MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p03

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018487	AGGAGT	2	12	3214	3225	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402558251
2	NC_018487	CAGTAG	2	12	4226	4237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558252
3	NC_018487	TACTTC	2	12	9741	9752	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402558254
4	NC_018487	ACGGTT	2	12	10978	10989	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558255
5	NC_018487	CGTATT	2	12	13210	13221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558257
6	NC_018487	ATTAAA	2	12	13506	13517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558257
7	NC_018487	TTAAAA	2	12	15818	15829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558259
8	NC_018487	TAGATT	2	12	18858	18869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558261
9	NC_018487	TATACA	2	12	20491	20502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558262
10	NC_018487	TATGCA	2	12	21952	21963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018487	TTTACA	2	12	25253	25264	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558269
12	NC_018487	CGTATT	2	12	30474	30485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558273
13	NC_018487	ATTAAA	2	12	30770	30781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558273
14	NC_018487	GTATAT	2	12	32857	32868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018487	CATTAT	2	12	33363	33374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018487	TTCTTT	2	12	33713	33724	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558275
17	NC_018487	TTTTCA	2	12	35187	35198	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558277
18	NC_018487	AAATTC	2	12	37499	37510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558281
19	NC_018487	CTTTTT	2	12	37558	37569	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558281
20	NC_018487	AAATCA	2	12	40664	40675	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402558285
21	NC_018487	TTTAAT	2	12	44297	44308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018487	TTTATA	2	12	45028	45039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018487	TTTATC	2	12	45194	45205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558292
24	NC_018487	TTAGAA	2	12	48283	48294	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558297
25	NC_018487	AAAAGA	2	12	49181	49192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558298
26	NC_018487	GATTTG	2	12	50051	50062	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018487	TGATTT	2	12	50406	50417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402558301
28	NC_018487	GTACCA	2	12	51097	51108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	402558303
29	NC_018487	AAGATA	2	12	51431	51442	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558303
30	NC_018487	TAACTG	2	12	57294	57305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018487	GAATTA	2	12	57438	57449	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558313
32	NC_018487	GTAATG	2	12	59167	59178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558315
33	NC_018487	GAAGCT	2	12	59655	59666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558315
34	NC_018487	CGTGTA	2	12	60364	60375	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558316
35	NC_018487	AGCAGA	2	12	60393	60404	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558316
36	NC_018487	ATAAAG	2	12	61616	61627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558317
37	NC_018487	GCAGAA	2	12	62679	62690	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018487	ACACCA	2	12	64373	64384	50 %	0 %	0 %	50 %	402558319
39	NC_018487	TGAAGG	2	12	64938	64949	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402558320
40	NC_018487	AACTGA	2	12	67977	67988	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558326
41	NC_018487	AAAGAA	2	12	68229	68240	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558326
42	NC_018487	TAAAAG	2	12	68680	68691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558327

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.