018488	AAAT	2	8	18633	18640	75 %	25 %	0 %	0 %	402558355
57	NC_018488	GATG	2	8	18736	18743	25 %	25 %	50 %	0 %	402558356
58	NC_018488	CTTT	2	8	18821	18828	0 %	75 %	0 %	25 %	402558356
59	NC_018488	GGAA	2	8	19018	19025	50 %	0 %	50 %	0 %	402558356
60	NC_018488	GAAC	2	8	19623	19630	50 %	0 %	25 %	25 %	402558357
61	NC_018488	AATT	2	8	20306	20313	50 %	50 %	0 %	0 %	402558358
62	NC_018488	AGTA	2	8	21579	21586	50 %	25 %	25 %	0 %	402558359
63	NC_018488	AAGG	2	8	21732	21739	50 %	0 %	50 %	0 %	402558359
64	NC_018488	CTTA	2	8	22001	22008	25 %	50 %	0 %	25 %	402558359
65	NC_018488	GAAA	2	8	22203	22210	75 %	0 %	25 %	0 %	402558359
66	NC_018488	AGGA	2	8	22318	22325	50 %	0 %	50 %	0 %	402558359
67	NC_018488	TGAT	2	8	22438	22445	25 %	50 %	25 %	0 %	402558359
68	NC_018488	GAAA	2	8	22876	22883	75 %	0 %	25 %	0 %	402558359
69	NC_018488	CAAA	2	8	23145	23152	75 %	0 %	0 %	25 %	402558359
70	NC_018488	ATAG	2	8	23190	23197	50 %	25 %	25 %	0 %	402558359
71	NC_018488	TTCT	2	8	23305	23312	0 %	75 %	0 %	25 %	402558359
72	NC_018488	AGCT	2	8	23317	23324	25 %	25 %	25 %	25 %	402558359
73	NC_018488	GTCA	2	8	23500	23507	25 %	25 %	25 %	25 %	402558360
74	NC_018488	AGGT	2	8	23852	23859	25 %	25 %	50 %	0 %	402558360
75	NC_018488	CTCC	2	8	24369	24376	0 %	25 %	0 %	75 %	402558360
76	NC_018488	AAAG	2	8	24765	24772	75 %	0 %	25 %	0 %	402558360
77	NC_018488	ATTG	2	8	25285	25292	25 %	50 %	25 %	0 %	402558361
78	NC_018488	TTTA	2	8	25300	25307	25 %	75 %	0 %	0 %	402558361
79	NC_018488	GATT	2	8	26138	26145	25 %	50 %	25 %	0 %	402558361
80	NC_018488	TGCT	2	8	26986	26993	0 %	50 %	25 %	25 %	402558361
81	NC_018488	TTTG	2	8	27020	27027	0 %	75 %	25 %	0 %	402558361
82	NC_018488	CATA	2	8	27453	27460	50 %	25 %	0 %	25 %	402558361
83	NC_018488	CCAG	2	8	27745	27752	25 %	0 %	25 %	50 %	402558361
84	NC_018488	TCGA	2	8	28228	28235	25 %	25 %	25 %	25 %	402558362
85	NC_018488	TCAT	2	8	28343	28350	25 %	50 %	0 %	25 %	402558362
86	NC_018488	GATA	2	8	28354	28361	50 %	25 %	25 %	0 %	402558362
87	NC_018488	TTAA	2	8	29226	29233	50 %	50 %	0 %	0 %	402558363
88	NC_018488	GAAG	2	8	29283	29290	50 %	0 %	50 %	0 %	402558363
89	NC_018488	CAAA	2	8	29993	30000	75 %	0 %	0 %	25 %	402558364
90	NC_018488	GATA	2	8	30107	30114	50 %	25 %	25 %	0 %	402558364
91	NC_018488	GAAT	2	8	30299	30306	50 %	25 %	25 %	0 %	402558365
92	NC_018488	AGTC	2	8	30321	30328	25 %	25 %	25 %	25 %	402558365
93	NC_018488	AAAT	2	8	31731	31738	75 %	25 %	0 %	0 %	402558366
94	NC_018488	AGTA	2	8	32258	32265	50 %	25 %	25 %	0 %	402558366
95	NC_018488	AGAA	2	8	32288	32295	75 %	0 %	25 %	0 %	402558366
96	NC_018488	TCTA	2	8	32379	32386	25 %	50 %	0 %	25 %	402558367
97	NC_018488	ATGA	2	8	33547	33554	50 %	25 %	25 %	0 %	402558369
98	NC_018488	TAAT	2	8	33779	33786	50 %	50 %	0 %	0 %	402558369
99	NC_018488	AGGA	2	8	33973	33980	50 %	0 %	50 %	0 %	402558370
100	NC_018488	AAAG	2	8	34103	34110	75 %	0 %	25 %	0 %	402558370
101	NC_018488	AACA	2	8	34653	34660	75 %	0 %	0 %	25 %	402558371
102	NC_018488	CAAT	2	8	35457	35464	50 %	25 %	0 %	25 %	402558373
103	NC_018488	ATAA	2	8	35706	35713	75 %	25 %	0 %	0 %	402558373
104	NC_018488	GTTG	2	8	35835	35842	0 %	50 %	50 %	0 %	402558374
105	NC_018488	GTTT	2	8	35907	35914	0 %	75 %	25 %	0 %	402558374
106	NC_018488	ATTT	2	8	36379	36386	25 %	75 %	0 %	0 %	402558375
107	NC_018488	GTAT	2	8	36655	36662	25 %	50 %	25 %	0 %	402558376
108	NC_018488	ATAA	2	8	36753	36760	75 %	25 %	0 %	0 %	402558376
109	NC_018488	GAAA	2	8	37112	37119	75 %	0 %	25 %	0 %	402558376
110	NC_018488	ATTC	2	8	38113	38120	25 %	50 %	0 %	25 %	402558377
111	NC_018488	TGAT	2	8	38688	38695	25 %	50 %	25 %	0 %	402558377
112	NC_018488	AAGG	2	8	39294	39301	50 %	0 %	50 %	0 %	402558378
113	NC_018488	ATGT	2	8	41689	41696	25 %	50 %	25 %	0 %	402558380
114	NC_018488	CATA	2	8	42417	42424	50 %	25 %	0 %	25 %	402558382
115	NC_018488	CAAA	2	8	42793	42800	75 %	0 %	0 %	25 %	402558383
116	NC_018488	GTTC	2	8	42813	42820	0 %	50 %	25 %	25 %	402558383
117	NC_018488	AAAT	2	8	43111	43118	75 %	25 %	0 %	0 %	402558384
118	NC_018488	GAAA	2	8	43473	43480	75 %	0 %	25 %	0 %	402558384
119	NC_018488	AATT	2	8	43570	43577	50 %	50 %	0 %	0 %	402558384
120	NC_018488	ATCC	2	8	43842	43849	25 %	25 %	0 %	50 %	402558385
121	NC_018488	TTTG	2	8	44249	44256	0 %	75 %	25 %	0 %	402558385
122	NC_018488	CTTC	2	8	44313	44320	0 %	50 %	0 %	50 %	402558385
123	NC_018488	AGGA	2	8	45883	45890	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
124	NC_018488	TATT	2	8	46186	46193	25 %	75 %	0 %	0 %	402558386
125	NC_018488	ATGA	2	8	46320	46327	50 %	25 %	25 %	0 %	402558386
126	NC_018488	TTAT	2	8	46505	46512	25 %	75 %	0 %	0 %	402558386
127	NC_018488	TGAA	2	8	48842	48849	50 %	25 %	25 %	0 %	402558389
128	NC_018488	AATG	2	8	49353	49360	50 %	25 %	25 %	0 %	402558389
129	NC_018488	CTTT	2	8	49496	49503	0 %	75 %	0 %	25 %	402558389
130	NC_018488	TAAA	2	8	49517	49524	75 %	25 %	0 %	0 %	402558389
131	NC_018488	ATGG	2	8	49783	49790	25 %	25 %	50 %	0 %	402558389
132	NC_018488	TAAA	2	8	50009	50016	75 %	25 %	0 %	0 %	402558389
133	NC_018488	AATT	2	8	50222	50229	50 %	50 %	0 %	0 %	402558390
134	NC_018488	AATG	2	8	51254	51261	50 %	25 %	25 %	0 %	402558391
135	NC_018488	TGAT	2	8	51276	51283	25 %	50 %	25 %	0 %	402558391
136	NC_018488	TTAT	2	8	52243	52250	25 %	75 %	0 %	0 %	402558392
137	NC_018488	TTTA	2	8	53318	53325	25 %	75 %	0 %	0 %	402558394
138	NC_018488	ATGA	2	8	53830	53837	50 %	25 %	25 %	0 %	402558394
139	NC_018488	TTAT	2	8	54165	54172	25 %	75 %	0 %	0 %	402558394
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.