MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 425

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	GTTT	2	8	100	107	0 %	75 %	25 %	0 %	402558637
2	NC_018486	GTAT	2	8	349	356	25 %	50 %	25 %	0 %	402558637
3	NC_018486	AAAT	3	12	1278	1289	75 %	25 %	0 %	0 %	402558638
4	NC_018486	AAAG	2	8	1361	1368	75 %	0 %	25 %	0 %	402558638
5	NC_018486	AATG	2	8	2243	2250	50 %	25 %	25 %	0 %	402558639
6	NC_018486	ATTT	2	8	3008	3015	25 %	75 %	0 %	0 %	402558641
7	NC_018486	TTTA	2	8	3036	3043	25 %	75 %	0 %	0 %	402558641
8	NC_018486	AATG	2	8	3340	3347	50 %	25 %	25 %	0 %	402558642
9	NC_018486	GAAA	2	8	3423	3430	75 %	0 %	25 %	0 %	402558642
10	NC_018486	TTAC	2	8	3586	3593	25 %	50 %	0 %	25 %	402558642
11	NC_018486	AAGT	2	8	3679	3686	50 %	25 %	25 %	0 %	402558642
12	NC_018486	TTGA	2	8	4073	4080	25 %	50 %	25 %	0 %	402558642
13	NC_018486	GAAA	2	8	4121	4128	75 %	0 %	25 %	0 %	402558642
14	NC_018486	ATCT	2	8	4580	4587	25 %	50 %	0 %	25 %	402558643
15	NC_018486	AAGA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	402558643
16	NC_018486	ATTC	2	8	4997	5004	25 %	50 %	0 %	25 %	402558643
17	NC_018486	AAGA	2	8	5299	5306	75 %	0 %	25 %	0 %	402558643
18	NC_018486	TGGA	2	8	5534	5541	25 %	25 %	50 %	0 %	402558643
19	NC_018486	AATT	2	8	5543	5550	50 %	50 %	0 %	0 %	402558643
20	NC_018486	AATT	2	8	6702	6709	50 %	50 %	0 %	0 %	402558644
21	NC_018486	TTTA	2	8	6879	6886	25 %	75 %	0 %	0 %	402558644
22	NC_018486	GGTA	2	8	6975	6982	25 %	25 %	50 %	0 %	402558644
23	NC_018486	GGCA	2	8	7215	7222	25 %	0 %	50 %	25 %	402558644
24	NC_018486	TGGC	2	8	7526	7533	0 %	25 %	50 %	25 %	402558644
25	NC_018486	AACA	2	8	8398	8405	75 %	0 %	0 %	25 %	402558644
26	NC_018486	AAGT	2	8	8657	8664	50 %	25 %	25 %	0 %	402558644
27	NC_018486	TGAA	2	8	8801	8808	50 %	25 %	25 %	0 %	402558644
28	NC_018486	AGCA	2	8	8837	8844	50 %	0 %	25 %	25 %	402558644
29	NC_018486	TGCA	2	8	8900	8907	25 %	25 %	25 %	25 %	402558644
30	NC_018486	TCTG	2	8	9120	9127	0 %	50 %	25 %	25 %	402558644
31	NC_018486	GTAA	2	8	9517	9524	50 %	25 %	25 %	0 %	402558644
32	NC_018486	GAAA	2	8	9561	9568	75 %	0 %	25 %	0 %	402558644
33	NC_018486	CGTT	2	8	9738	9745	0 %	50 %	25 %	25 %	402558644
34	NC_018486	GTAC	2	8	10225	10232	25 %	25 %	25 %	25 %	402558644
35	NC_018486	ACGT	2	8	11649	11656	25 %	25 %	25 %	25 %	402558645
36	NC_018486	TTAC	2	8	11951	11958	25 %	50 %	0 %	25 %	402558645
37	NC_018486	ACCA	2	8	12109	12116	50 %	0 %	0 %	50 %	402558645
38	NC_018486	TGCT	2	8	12926	12933	0 %	50 %	25 %	25 %	402558646
39	NC_018486	TGCT	2	8	13545	13552	0 %	50 %	25 %	25 %	402558647
40	NC_018486	AGTG	2	8	13607	13614	25 %	25 %	50 %	0 %	402558647
41	NC_018486	TAAA	2	8	14238	14245	75 %	25 %	0 %	0 %	402558649
42	NC_018486	CATG	2	8	14363	14370	25 %	25 %	25 %	25 %	402558649
43	NC_018486	TCAA	2	8	14375	14382	50 %	25 %	0 %	25 %	402558649
44	NC_018486	AAAT	2	8	14712	14719	75 %	25 %	0 %	0 %	402558650
45	NC_018486	CATA	2	8	14912	14919	50 %	25 %	0 %	25 %	402558650
46	NC_018486	TAAA	2	8	15081	15088	75 %	25 %	0 %	0 %	402558650
47	NC_018486	TATT	2	8	15944	15951	25 %	75 %	0 %	0 %	402558651
48	NC_018486	AAAT	2	8	16099	16106	75 %	25 %	0 %	0 %	402558651
49	NC_018486	TGAT	2	8	16968	16975	25 %	50 %	25 %	0 %	402558653
50	NC_018486	GAAA	2	8	16996	17003	75 %	0 %	25 %	0 %	402558653
51	NC_018486	TTTA	2	8	17087	17094	25 %	75 %	0 %	0 %	402558653
52	NC_018486	GTTT	2	8	17600	17607	0 %	75 %	25 %	0 %	402558654
53	NC_018486	GAAA	2	8	18064	18071	75 %	0 %	25 %	0 %	402558655
54	NC_018486	TTTA	2	8	18137	18144	25 %	75 %	0 %	0 %	402558655
55	NC_018486	AGCA	2	8	19116	19123	50 %	0 %	25 %	25 %	402558657
56	NC_018486	GAAG	2	8	19198	19205	50 %	0 %	50 %	0 %	402558657
57	NC_018486	TTAG	2	8	19496	19503	25 %	50 %	25 %	0 %	402558657
58	NC_018486	TAAA	2	8	19776	19783	75 %	25 %	0 %	0 %	402558658
59	NC_018486	TTAT	2	8	20522	20529	25 %	75 %	0 %	0 %	402558659
60	NC_018486	TTTC	2	8	20842	20849	0 %	75 %	0 %	25 %	402558660
61	NC_018486	GGTT	2	8	20861	20868	0 %	50 %	50 %	0 %	402558660
62	NC_018486	AAGG	2	8	21241	21248	50 %	0 %	50 %	0 %	402558661
63	NC_018486	ATTT	2	8	21414	21421	25 %	75 %	0 %	0 %	402558661
64	NC_018486	TATC	2	8	21440	21447	25 %	50 %	0 %	25 %	402558661
65	NC_018486	TAAT	2	8	21486	21493	50 %	50 %	0 %	0 %	402558661
66	NC_018486	TAGC	2	8	22615	22622	25 %	25 %	25 %	25 %	402558663
67	NC_018486	TCTT	2	8	22788	22795	0 %	75 %	0 %	25 %	402558663
68	NC_018486	AGAA	2	8	22875	22882	75 %	0 %	25 %	0 %	402558663
69	NC_018486	CTTG	2	8	22995	23002	0 %	50 %	25 %	25 %	402558663
70	NC_018486	TAAA	2	8	23005	23012	75 %	25 %	0 %	0 %	402558663
71	NC_018486	TAAC	2	8	23028	23035	50 %	25 %	0 %	25 %	402558663
72	NC_018486	GAAT	2	8	23439	23446	50 %	25 %	25 %	0 %	402558663
73	NC_018486	GGTT	2	8	23747	23754	0 %	50 %	50 %	0 %	402558664
74	NC_018486	TAAA	2	8	24448	24455	75 %	25 %	0 %	0 %	402558665
75	NC_018486	AACC	2	8	26832	26839	50 %	0 %	0 %	50 %	402558666
76	NC_018486	ACGA	2	8	26985	26992	50 %	0 %	25 %	25 %	402558666
77	NC_018486	ATTT	2	8	27240	27247	25 %	75 %	0 %	0 %	402558666
78	NC_018486	TCTT	2	8	27527	27534	0 %	75 %	0 %	25 %	402558666
79	NC_018486	TTTA	2	8	27643	27650	25 %	75 %	0 %	0 %	402558666
80	NC_018486	AAAC	2	8	27838	27845	75 %	0 %	0 %	25 %	402558666
81	NC_018486	TTCA	2	8	28750	28757	25 %	50 %	0 %	25 %	402558668
82	NC_018486	ATTT	2	8	29374	29381	25 %	75 %	0 %	0 %	402558670
83	NC_018486	GGAG	2	8	29704	29711	25 %	0 %	75 %	0 %	402558671
84	NC_018486	CTTT	2	8	30709	30716	0 %	75 %	0 %	25 %	402558673
85	NC_018486	TTTA	2	8	32199	32206	25 %	75 %	0 %	0 %	402558677
86	NC_018486	ACAA	2	8	33271	33278	75 %	0 %	0 %	25 %	402558678
87	NC_018486	ACAT	2	8	33428	33435	50 %	25 %	0 %	25 %	402558678
88	NC_018486	ATAC	2	8	33809	33816	50 %	25 %	0 %	25 %	402558678
89	NC_018486	ATAC	2	8	33927	33934	50 %	25 %	0 %	25 %	402558678
90	NC_018486	AATT	2	8	34523	34530	50 %	50 %	0 %	0 %	402558679
91	NC_018486	AATA	2	8	34695	34702	75 %	25 %	0 %	0 %	402558679
92	NC_018486	AATG	2	8	35423	35430	50 %	25 %	25 %	0 %	402558680
93	NC_018486	AATT	2	8	35479	35486	50 %	50 %	0 %	0 %	402558680
94	NC_018486	AGTG	2	8	35510	35517	25 %	25 %	50 %	0 %	402558680
95	NC_018486	AAAT	2	8	36007	36014	75 %	25 %	0 %	0 %	402558680
96	NC_018486	AAAG	2	8	36093	36100	75 %	0 %	25 %	0 %	402558680
97	NC_018486	ATCA	2	8	36766	36773	50 %	25 %	0 %	25 %	402558680
98	NC_018486	CTTA	2	8	36781	36788	25 %	50 %	0 %	25 %	402558680
99	NC_018486	ATGA	2	8	37077	37084	50 %	25 %	25 %	0 %	402558681
100	NC_018486	AACA	2	8	37114	37121	75 %	0 %	0 %	25 %	402558681
101	NC_018486	GATT	2	8	37154	37161	25 %	50 %	25 %	0 %	402558681
102	NC_018486	ATTT	2	8	38778	38785	25 %	75 %	0 %	0 %	402558683
103	NC_018486	TAAT	2	8	38878	38885	50 %	50 %	0 %	0 %	402558683
104	NC_018486	ATTT	2	8	39529	39536	25 %	75 %	0 %	0 %	402558684
105	NC_018486	ATGA	2	8	39756	39763	50 %	25 %	25 %	0 %	402558684
106	NC_018486	TAAA	2	8	39842	39849	75 %	25 %	0 %	0 %	402558684
107	NC_018486	CTTA	2	8	40051	40058	25 %	50 %	0 %	25 %	402558684
108	NC_018486	GATT	2	8	40111	40118	25 %	50 %	25 %	0 %	402558684
109	NC_018486	ATAA	2	8	40215	40222	75 %	25 %	0 %	0 %	402558684
110	NC_018486	TAAA	2	8	41174	41181	75 %	25 %	0 %	0 %	402558686
111	NC_018486	AAAG	2	8	41293	41300	75 %	0 %	25 %	0 %	402558686
112	NC_018486	AAAG	2	8	41400	41407	75 %	0 %	25 %	0 %	402558686
113	NC_018486	TTTG	2	8	42050	42057	0 %	75 %	25 %	0 %	402558687
114	NC_018486	CTCC	2	8	43021	43028	0 %	25 %	0 %	75 %	402558688
115	NC_018486	TAAT	2	8	43397	43404	50 %	50 %	0 %	0 %	402558688
116	NC_018486	TTTA	2	8	43935	43942	25 %	75 %	0 %	0 %	402558689
117	NC_018486	GTAA	2	8	43966	43973	50 %	25 %	25 %	0 %	402558689
118	NC_018486	GTCA	2	8	45241	45248	25 %	25 %	25 %	25 %	402558691
119	NC_018486	AGGT	2	8	45593	45600	25 %	25 %	50 %	0 %	402558691
120	NC_018486	CTCC	2	8	46110	46117	0 %	25 %	0 %	75 %	402558691
121	NC_018486	AAAG	2	8	46506	46513	75 %	0 %	25 %	0 %	402558691
122	NC_018486	AACA	2	8	46886	46893	75 %	0 %	0 %	25 %	402558692
123	NC_018486	CTTT	2	8	49905	49912	0 %	75 %	0 %	25 %	402558695
124	NC_018486	GGAG	2	8	50301	50308	25 %	0 %	75 %	0 %	402558695
125	NC_018486	ACCT	2	8	50818	50825	25 %	25 %	0 %	50 %	402558695
126	NC_018486	TGAC	2	8	51170	51177	25 %	25 %	25 %	25 %	402558695
127	NC_018486	ATTG	2	8	51802	51809	25 %	50 %	25 %	0 %	402558696
128	NC_018486	TTTA	2	8	51817	51824	25 %	75 %	0 %	0 %	402558696
129	NC_018486	GATT	2	8	52655	52662	25 %	50 %	25 %	0 %	402558696
130	NC_018486	TGCT	2	8	53503	53510	0 %	50 %	25 %	25 %	402558696
131	NC_018486	TTTG	2	8	53537	53544	0 %	75 %	25 %	0 %	402558696
132	NC_018486	CATA	2	8	53970	53977	50 %	25 %	0 %	25 %	402558696
133	NC_018486	CCAG	2	8	54262	54269	25 %	0 %	25 %	50 %	402558696
134	NC_018486	TCGA	2	8	54745	54752	25 %	25 %	25 %	25 %	402558697
135	NC_018486	TCAT	2	8	54860	54867	25 %	50 %	0 %	25 %	402558697
136	NC_018486	GATA	2	8	54871	54878	50 %	25 %	25 %	0 %	402558697
137	NC_018486	CTCA	2	8	58966	58973	25 %	25 %	0 %	50 %	402558699
138	NC_018486	ATTA	2	8	59115	59122	50 %	50 %	0 %	0 %	402558699
139	NC_018486	TTCG	2	8	59633	59640	0 %	50 %	25 %	25 %	402558699
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.