MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018488	AT	3	6	89	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018488	AT	3	6	196	201	50 %	50 %	0 %	0 %	402558330
3	NC_018488	TG	3	6	321	326	0 %	50 %	50 %	0 %	402558330
4	NC_018488	GA	3	6	360	365	50 %	0 %	50 %	0 %	402558330
5	NC_018488	TA	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
6	NC_018488	CT	3	6	3359	3364	0 %	50 %	0 %	50 %	402558332
7	NC_018488	TA	3	6	3824	3829	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
8	NC_018488	AT	4	8	4985	4992	50 %	50 %	0 %	0 %	402558333
9	NC_018488	AG	3	6	5973	5978	50 %	0 %	50 %	0 %	402558334
10	NC_018488	AT	3	6	6502	6507	50 %	50 %	0 %	0 %	402558335
11	NC_018488	AT	3	6	6536	6541	50 %	50 %	0 %	0 %	402558335
12	NC_018488	AT	3	6	7660	7665	50 %	50 %	0 %	0 %	402558336
13	NC_018488	TA	3	6	7944	7949	50 %	50 %	0 %	0 %	402558336
14	NC_018488	TA	3	6	8449	8454	50 %	50 %	0 %	0 %	402558337
15	NC_018488	AT	3	6	8982	8987	50 %	50 %	0 %	0 %	402558337
16	NC_018488	AT	3	6	9292	9297	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
17	NC_018488	AT	3	6	9354	9359	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
18	NC_018488	TA	3	6	9564	9569	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
19	NC_018488	TA	3	6	9859	9864	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
20	NC_018488	AT	3	6	10047	10052	50 %	50 %	0 %	0 %	402558338
21	NC_018488	TA	3	6	10653	10658	50 %	50 %	0 %	0 %	402558340
22	NC_018488	AT	3	6	12783	12788	50 %	50 %	0 %	0 %	402558343
23	NC_018488	TC	4	8	13106	13113	0 %	50 %	0 %	50 %	402558344
24	NC_018488	TG	3	6	13324	13329	0 %	50 %	50 %	0 %	402558344
25	NC_018488	AT	3	6	13468	13473	50 %	50 %	0 %	0 %	402558344
26	NC_018488	AT	3	6	13803	13808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018488	AT	3	6	13811	13816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018488	AT	3	6	13897	13902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018488	TA	3	6	14024	14029	50 %	50 %	0 %	0 %	402558346
30	NC_018488	AT	3	6	14125	14130	50 %	50 %	0 %	0 %	402558346
31	NC_018488	AT	3	6	14232	14237	50 %	50 %	0 %	0 %	402558347
32	NC_018488	AT	3	6	14634	14639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018488	GA	3	6	14663	14668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018488	TG	3	6	14943	14948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018488	GA	3	6	15013	15018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018488	TG	3	6	15557	15562	0 %	50 %	50 %	0 %	402558349
37	NC_018488	GA	3	6	15636	15641	50 %	0 %	50 %	0 %	402558350
38	NC_018488	AG	3	6	16500	16505	50 %	0 %	50 %	0 %	402558352
39	NC_018488	GA	3	6	16802	16807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018488	TA	3	6	17130	17135	50 %	50 %	0 %	0 %	402558353
41	NC_018488	TA	3	6	18058	18063	50 %	50 %	0 %	0 %	402558355
42	NC_018488	AT	3	6	18073	18078	50 %	50 %	0 %	0 %	402558355
43	NC_018488	AG	3	6	18624	18629	50 %	0 %	50 %	0 %	402558355
44	NC_018488	TA	3	6	18806	18811	50 %	50 %	0 %	0 %	402558356
45	NC_018488	AG	3	6	19100	19105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018488	AT	4	8	19302	19309	50 %	50 %	0 %	0 %	402558357
47	NC_018488	TA	3	6	19921	19926	50 %	50 %	0 %	0 %	402558358
48	NC_018488	AG	3	6	19951	19956	50 %	0 %	50 %	0 %	402558358
49	NC_018488	TC	3	6	20570	20575	0 %	50 %	0 %	50 %	402558358
50	NC_018488	GA	3	6	21224	21229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018488	GA	3	6	21242	21247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018488	TA	3	6	22228	22233	50 %	50 %	0 %	0 %	402558359
53	NC_018488	TA	3	6	22616	22621	50 %	50 %	0 %	0 %	402558359
54	NC_018488	AT	3	6	22979	22984	50 %	50 %	0 %	0 %	402558359
55	NC_018488	TC	3	6	23524	23529	0 %	50 %	0 %	50 %	402558360
56	NC_018488	AT	3	6	23628	23633	50 %	50 %	0 %	0 %	402558360
57	NC_018488	TA	3	6	23992	23997	50 %	50 %	0 %	0 %	402558360
58	NC_018488	AT	3	6	24310	24315	50 %	50 %	0 %	0 %	402558360
59	NC_018488	AT	3	6	25154	25159	50 %	50 %	0 %	0 %	402558361
60	NC_018488	CA	3	6	25169	25174	50 %	0 %	0 %	50 %	402558361
61	NC_018488	GT	3	6	25645	25650	0 %	50 %	50 %	0 %	402558361
62	NC_018488	TA	3	6	26392	26397	50 %	50 %	0 %	0 %	402558361
63	NC_018488	AC	3	6	28437	28442	50 %	0 %	0 %	50 %	402558362
64	NC_018488	AT	3	6	28987	28992	50 %	50 %	0 %	0 %	402558363
65	NC_018488	TA	4	8	30500	30507	50 %	50 %	0 %	0 %	402558365
66	NC_018488	AT	4	8	30546	30553	50 %	50 %	0 %	0 %	402558365
67	NC_018488	AG	3	6	31031	31036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018488	TA	3	6	31071	31076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018488	TA	3	6	31262	31267	50 %	50 %	0 %	0 %	402558366
70	NC_018488	AT	3	6	31973	31978	50 %	50 %	0 %	0 %	402558366
71	NC_018488	TA	3	6	33451	33456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018488	TA	3	6	33503	33508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018488	AT	3	6	33927	33932	50 %	50 %	0 %	0 %	402558370
74	NC_018488	AG	3	6	34079	34084	50 %	0 %	50 %	0 %	402558370
75	NC_018488	AT	4	8	34253	34260	50 %	50 %	0 %	0 %	402558371
76	NC_018488	TA	3	6	34605	34610	50 %	50 %	0 %	0 %	402558371
77	NC_018488	TA	4	8	34892	34899	50 %	50 %	0 %	0 %	402558372
78	NC_018488	TA	3	6	34935	34940	50 %	50 %	0 %	0 %	402558372
79	NC_018488	AG	3	6	35683	35688	50 %	0 %	50 %	0 %	402558373
80	NC_018488	TA	3	6	35729	35734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018488	AT	3	6	36071	36076	50 %	50 %	0 %	0 %	402558374
82	NC_018488	TA	3	6	36223	36228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018488	GT	3	6	36242	36247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018488	TA	3	6	36564	36569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018488	AT	3	6	37770	37775	50 %	50 %	0 %	0 %	402558376
86	NC_018488	TA	3	6	37933	37938	50 %	50 %	0 %	0 %	402558376
87	NC_018488	TG	3	6	39470	39475	0 %	50 %	50 %	0 %	402558378
88	NC_018488	AT	3	6	39837	39842	50 %	50 %	0 %	0 %	402558379
89	NC_018488	GA	3	6	40400	40405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018488	AT	3	6	40980	40985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018488	AT	3	6	41184	41189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018488	TA	3	6	41585	41590	50 %	50 %	0 %	0 %	402558380
93	NC_018488	AT	3	6	41887	41892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018488	AT	3	6	42278	42283	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
95	NC_018488	TA	3	6	42544	42549	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
96	NC_018488	TA	3	6	42646	42651	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
97	NC_018488	TA	3	6	42920	42925	50 %	50 %	0 %	0 %	402558383
98	NC_018488	GA	3	6	43343	43348	50 %	0 %	50 %	0 %	402558384
99	NC_018488	AT	3	6	43457	43462	50 %	50 %	0 %	0 %	402558384
100	NC_018488	CA	3	6	43654	43659	50 %	0 %	0 %	50 %	402558384
101	NC_018488	TA	3	6	43740	43745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018488	AC	3	6	44157	44162	50 %	0 %	0 %	50 %	402558385
103	NC_018488	AT	3	6	44344	44349	50 %	50 %	0 %	0 %	402558385
104	NC_018488	TA	3	6	44847	44852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018488	AT	3	6	45016	45021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018488	TG	3	6	45160	45165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018488	AG	3	6	45439	45444	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
108	NC_018488	AG	3	6	45465	45470	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
109	NC_018488	AC	3	6	45573	45578	50 %	0 %	0 %	50 %	402558386
110	NC_018488	CT	3	6	46517	46522	0 %	50 %	0 %	50 %	402558386
111	NC_018488	AT	3	6	46661	46666	50 %	50 %	0 %	0 %	402558386
112	NC_018488	AT	3	6	46877	46882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018488	AT	3	6	47262	47267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018488	TG	3	6	47272	47277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018488	AT	4	8	47297	47304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018488	TG	3	6	47821	47826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018488	TA	3	6	47936	47941	50 %	50 %	0 %	0 %	402558387
118	NC_018488	AG	3	6	48228	48233	50 %	0 %	50 %	0 %	402558388
119	NC_018488	TA	3	6	50065	50070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018488	TA	3	6	50090	50095	50 %	50 %	0 %	0 %	402558390
121	NC_018488	GA	3	6	50904	50909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018488	TA	3	6	50925	50930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018488	AG	3	6	51116	51121	50 %	0 %	50 %	0 %	402558391
124	NC_018488	TA	3	6	52023	52028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018488	TA	3	6	52557	52562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018488	AT	3	6	53163	53168	50 %	50 %	0 %	0 %	402558393
127	NC_018488	AG	3	6	53545	53550	50 %	0 %	50 %	0 %	402558394
128	NC_018488	AT	3	6	53839	53844	50 %	50 %	0 %	0 %	402558394
129	NC_018488	AC	3	6	53994	53999	50 %	0 %	0 %	50 %	402558394
130	NC_018488	AT	3	6	55641	55646	50 %	50 %	0 %	0 %	402558394
131	NC_018488	AG	4	8	55818	55825	50 %	0 %	50 %	0 %	402558394
132	NC_018488	TA	3	6	55894	55899	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
133	NC_018488	TA	3	6	55967	55972	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
134	NC_018488	AG	4	8	56162	56169	50 %	0 %	50 %	0 %	402558395
135	NC_018488	TA	4	8	56650	56657	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
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137	NC_018488	AT	3	6	56924	56929	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
138	NC_018488	TA	4	8	57034	57041	50 %	50 %	0 %	0 %	402558395
139	NC_018488	TA	3	6	58372	58377	50 %	50 %	0 %	0 %	402558397
140	NC_018488	TA	3	6	58382	58387	50 %	50 %	0 %	0 %	402558397
141	NC_018488	TA	3	6	58491	58496	50 %	50 %	0 %	0 %	402558397
142	NC_018488	AG	3	6	59056	59061	50 %	0 %	50 %	0 %	402558398
143	NC_018488	TG	3	6	59237	59242	0 %	50 %	50 %	0 %	402558398
144	NC_018488	GA	3	6	59367	59372	50 %	0 %	50 %	0 %	402558398
145	NC_018488	TA	3	6	61759	61764	50 %	50 %	0 %	0 %	402558400
146	NC_018488	TA	3	6	62225	62230	50 %	50 %	0 %	0 %	402558401
147	NC_018488	GT	3	6	62702	62707	0 %	50 %	50 %	0 %	402558401
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149	NC_018488	TA	3	6	62976	62981	50 %	50 %	0 %	0 %	402558401
150	NC_018488	TA	3	6	63207	63212	50 %	50 %	0 %	0 %	402558401
151	NC_018488	CA	3	6	63439	63444	50 %	0 %	0 %	50 %	402558401
152	NC_018488	AT	3	6	63655	63660	50 %	50 %	0 %	0 %	402558402
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.