MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	ATTTA	2	10	3837	3846	40 %	60 %	0 %	0 %	402558642
2	NC_018486	GAAAA	2	10	4225	4234	80 %	0 %	20 %	0 %	402558643
3	NC_018486	TGAAG	2	10	5520	5529	40 %	20 %	40 %	0 %	402558643
4	NC_018486	TAACT	2	10	6099	6108	40 %	40 %	0 %	20 %	402558643
5	NC_018486	CTGAG	2	10	6827	6836	20 %	20 %	40 %	20 %	402558644
6	NC_018486	AAAGA	2	10	7324	7333	80 %	0 %	20 %	0 %	402558644
7	NC_018486	TCCGA	2	10	11598	11607	20 %	20 %	20 %	40 %	402558645
8	NC_018486	CAAAC	2	10	11878	11887	60 %	0 %	0 %	40 %	402558645
9	NC_018486	GGAAG	2	10	16217	16226	40 %	0 %	60 %	0 %	402558651
10	NC_018486	TTGAA	2	10	16773	16782	40 %	40 %	20 %	0 %	402558652
11	NC_018486	TGTTC	2	10	17139	17148	0 %	60 %	20 %	20 %	402558653
12	NC_018486	AACAG	2	10	17341	17350	60 %	0 %	20 %	20 %	402558654
13	NC_018486	GTTAT	2	10	19014	19023	20 %	60 %	20 %	0 %	402558657
14	NC_018486	CGGTA	2	10	21502	21511	20 %	20 %	40 %	20 %	402558661
15	NC_018486	TGAAG	2	10	23152	23161	40 %	20 %	40 %	0 %	402558663
16	NC_018486	TAAAG	2	10	23915	23924	60 %	20 %	20 %	0 %	402558664
17	NC_018486	AAAGA	2	10	24390	24399	80 %	0 %	20 %	0 %	402558665
18	NC_018486	TGATT	2	10	29363	29372	20 %	60 %	20 %	0 %	402558670
19	NC_018486	AAATG	2	10	30816	30825	60 %	20 %	20 %	0 %	402558673
20	NC_018486	AAAGA	2	10	34288	34297	80 %	0 %	20 %	0 %	402558678
21	NC_018486	ATTAA	2	10	34307	34316	60 %	40 %	0 %	0 %	402558678
22	NC_018486	AAACA	2	10	35344	35353	80 %	0 %	0 %	20 %	402558680
23	NC_018486	AATTA	2	10	37265	37274	60 %	40 %	0 %	0 %	402558681
24	NC_018486	TTCTG	2	10	37329	37338	0 %	60 %	20 %	20 %	402558681
25	NC_018486	AAAGA	2	10	37954	37963	80 %	0 %	20 %	0 %	402558681
26	NC_018486	AGAAA	2	10	38108	38117	80 %	0 %	20 %	0 %	402558681
27	NC_018486	GGAGC	2	10	42827	42836	20 %	0 %	60 %	20 %	402558688
28	NC_018486	TGCAT	2	10	43422	43431	20 %	40 %	20 %	20 %	402558688
29	NC_018486	TTCAA	2	10	45093	45102	40 %	40 %	0 %	20 %	402558691
30	NC_018486	TTGAA	2	10	51316	51325	40 %	40 %	20 %	0 %	402558695
31	NC_018486	ATTCA	2	10	53191	53200	40 %	40 %	0 %	20 %	402558696
32	NC_018486	ATTTT	2	10	54485	54494	20 %	80 %	0 %	0 %	402558697
33	NC_018486	CTGTA	2	10	54729	54738	20 %	40 %	20 %	20 %	402558697
34	NC_018486	TAAGA	2	10	55293	55302	60 %	20 %	20 %	0 %	402558697
35	NC_018486	GTTAA	2	10	57462	57471	40 %	40 %	20 %	0 %	402558698
36	NC_018486	AATAG	2	10	57626	57635	60 %	20 %	20 %	0 %	402558698
37	NC_018486	TAAGT	2	10	59144	59153	40 %	40 %	20 %	0 %	402558699
38	NC_018486	ATGAC	2	10	59599	59608	40 %	20 %	20 %	20 %	402558699
39	NC_018486	ATTTG	2	10	60218	60227	20 %	60 %	20 %	0 %	402558700
40	NC_018486	ACCAT	2	10	61400	61409	40 %	20 %	0 %	40 %	402558701
41	NC_018486	TATAA	2	10	62153	62162	60 %	40 %	0 %	0 %	402558701
42	NC_018486	TATTT	2	10	66658	66667	20 %	80 %	0 %	0 %	402558705
43	NC_018486	ATTTT	2	10	67212	67221	20 %	80 %	0 %	0 %	402558705
44	NC_018486	ATTTC	2	10	68845	68854	20 %	60 %	0 %	20 %	402558709
45	NC_018486	TCTTT	2	10	70527	70536	0 %	80 %	0 %	20 %	402558709
46	NC_018486	TTTCG	2	10	73631	73640	0 %	60 %	20 %	20 %	402558712
47	NC_018486	TTACA	2	10	75049	75058	40 %	40 %	0 %	20 %	402558713
48	NC_018486	TCCAT	2	10	75688	75697	20 %	40 %	0 %	40 %	402558714
49	NC_018486	ACTCT	2	10	77683	77692	20 %	40 %	0 %	40 %	402558719
50	NC_018486	AATCG	2	10	77767	77776	40 %	20 %	20 %	20 %	402558719
51	NC_018486	TCATT	2	10	78371	78380	20 %	60 %	0 %	20 %	402558719
52	NC_018486	TAAAT	2	10	80520	80529	60 %	40 %	0 %	0 %	402558720
53	NC_018486	AAGAG	2	10	83546	83555	60 %	0 %	40 %	0 %	402558722
54	NC_018486	AAACA	2	10	83596	83605	80 %	0 %	0 %	20 %	402558722
55	NC_018486	CATTC	2	10	86053	86062	20 %	40 %	0 %	40 %	402558725
56	NC_018486	TTAAT	2	10	87052	87061	40 %	60 %	0 %	0 %	402558726
57	NC_018486	TAAAA	2	10	88956	88965	80 %	20 %	0 %	0 %	402558729
58	NC_018486	ATTTG	2	10	92697	92706	20 %	60 %	20 %	0 %	402558733
59	NC_018486	TTCTG	2	10	93878	93887	0 %	60 %	20 %	20 %	402558734
60	NC_018486	TTACT	2	10	94396	94405	20 %	60 %	0 %	20 %	402558735
61	NC_018486	ATACG	2	10	94640	94649	40 %	20 %	20 %	20 %	402558735
62	NC_018486	GCATT	2	10	94858	94867	20 %	40 %	20 %	20 %	402558735
63	NC_018486	CATTC	2	10	95818	95827	20 %	40 %	0 %	40 %	402558735
64	NC_018486	TTCCT	2	10	97959	97968	0 %	60 %	0 %	40 %	402558737
65	NC_018486	AGTTA	2	10	110403	110412	40 %	40 %	20 %	0 %	402558745
66	NC_018486	AGCCA	2	10	113201	113210	40 %	0 %	20 %	40 %	402558746
67	NC_018486	TCCGT	2	10	113746	113755	0 %	40 %	20 %	40 %	402558746
68	NC_018486	AAATA	2	10	114694	114703	80 %	20 %	0 %	0 %	402558746
69	NC_018486	TTAAT	2	10	117790	117799	40 %	60 %	0 %	0 %	402558751
70	NC_018486	ATTTC	2	10	117870	117879	20 %	60 %	0 %	20 %	402558751
71	NC_018486	CCTTC	2	10	120577	120586	0 %	40 %	0 %	60 %	402558755
72	NC_018486	ATTAT	2	10	120930	120939	40 %	60 %	0 %	0 %	402558755
73	NC_018486	AAGAA	2	10	123146	123155	80 %	0 %	20 %	0 %	402558759
74	NC_018486	GAAAT	2	10	125083	125092	60 %	20 %	20 %	0 %	402558762
75	NC_018486	AATAT	2	10	130979	130988	60 %	40 %	0 %	0 %	402558770
76	NC_018486	TTTGC	2	10	132412	132421	0 %	60 %	20 %	20 %	402558773
77	NC_018486	TAAAT	2	10	135527	135536	60 %	40 %	0 %	0 %	402558775
78	NC_018486	TACAA	2	10	135725	135734	60 %	20 %	0 %	20 %	402558775
79	NC_018486	TTAAT	2	10	136412	136421	40 %	60 %	0 %	0 %	402558776
80	NC_018486	GGATT	2	10	136464	136473	20 %	40 %	40 %	0 %	402558776
81	NC_018486	CTTCG	2	10	137457	137466	0 %	40 %	20 %	40 %	402558777
82	NC_018486	TACGA	2	10	138103	138112	40 %	20 %	20 %	20 %	402558777
83	NC_018486	AGTAA	2	10	138344	138353	60 %	20 %	20 %	0 %	402558777
84	NC_018486	AAAGA	2	10	139934	139943	80 %	0 %	20 %	0 %	402558777
85	NC_018486	CTTCT	2	10	140908	140917	0 %	60 %	0 %	40 %	402558779
86	NC_018486	TTGCA	2	10	140990	140999	20 %	40 %	20 %	20 %	402558779
87	NC_018486	CTCTT	2	10	142872	142881	0 %	60 %	0 %	40 %	402558780
88	NC_018486	TTGAT	2	10	142959	142968	20 %	60 %	20 %	0 %	402558780
89	NC_018486	AACAA	2	10	145085	145094	80 %	0 %	0 %	20 %	402558782
90	NC_018486	ATCAA	2	10	145742	145751	60 %	20 %	0 %	20 %	402558783
91	NC_018486	GTGAT	2	10	149625	149634	20 %	40 %	40 %	0 %	402558786
92	NC_018486	ATTTT	2	10	150621	150630	20 %	80 %	0 %	0 %	402558786
93	NC_018486	AAAAG	2	10	150957	150966	80 %	0 %	20 %	0 %	402558786
94	NC_018486	AGTCT	2	10	156166	156175	20 %	40 %	20 %	20 %	402558791
95	NC_018486	GAAGG	2	10	156216	156225	40 %	0 %	60 %	0 %	402558791
96	NC_018486	GAAAA	2	10	156441	156450	80 %	0 %	20 %	0 %	402558791
97	NC_018486	AGAAA	2	10	158869	158878	80 %	0 %	20 %	0 %	402558794
98	NC_018486	CCAAT	2	10	159114	159123	40 %	20 %	0 %	40 %	402558794
99	NC_018486	AAGAA	2	10	159389	159398	80 %	0 %	20 %	0 %	402558795
100	NC_018486	TAGCT	2	10	159521	159530	20 %	40 %	20 %	20 %	402558795
101	NC_018486	AGAGA	2	10	160233	160242	60 %	0 %	40 %	0 %	402558796
102	NC_018486	GGAAA	2	10	161376	161385	60 %	0 %	40 %	0 %	402558796
103	NC_018486	AAAGA	2	10	161573	161582	80 %	0 %	20 %	0 %	402558797
104	NC_018486	AGAAA	2	10	162578	162587	80 %	0 %	20 %	0 %	402558798
105	NC_018486	AAATG	2	10	163564	163573	60 %	20 %	20 %	0 %	402558800
106	NC_018486	AACAG	2	10	164599	164608	60 %	0 %	20 %	20 %	402558802
107	NC_018486	TATGG	2	10	167871	167880	20 %	40 %	40 %	0 %	402558806
108	NC_018486	ATGAA	2	10	169703	169712	60 %	20 %	20 %	0 %	402558807
109	NC_018486	ATTCC	2	10	169762	169771	20 %	40 %	0 %	40 %	402558807

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.