MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	CAAC	2	8	1115	1122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018486	AAAT	2	8	1165	1172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018486	CTTT	2	8	1994	2001	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018486	TACT	2	8	2085	2092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018486	TAAA	2	8	2336	2343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018486	AAGG	2	8	6310	6317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018486	TAAA	2	8	13273	13280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018486	ATTT	2	8	14021	14028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018486	TAAA	2	8	14479	14486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018486	TAAA	2	8	20316	20323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018486	TGTT	2	8	22147	22154	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018486	TAGA	2	8	25757	25764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018486	GAAC	2	8	25833	25840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018486	TTAT	2	8	26066	26073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018486	CCCA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_018486	TAAA	2	8	26364	26371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018486	TTTA	2	8	26566	26573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018486	TAAT	2	8	29595	29602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018486	GTTT	2	8	29998	30005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018486	TTTA	2	8	31856	31863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018486	TTAA	2	8	32704	32711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018486	TAAA	2	8	32751	32758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018486	ATAA	2	8	32778	32785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018486	ATTA	2	8	35188	35195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018486	TAAT	2	8	36937	36944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018486	ATAG	2	8	38569	38576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018486	AGAA	2	8	39269	39276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018486	AATA	2	8	40441	40448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018486	TAAA	2	8	40480	40487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018486	TGAT	2	8	40543	40550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018486	GGAA	2	8	42019	42026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018486	TAAA	2	8	42390	42397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018486	TTCT	2	8	45046	45053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018486	AGCT	2	8	45058	45065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018486	ATCA	2	8	47584	47591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018486	TTTA	2	8	47944	47951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018486	GAAA	2	8	47966	47973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018486	ATAA	2	8	48200	48207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018486	ATTA	2	8	48308	48315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018486	AGGG	2	8	48705	48712	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018486	ATTA	2	8	49092	49099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018486	TGTT	2	8	49145	49152	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018486	AAAT	2	8	49354	49361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018486	CTAG	2	8	51351	51358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018486	AGAA	2	8	51365	51372	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018486	TATT	2	8	55368	55375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018486	GATA	2	8	55602	55609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018486	TAAT	2	8	57880	57887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018486	ATTT	2	8	59935	59942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018486	TAGA	2	8	60048	60055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018486	AACT	2	8	63100	63107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018486	ATTA	2	8	70656	70663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018486	ATTT	2	8	70888	70895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018486	ATTT	2	8	70957	70964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018486	TAAG	2	8	71213	71220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018486	AGAA	2	8	71371	71378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018486	AAAT	2	8	71425	71432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018486	GATT	2	8	71548	71555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018486	TAAA	2	8	72895	72902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018486	TGTT	2	8	72982	72989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018486	ATTT	2	8	72995	73002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018486	TTTG	2	8	73206	73213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018486	CAAT	2	8	73407	73414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018486	TAAT	2	8	77407	77414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018486	TAAA	2	8	86869	86876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018486	TTTA	2	8	87117	87124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018486	AAAT	2	8	89306	89313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018486	CAAA	2	8	90178	90185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018486	TTCT	2	8	90194	90201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018486	CACT	2	8	90317	90324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018486	ACAT	2	8	90616	90623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018486	GAAA	2	8	91949	91956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018486	CTAT	3	12	93596	93607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018486	ATAA	2	8	99777	99784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018486	AATT	2	8	100226	100233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018486	CTTT	2	8	100254	100261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018486	AAAT	2	8	100270	100277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018486	CTTT	2	8	104894	104901	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018486	ATAA	2	8	104902	104909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018486	TTTA	2	8	104937	104944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018486	AATA	2	8	108962	108969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018486	AAAG	2	8	112226	112233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018486	AATT	2	8	112707	112714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018486	AATA	2	8	112760	112767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018486	TTCT	2	8	115230	115237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018486	ATAA	2	8	117625	117632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018486	TAGA	2	8	120097	120104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018486	AAGA	2	8	122623	122630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018486	GAAA	2	8	125608	125615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018486	AAGT	2	8	126173	126180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018486	TGTA	2	8	126235	126242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018486	TAAT	2	8	129608	129615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018486	AATA	2	8	129836	129843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018486	AATA	2	8	131588	131595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018486	ACAA	2	8	132210	132217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018486	AAAT	2	8	132229	132236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018486	TAAT	2	8	135915	135922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018486	ATTA	2	8	136017	136024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018486	TTGA	2	8	136549	136556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018486	ATTT	2	8	142017	142024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018486	AATA	2	8	142027	142034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018486	CGGA	2	8	142214	142221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018486	ATTT	2	8	142292	142299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018486	TGTA	2	8	144240	144247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018486	TAAA	2	8	144541	144548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018486	ATTC	2	8	145373	145380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018486	CACT	2	8	145901	145908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018486	TTAT	2	8	146230	146237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018486	TGTA	2	8	148133	148140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018486	TAAT	2	8	148227	148234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018486	AGAA	2	8	148339	148346	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018486	AATA	2	8	148349	148356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018486	TAAT	2	8	148373	148380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018486	TAAA	2	8	151971	151978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018486	ATCT	2	8	152201	152208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018486	ATTA	2	8	158017	158024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018486	TAGG	2	8	163508	163515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018486	TCAT	2	8	164418	164425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018486	CTTA	2	8	165559	165566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018486	TATT	2	8	166507	166514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018486	ATTT	2	8	166749	166756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018486	ACAG	2	8	167339	167346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018486	AAAG	2	8	170540	170547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018486	TAAA	2	8	170637	170644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018486	CTTT	2	8	170730	170737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018486	AAAG	2	8	170778	170785	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.