MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018488	ATT	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018488	ATT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018488	TAA	2	6	98	103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018488	AGT	2	6	145	150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018488	AAT	2	6	756	761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018488	AGG	2	6	772	777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018488	TCT	2	6	2102	2107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018488	TAA	2	6	10156	10161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018488	ATT	2	6	10175	10180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018488	AAT	2	6	10487	10492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018488	TAT	2	6	10523	10528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018488	AGG	2	6	10552	10557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018488	AAT	2	6	11490	11495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018488	AGA	2	6	11616	11621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018488	GAA	2	6	11715	11720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018488	ATT	2	6	12564	12569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018488	TCC	2	6	13477	13482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018488	ATC	2	6	13777	13782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018488	ATA	3	9	13822	13830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018488	GGA	2	6	14851	14856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018488	TTC	2	6	14897	14902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018488	AAT	2	6	14929	14934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018488	ATT	2	6	15587	15592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018488	AGG	2	6	16367	16372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018488	TGA	2	6	16840	16845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018488	TGT	2	6	16862	16867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018488	TAA	2	6	16881	16886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018488	AAC	2	6	16922	16927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018488	ATA	2	6	16949	16954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018488	AGA	2	6	16993	16998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018488	AAT	3	9	17111	17119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018488	TTC	2	6	19119	19124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018488	TAA	2	6	19171	19176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018488	GAA	2	6	19195	19200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018488	ATT	2	6	19803	19808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018488	TTA	2	6	19838	19843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018488	GTA	2	6	20858	20863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018488	TAC	2	6	20880	20885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018488	GAA	2	6	20939	20944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018488	AAT	2	6	21065	21070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018488	ATT	2	6	21322	21327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018488	TTA	2	6	21331	21336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018488	AGG	2	6	21377	21382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018488	TCC	2	6	28816	28821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018488	ACA	2	6	28916	28921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018488	TGT	2	6	28934	28939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018488	ATT	2	6	28940	28945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018488	ATT	2	6	31011	31016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018488	TAA	2	6	31146	31151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018488	GTA	2	6	31180	31185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018488	AAT	2	6	33012	33017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018488	ATA	2	6	33032	33037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018488	TAT	2	6	33320	33325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018488	TTA	2	6	33434	33439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018488	TAT	2	6	33489	33494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018488	AAG	2	6	34853	34858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018488	ATA	2	6	35299	35304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018488	GGA	2	6	35326	35331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018488	ATA	2	6	36546	36551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018488	TTA	2	6	36554	36559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018488	GGT	2	6	36647	36652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018488	GAT	2	6	38776	38781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018488	AAG	2	6	38801	38806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018488	CTT	2	6	38824	38829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018488	TCT	2	6	39002	39007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018488	GAA	2	6	40049	40054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018488	TTG	2	6	40291	40296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018488	CGG	2	6	40512	40517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018488	TAT	2	6	40735	40740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018488	TCC	2	6	40853	40858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018488	TTA	2	6	40945	40950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018488	TGG	2	6	41022	41027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018488	AGA	2	6	41073	41078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018488	GTT	2	6	41085	41090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018488	TAT	2	6	41145	41150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018488	ATT	2	6	41878	41883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018488	TTA	2	6	42943	42948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018488	CTA	2	6	42951	42956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018488	GGT	2	6	43063	43068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018488	ATA	2	6	43748	43753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018488	TTA	2	6	43761	43766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018488	CCT	2	6	44539	44544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018488	ACA	2	6	44558	44563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018488	TTA	2	6	44584	44589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018488	TAA	2	6	44703	44708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018488	TGA	2	6	44789	44794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018488	AAC	2	6	44797	44802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018488	GAT	2	6	44921	44926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018488	TAT	2	6	44934	44939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018488	GTT	2	6	44983	44988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018488	ATA	2	6	45005	45010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018488	GAT	2	6	45057	45062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018488	CAT	2	6	45071	45076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018488	CAT	2	6	45078	45083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018488	AGT	2	6	45084	45089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018488	CAT	3	9	45134	45142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018488	GTT	2	6	45248	45253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018488	CTG	2	6	45256	45261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018488	AAC	2	6	45275	45280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018488	GTT	2	6	45289	45294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018488	GTT	2	6	47049	47054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018488	ATT	2	6	47114	47119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018488	AAC	2	6	47256	47261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018488	ATT	2	6	47332	47337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018488	GTA	3	9	47650	47658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018488	TAC	2	6	47688	47693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018488	AGA	2	6	48590	48595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018488	AAT	2	6	48633	48638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018488	ACT	2	6	48657	48662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018488	ATT	2	6	48716	48721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018488	AGG	2	6	48749	48754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018488	CTT	2	6	50053	50058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018488	GTG	2	6	50083	50088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018488	ATA	2	6	50759	50764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018488	AAC	2	6	50783	50788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018488	CTG	2	6	50892	50897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018488	TAG	2	6	51489	51494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018488	TAT	2	6	51763	51768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018488	TCC	2	6	51881	51886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018488	TTA	2	6	51973	51978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018488	CTG	2	6	52040	52045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018488	TCT	2	6	52161	52166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018488	AAG	2	6	52179	52184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018488	TAA	2	6	52743	52748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018488	CAA	2	6	52809	52814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018488	AAG	2	6	53280	53285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018488	ATT	2	6	62027	62032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018488	ACT	2	6	62033	62038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.