MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	GAAAA	2	10	1848	1857	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018486	TAATA	2	10	2016	2025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018486	ACTTA	2	10	2027	2036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018486	TAATA	2	10	2130	2139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018486	TATAA	2	10	2370	2379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018486	AATAA	2	10	2397	2406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018486	ATTTA	2	10	3837	3846	40 %	60 %	0 %	0 %	402558642
8	NC_018486	GAAAA	2	10	4225	4234	80 %	0 %	20 %	0 %	402558643
9	NC_018486	TGAAG	2	10	5520	5529	40 %	20 %	40 %	0 %	402558643
10	NC_018486	TAACT	2	10	6099	6108	40 %	40 %	0 %	20 %	402558643
11	NC_018486	CTGAG	2	10	6827	6836	20 %	20 %	40 %	20 %	402558644
12	NC_018486	AAAGA	2	10	7324	7333	80 %	0 %	20 %	0 %	402558644
13	NC_018486	TCCGA	2	10	11598	11607	20 %	20 %	20 %	40 %	402558645
14	NC_018486	CAAAC	2	10	11878	11887	60 %	0 %	0 %	40 %	402558645
15	NC_018486	TGAAA	2	10	13296	13305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018486	GGAAG	2	10	16217	16226	40 %	0 %	60 %	0 %	402558651
17	NC_018486	TTGAA	2	10	16773	16782	40 %	40 %	20 %	0 %	402558652
18	NC_018486	TGTTC	2	10	17139	17148	0 %	60 %	20 %	20 %	402558653
19	NC_018486	AACAG	2	10	17341	17350	60 %	0 %	20 %	20 %	402558654
20	NC_018486	GTTAT	2	10	19014	19023	20 %	60 %	20 %	0 %	402558657
21	NC_018486	CGGTA	2	10	21502	21511	20 %	20 %	40 %	20 %	402558661
22	NC_018486	TGAAG	2	10	23152	23161	40 %	20 %	40 %	0 %	402558663
23	NC_018486	TAAAG	2	10	23915	23924	60 %	20 %	20 %	0 %	402558664
24	NC_018486	TATAA	2	10	24272	24281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018486	AAAGA	2	10	24390	24399	80 %	0 %	20 %	0 %	402558665
26	NC_018486	TAATT	2	10	25424	25433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018486	TTAAA	2	10	25944	25953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018486	TGATA	2	10	26589	26598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018486	TAAAA	2	10	27903	27912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018486	TCTTT	2	10	27985	27994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018486	TGATT	2	10	29363	29372	20 %	60 %	20 %	0 %	402558670
32	NC_018486	AAATG	2	10	30816	30825	60 %	20 %	20 %	0 %	402558673
33	NC_018486	AAAGA	2	10	34288	34297	80 %	0 %	20 %	0 %	402558678
34	NC_018486	ATTAA	2	10	34307	34316	60 %	40 %	0 %	0 %	402558678
35	NC_018486	ATAGA	2	10	34844	34853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018486	ATAAA	2	10	35008	35017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018486	AAACA	2	10	35344	35353	80 %	0 %	0 %	20 %	402558680
38	NC_018486	AATTA	2	10	37265	37274	60 %	40 %	0 %	0 %	402558681
39	NC_018486	TTCTG	2	10	37329	37338	0 %	60 %	20 %	20 %	402558681
40	NC_018486	AAAGA	2	10	37954	37963	80 %	0 %	20 %	0 %	402558681
41	NC_018486	AGAAA	2	10	38108	38117	80 %	0 %	20 %	0 %	402558681
42	NC_018486	ATAAA	2	10	42526	42535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018486	GGAGC	2	10	42827	42836	20 %	0 %	60 %	20 %	402558688
44	NC_018486	TGCAT	2	10	43422	43431	20 %	40 %	20 %	20 %	402558688
45	NC_018486	TTCAA	2	10	45093	45102	40 %	40 %	0 %	20 %	402558691
46	NC_018486	TCTTT	2	10	47539	47548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018486	GGAAA	2	10	48780	48789	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018486	TATAA	2	10	49114	49123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018486	ATCTT	2	10	49235	49244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018486	ATATT	2	10	49287	49296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018486	AAAAT	2	10	49416	49425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018486	TTTAT	2	10	49435	49444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018486	TTGAA	2	10	51316	51325	40 %	40 %	20 %	0 %	402558695
54	NC_018486	ATTCA	2	10	53191	53200	40 %	40 %	0 %	20 %	402558696
55	NC_018486	ATTTT	2	10	54485	54494	20 %	80 %	0 %	0 %	402558697
56	NC_018486	CTGTA	2	10	54729	54738	20 %	40 %	20 %	20 %	402558697
57	NC_018486	TAAGA	2	10	55293	55302	60 %	20 %	20 %	0 %	402558697
58	NC_018486	GTTAA	2	10	57462	57471	40 %	40 %	20 %	0 %	402558698
59	NC_018486	AATAG	2	10	57626	57635	60 %	20 %	20 %	0 %	402558698
60	NC_018486	TTAAA	2	10	57682	57691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018486	TAAGT	2	10	59144	59153	40 %	40 %	20 %	0 %	402558699
62	NC_018486	ATGAC	2	10	59599	59608	40 %	20 %	20 %	20 %	402558699
63	NC_018486	ATTTG	2	10	60218	60227	20 %	60 %	20 %	0 %	402558700
64	NC_018486	ACCAT	2	10	61400	61409	40 %	20 %	0 %	40 %	402558701
65	NC_018486	TATAA	2	10	62153	62162	60 %	40 %	0 %	0 %	402558701
66	NC_018486	AATTA	2	10	63307	63316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018486	ATAAC	2	10	63456	63465	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018486	TATTT	2	10	66658	66667	20 %	80 %	0 %	0 %	402558705
69	NC_018486	ATTTT	2	10	67212	67221	20 %	80 %	0 %	0 %	402558705
70	NC_018486	ATTAA	3	15	67351	67365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018486	TATAT	2	10	67385	67394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018486	AAATA	2	10	67440	67449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018486	TTAAA	2	10	68267	68276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018486	ATTTC	2	10	68845	68854	20 %	60 %	0 %	20 %	402558709
75	NC_018486	TCTTT	2	10	70527	70536	0 %	80 %	0 %	20 %	402558709
76	NC_018486	TACAA	2	10	71465	71474	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018486	TAAAT	2	10	71562	71571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018486	TTTCG	2	10	73631	73640	0 %	60 %	20 %	20 %	402558712
79	NC_018486	AAATG	2	10	74849	74858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018486	TTACA	2	10	75049	75058	40 %	40 %	0 %	20 %	402558713
81	NC_018486	TTTTA	2	10	75207	75216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018486	TCCAT	2	10	75688	75697	20 %	40 %	0 %	40 %	402558714
83	NC_018486	TATCA	2	10	77391	77400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018486	ACTCT	2	10	77683	77692	20 %	40 %	0 %	40 %	402558719
85	NC_018486	AATCG	2	10	77767	77776	40 %	20 %	20 %	20 %	402558719
86	NC_018486	TCATT	2	10	78371	78380	20 %	60 %	0 %	20 %	402558719
87	NC_018486	TAAAT	2	10	80520	80529	60 %	40 %	0 %	0 %	402558720
88	NC_018486	AAGAG	2	10	83546	83555	60 %	0 %	40 %	0 %	402558722
89	NC_018486	AAACA	2	10	83596	83605	80 %	0 %	0 %	20 %	402558722
90	NC_018486	CATTC	2	10	86053	86062	20 %	40 %	0 %	40 %	402558725
91	NC_018486	TTAAT	2	10	87052	87061	40 %	60 %	0 %	0 %	402558726
92	NC_018486	TTCCT	2	10	87095	87104	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_018486	AATGA	2	10	87816	87825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018486	AACGA	2	10	88035	88044	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018486	TAAAA	2	10	88956	88965	80 %	20 %	0 %	0 %	402558729
96	NC_018486	ATGAT	2	10	89357	89366	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018486	AAGAA	2	10	90012	90021	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018486	ACAAG	2	10	90385	90394	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018486	ATTTG	2	10	92697	92706	20 %	60 %	20 %	0 %	402558733
100	NC_018486	TTCTG	2	10	93878	93887	0 %	60 %	20 %	20 %	402558734
101	NC_018486	TTACT	2	10	94396	94405	20 %	60 %	0 %	20 %	402558735
102	NC_018486	ATACG	2	10	94640	94649	40 %	20 %	20 %	20 %	402558735
103	NC_018486	GCATT	2	10	94858	94867	20 %	40 %	20 %	20 %	402558735
104	NC_018486	CATTC	2	10	95818	95827	20 %	40 %	0 %	40 %	402558735
105	NC_018486	TAAAA	2	10	97665	97674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018486	TTCCT	2	10	97959	97968	0 %	60 %	0 %	40 %	402558737
107	NC_018486	CACAA	2	10	99934	99943	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_018486	TGAAA	2	10	104736	104745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018486	AGTTA	2	10	110403	110412	40 %	40 %	20 %	0 %	402558745
110	NC_018486	ATTCT	2	10	112127	112136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018486	AGCCA	2	10	113201	113210	40 %	0 %	20 %	40 %	402558746
112	NC_018486	TCCGT	2	10	113746	113755	0 %	40 %	20 %	40 %	402558746
113	NC_018486	AAATA	2	10	114694	114703	80 %	20 %	0 %	0 %	402558746
114	NC_018486	TTAAT	2	10	117790	117799	40 %	60 %	0 %	0 %	402558751
115	NC_018486	ATTTC	2	10	117870	117879	20 %	60 %	0 %	20 %	402558751
116	NC_018486	CCTTC	2	10	120577	120586	0 %	40 %	0 %	60 %	402558755
117	NC_018486	ATTAT	2	10	120930	120939	40 %	60 %	0 %	0 %	402558755
118	NC_018486	AAGAA	2	10	123146	123155	80 %	0 %	20 %	0 %	402558759
119	NC_018486	GAAAT	2	10	125083	125092	60 %	20 %	20 %	0 %	402558762
120	NC_018486	CACAA	2	10	129793	129802	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018486	CATTC	2	10	130632	130641	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018486	AATAT	2	10	130979	130988	60 %	40 %	0 %	0 %	402558770
123	NC_018486	CACAA	2	10	131544	131553	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018486	TTTGC	2	10	132412	132421	0 %	60 %	20 %	20 %	402558773
125	NC_018486	TAAAT	2	10	135527	135536	60 %	40 %	0 %	0 %	402558775
126	NC_018486	TACAA	2	10	135725	135734	60 %	20 %	0 %	20 %	402558775
127	NC_018486	AATTT	2	10	136058	136067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018486	TTAAT	2	10	136412	136421	40 %	60 %	0 %	0 %	402558776
129	NC_018486	GGATT	2	10	136464	136473	20 %	40 %	40 %	0 %	402558776
130	NC_018486	CTTCG	2	10	137457	137466	0 %	40 %	20 %	40 %	402558777
131	NC_018486	TACGA	2	10	138103	138112	40 %	20 %	20 %	20 %	402558777
132	NC_018486	AGTAA	2	10	138344	138353	60 %	20 %	20 %	0 %	402558777
133	NC_018486	AAAGA	2	10	139934	139943	80 %	0 %	20 %	0 %	402558777
134	NC_018486	TGATT	2	10	140607	140616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018486	CTTCT	2	10	140908	140917	0 %	60 %	0 %	40 %	402558779
136	NC_018486	TTGCA	2	10	140990	140999	20 %	40 %	20 %	20 %	402558779
137	NC_018486	CTCTT	2	10	142872	142881	0 %	60 %	0 %	40 %	402558780
138	NC_018486	TTGAT	2	10	142959	142968	20 %	60 %	20 %	0 %	402558780
139	NC_018486	AGTTC	2	10	144436	144445	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018486	AACAA	2	10	145085	145094	80 %	0 %	0 %	20 %	402558782
141	NC_018486	ATCAA	2	10	145742	145751	60 %	20 %	0 %	20 %	402558783
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.