MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p03

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018487	TAATT	2	10	3303	3312	40 %	60 %	0 %	0 %	402558252
2	NC_018487	TGGTA	2	10	3460	3469	20 %	40 %	40 %	0 %	402558252
3	NC_018487	TTCAA	2	10	3477	3486	40 %	40 %	0 %	20 %	402558252
4	NC_018487	AGTTT	2	10	3971	3980	20 %	60 %	20 %	0 %	402558252
5	NC_018487	TTCAA	2	10	4519	4528	40 %	40 %	0 %	20 %	402558252
6	NC_018487	CGTAA	2	10	7650	7659	40 %	20 %	20 %	20 %	402558254
7	NC_018487	ATTAT	2	10	8416	8425	40 %	60 %	0 %	0 %	402558254
8	NC_018487	ATTGA	2	10	9405	9414	40 %	40 %	20 %	0 %	402558254
9	NC_018487	TCTCT	2	10	9422	9431	0 %	60 %	0 %	40 %	402558254
10	NC_018487	TGATT	2	10	11253	11262	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018487	ATTTT	2	10	14380	14389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018487	GAACA	2	10	15164	15173	60 %	0 %	20 %	20 %	402558258
13	NC_018487	TTATT	2	10	16171	16180	20 %	80 %	0 %	0 %	402558259
14	NC_018487	TTTTG	2	10	17050	17059	0 %	80 %	20 %	0 %	402558260
15	NC_018487	AAGAT	2	10	17736	17745	60 %	20 %	20 %	0 %	402558260
16	NC_018487	TGCTT	2	10	17922	17931	0 %	60 %	20 %	20 %	402558260
17	NC_018487	TTATG	2	10	19882	19891	20 %	60 %	20 %	0 %	402558262
18	NC_018487	TAATG	2	10	20719	20728	40 %	40 %	20 %	0 %	402558262
19	NC_018487	AAGGT	2	10	21231	21240	40 %	20 %	40 %	0 %	402558263
20	NC_018487	ATATT	2	10	21465	21474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018487	TAATT	2	10	21556	21565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018487	AGAGT	2	10	22099	22108	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018487	TACCC	2	10	22122	22131	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_018487	TCTTT	2	10	22294	22303	0 %	80 %	0 %	20 %	402558265
25	NC_018487	TCCAA	2	10	22522	22531	40 %	20 %	0 %	40 %	402558265
26	NC_018487	GATAA	2	10	22994	23003	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018487	TACAG	2	10	26203	26212	40 %	20 %	20 %	20 %	402558270
28	NC_018487	AAGCA	2	10	26993	27002	60 %	0 %	20 %	20 %	402558271
29	NC_018487	GTATA	2	10	27021	27030	40 %	40 %	20 %	0 %	402558271
30	NC_018487	ATGAA	2	10	27740	27749	60 %	20 %	20 %	0 %	402558271
31	NC_018487	TTGAA	2	10	32659	32668	40 %	40 %	20 %	0 %	402558274
32	NC_018487	AATGT	2	10	37658	37667	40 %	40 %	20 %	0 %	402558281
33	NC_018487	CATTT	2	10	39162	39171	20 %	60 %	0 %	20 %	402558283
34	NC_018487	TATTT	2	10	39990	39999	20 %	80 %	0 %	0 %	402558284
35	NC_018487	TTTTA	2	10	40822	40831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018487	TGAAT	2	10	41528	41537	40 %	40 %	20 %	0 %	402558287
37	NC_018487	TATTT	2	10	42369	42378	20 %	80 %	0 %	0 %	402558288
38	NC_018487	AAAAG	2	10	43501	43510	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018487	TTTAT	2	10	44188	44197	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018487	TCATA	2	10	44225	44234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018487	TATAA	2	10	45641	45650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018487	GAAAT	2	10	46458	46467	60 %	20 %	20 %	0 %	402558293
43	NC_018487	AGTTT	2	10	48110	48119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018487	AAAAT	2	10	48169	48178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018487	GTCGA	2	10	49054	49063	20 %	20 %	40 %	20 %	402558298
46	NC_018487	ACAGA	2	10	49633	49642	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018487	ATTTT	2	10	52728	52737	20 %	80 %	0 %	0 %	402558306
48	NC_018487	AAAGA	2	10	53008	53017	80 %	0 %	20 %	0 %	402558306
49	NC_018487	GTGAA	2	10	53248	53257	40 %	20 %	40 %	0 %	402558307
50	NC_018487	GCTAT	2	10	55094	55103	20 %	40 %	20 %	20 %	402558309
51	NC_018487	AATAG	2	10	56413	56422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018487	TTTGT	2	10	56654	56663	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018487	TTTTC	2	10	56671	56680	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018487	CTCAT	2	10	57192	57201	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018487	TATCG	2	10	62140	62149	20 %	40 %	20 %	20 %	402558317
56	NC_018487	TAAAT	2	10	62313	62322	60 %	40 %	0 %	0 %	402558317
57	NC_018487	GATGT	2	10	62988	62997	20 %	40 %	40 %	0 %	402558318
58	NC_018487	ATACA	2	10	64875	64884	60 %	20 %	0 %	20 %	402558320
59	NC_018487	GAATG	2	10	69371	69380	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018487	AAATG	2	10	69860	69869	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.