MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p03

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018487	GAT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018487	AAG	2	6	516	521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018487	TAA	2	6	596	601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018487	AGA	2	6	649	654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018487	GCA	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018487	TAC	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018487	ATT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018487	GTT	2	6	786	791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018487	ATG	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018487	TTG	2	6	916	921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018487	ATT	3	9	962	970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018487	TGG	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018487	ATG	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018487	TTC	2	6	1248	1253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018487	TCA	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018487	AGA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018487	ACA	2	6	1357	1362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018487	GAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018487	TAC	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018487	AAT	2	6	1565	1570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018487	TAC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018487	TCT	2	6	1719	1724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018487	TTG	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018487	CAA	2	6	1859	1864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018487	TGT	2	6	1886	1891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018487	GTT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018487	ATG	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018487	TGT	2	6	2279	2284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018487	CTG	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018487	GAA	2	6	2405	2410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018487	GAC	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018487	GCT	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018487	CAT	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018487	TTA	2	6	9828	9833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018487	ATA	2	6	9854	9859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018487	TAC	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018487	TTA	2	6	10061	10066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018487	ATT	2	6	11076	11081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018487	TAA	2	6	11149	11154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018487	AGA	2	6	11452	11457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018487	GTG	2	6	11681	11686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018487	GTG	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018487	AGT	2	6	11820	11825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018487	GGT	2	6	14481	14486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018487	TGA	2	6	16652	16657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018487	TAA	2	6	16680	16685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018487	AAG	2	6	16756	16761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018487	TAG	2	6	16777	16782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018487	AGG	2	6	16800	16805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018487	TAG	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018487	ATA	2	6	16936	16941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018487	ATA	2	6	18046	18051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018487	TTC	2	6	18287	18292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018487	TTA	2	6	18333	18338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018487	TGA	2	6	18402	18407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018487	ATA	2	6	18494	18499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018487	ATA	2	6	21827	21832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018487	AAC	2	6	21993	21998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018487	AAT	2	6	22031	22036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018487	TAG	2	6	22557	22562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018487	CTT	2	6	22575	22580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018487	TCA	2	6	22604	22609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018487	TAT	2	6	23009	23014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018487	TAT	3	9	23017	23025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018487	TGG	2	6	23392	23397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018487	GCC	2	6	23459	23464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018487	CGA	2	6	23492	23497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018487	GAT	2	6	23556	23561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018487	TTC	2	6	23641	23646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018487	GTC	2	6	23724	23729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018487	ATT	2	6	23779	23784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018487	GGT	2	6	23832	23837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018487	TAT	2	6	24410	24415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018487	GGA	2	6	24443	24448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018487	ATT	2	6	25439	25444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018487	ACA	2	6	25485	25490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018487	TGT	2	6	25503	25508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018487	TAA	2	6	25520	25525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018487	GGA	2	6	25603	25608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018487	TAT	2	6	32898	32903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018487	TTA	2	6	33027	33032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018487	ATA	2	6	33084	33089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018487	AGA	2	6	33154	33159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018487	CAT	2	6	33220	33225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018487	TAA	2	6	33234	33239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018487	ATT	2	6	33260	33265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018487	ATT	2	6	33269	33274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018487	ATA	2	6	33282	33287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018487	ATT	2	6	33409	33414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018487	TAA	2	6	33437	33442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018487	GTA	2	6	33459	33464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018487	AAG	2	6	33471	33476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018487	TTG	2	6	34162	34167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018487	ATT	2	6	34181	34186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018487	AAT	2	6	34233	34238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018487	ACT	2	6	34265	34270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018487	CAA	2	6	34424	34429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018487	AGG	2	6	34583	34588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018487	ATA	2	6	35480	35485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018487	TTA	2	6	35702	35707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018487	ATC	2	6	37402	37407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018487	GCC	2	6	37445	37450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018487	GAA	2	6	37458	37463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018487	TAC	2	6	38888	38893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018487	TCA	2	6	38902	38907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018487	CAT	2	6	39527	39532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018487	AGG	2	6	39560	39565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018487	ACA	2	6	39589	39594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018487	ATG	2	6	39606	39611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018487	TCT	2	6	39755	39760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018487	ATC	2	6	39815	39820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018487	TTC	2	6	39865	39870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018487	ATA	2	6	39889	39894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018487	TAT	2	6	39911	39916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018487	CCT	2	6	40381	40386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018487	TAT	2	6	40489	40494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018487	TCC	2	6	43203	43208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_018487	CTT	2	6	43461	43466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018487	CGT	2	6	43513	43518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018487	TAA	2	6	43542	43547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018487	GGA	2	6	43553	43558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018487	AGG	2	6	43951	43956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018487	ACC	2	6	44139	44144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_018487	TCT	2	6	44182	44187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018487	AAT	2	6	44238	44243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018487	AAT	2	6	45157	45162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018487	GTA	2	6	45178	45183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018487	TTA	2	6	45507	45512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018487	TAA	2	6	45541	45546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018487	TAC	2	6	45555	45560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018487	AAT	2	6	45671	45676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018487	CAA	2	6	45898	45903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018487	ATG	2	6	47372	47377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018487	TTA	2	6	47388	47393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018487	AAC	2	6	48079	48084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018487	TTA	2	6	48086	48091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018487	TAT	2	6	48101	48106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018487	TAG	2	6	48454	48459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018487	CAT	2	6	50009	50014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018487	AAT	2	6	50065	50070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018487	TAA	2	6	50143	50148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018487	TAG	2	6	54299	54304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.