MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	GAAAA	2	10	1848	1857	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018486	TAATA	2	10	2016	2025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018486	ACTTA	2	10	2027	2036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018486	TAATA	2	10	2130	2139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018486	TATAA	2	10	2370	2379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018486	AATAA	2	10	2397	2406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018486	TGAAA	2	10	13296	13305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018486	TATAA	2	10	24272	24281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018486	TAATT	2	10	25424	25433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018486	TTAAA	2	10	25944	25953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018486	TGATA	2	10	26589	26598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018486	TAAAA	2	10	27903	27912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018486	TCTTT	2	10	27985	27994	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018486	ATAGA	2	10	34844	34853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018486	ATAAA	2	10	35008	35017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018486	ATAAA	2	10	42526	42535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018486	TCTTT	2	10	47539	47548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018486	GGAAA	2	10	48780	48789	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018486	TATAA	2	10	49114	49123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018486	ATCTT	2	10	49235	49244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_018486	ATATT	2	10	49287	49296	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018486	AAAAT	2	10	49416	49425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018486	TTTAT	2	10	49435	49444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018486	TTAAA	2	10	57682	57691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018486	AATTA	2	10	63307	63316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018486	ATAAC	2	10	63456	63465	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018486	ATTAA	3	15	67351	67365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018486	TATAT	2	10	67385	67394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018486	AAATA	2	10	67440	67449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018486	TTAAA	2	10	68267	68276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018486	TACAA	2	10	71465	71474	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018486	TAAAT	2	10	71562	71571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018486	AAATG	2	10	74849	74858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018486	TTTTA	2	10	75207	75216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018486	TATCA	2	10	77391	77400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018486	TTCCT	2	10	87095	87104	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018486	AATGA	2	10	87816	87825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018486	AACGA	2	10	88035	88044	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018486	ATGAT	2	10	89357	89366	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018486	AAGAA	2	10	90012	90021	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018486	ACAAG	2	10	90385	90394	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018486	TAAAA	2	10	97665	97674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018486	CACAA	2	10	99934	99943	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018486	TGAAA	2	10	104736	104745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018486	ATTCT	2	10	112127	112136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018486	CACAA	2	10	129793	129802	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_018486	CATTC	2	10	130632	130641	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_018486	CACAA	2	10	131544	131553	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018486	AATTT	2	10	136058	136067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018486	TGATT	2	10	140607	140616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018486	AGTTC	2	10	144436	144445	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018486	TTACT	2	10	152191	152200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018486	TAAAA	2	10	157961	157970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018486	GAAAG	2	10	157973	157982	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018486	AAATC	2	10	158193	158202	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018486	TTTAC	2	10	164442	164451	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018486	ATGGT	2	10	165532	165541	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018486	TTGTG	2	10	166547	166556	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018486	TTTTA	2	10	167394	167403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.