MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	CAAATG	2	12	2280	2291	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558639
2	NC_018486	GCGTTT	2	12	3143	3154	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402558641
3	NC_018486	AAAAAG	2	12	4213	4224	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558643
4	NC_018486	AGCCAG	2	12	5567	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558643
5	NC_018486	TTACTT	2	12	7126	7137	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558644
6	NC_018486	ACGCAA	2	12	9085	9096	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402558644
7	NC_018486	AAATCA	2	12	9903	9914	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402558644
8	NC_018486	AATTAG	2	12	14148	14159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558649
9	NC_018486	AAAAGA	2	12	14959	14970	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558650
10	NC_018486	AGAACA	2	12	16114	16125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558651
11	NC_018486	AATTTG	2	12	16622	16633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018486	GATATT	2	12	17323	17334	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558654
13	NC_018486	ATTACT	2	12	17555	17566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558654
14	NC_018486	TTTTGA	2	12	17583	17594	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402558654
15	NC_018486	GAAATA	2	12	17773	17784	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018486	ATGGAA	2	12	18550	18561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558656
17	NC_018486	CTAGTA	2	12	20157	20168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558658
18	NC_018486	ATACAC	2	12	21881	21892	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402558662
19	NC_018486	TTTAAT	2	12	22213	22224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018486	ATTTTT	2	12	25111	25122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558665
21	NC_018486	AAATAA	2	12	30587	30598	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402558673
22	NC_018486	AAAGGA	2	12	30781	30792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558673
23	NC_018486	ATTAAC	2	12	32653	32664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018486	CCCATA	2	12	40268	40279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	402558684
25	NC_018486	TGATTT	2	12	40312	40323	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402558684
26	NC_018486	AAAAGA	2	12	42183	42194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558687
27	NC_018486	ATTTTT	2	12	42351	42362	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018486	AATGTT	2	12	47040	47051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558692
29	NC_018486	TAAAAA	2	12	47631	47642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018486	ATTTAT	2	12	55408	55419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018486	TTCTTT	2	12	57824	57835	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018486	TTTTAA	2	12	65079	65090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558703
33	NC_018486	ACTTCC	2	12	68195	68206	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018486	TTTCTT	2	12	68696	68707	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558709
35	NC_018486	TAGGAT	2	12	70816	70827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018486	TTAGTT	2	12	82383	82394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402558722
37	NC_018486	GATTGG	2	12	84912	84923	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	402558724
38	NC_018486	TTTCAT	2	12	86263	86274	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558725
39	NC_018486	CTTTCC	2	12	88795	88806	0 %	50 %	0 %	50 %	402558728
40	NC_018486	AAACGG	2	12	89037	89048	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558729
41	NC_018486	CAGAAC	2	12	89445	89456	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402558730
42	NC_018486	CAAGCA	2	12	90740	90751	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402558731
43	NC_018486	AAGTGA	2	12	91864	91875	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018486	CCATAA	2	12	92359	92370	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402558732
45	NC_018486	TTCATT	2	12	92815	92826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558733
46	NC_018486	TTCAAT	2	12	92833	92844	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558733
47	NC_018486	CTTTTT	2	12	94245	94256	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558734
48	NC_018486	AGGTAA	2	12	101129	101140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558740
49	NC_018486	GGGTCT	2	12	102041	102052	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	402558741
50	NC_018486	CAGTTA	2	12	103323	103334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558741
51	NC_018486	TTTTCT	2	12	106594	106605	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558743
52	NC_018486	AAATAT	2	12	114957	114968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018486	ACTTTA	2	12	117266	117277	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558750
54	NC_018486	GAAAAA	2	12	118632	118643	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558753
55	NC_018486	TCCACA	2	12	119350	119361	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	402558753
56	NC_018486	AAATAG	2	12	122496	122507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558758
57	NC_018486	CTTTTT	2	12	123517	123528	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558759
58	NC_018486	ATTGAT	2	12	126703	126714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558763
59	NC_018486	AATTTG	2	12	134456	134467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558775
60	NC_018486	AGTTTC	2	12	134802	134813	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558775
61	NC_018486	ATATCG	2	12	136151	136162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558776
62	NC_018486	AAACAA	2	12	136302	136313	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402558776
63	NC_018486	GTTCCT	2	12	143359	143370	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402558780
64	NC_018486	AACAAA	2	12	147623	147634	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402558784
65	NC_018486	ATTGAT	2	12	149882	149893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558786
66	NC_018486	GATTTC	2	12	150981	150992	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558786
67	NC_018486	ACAGCA	2	12	153569	153580	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402558790
68	NC_018486	AGGAGC	2	12	153607	153618	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	402558790
69	NC_018486	TTTGGT	2	12	153749	153760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558790
70	NC_018486	AAAAAG	2	12	157410	157421	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558792
71	NC_018486	ACGTGT	2	12	158815	158826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558794
72	NC_018486	GGAGAA	2	12	160438	160449	50 %	0 %	50 %	0 %	402558796
73	NC_018486	AACTTT	2	12	166207	166218	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558804
74	NC_018486	AGATGT	2	12	169425	169436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558807

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.