MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylocystis sp. SC2

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018485	TAGGCG	2	12	32721	32732	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018485	GTGATG	2	12	56481	56492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018485	GTGATG	2	12	56499	56510	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018485	TGGCCT	2	12	60074	60085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018485	AAGCGC	2	12	81625	81636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018485	CATTCC	2	12	99484	99495	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018485	CACTCT	2	12	154491	154502	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018485	GGCGAC	2	12	180074	180085	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018485	AATATC	2	12	212107	212118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018485	CCGCGC	2	12	228787	228798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018485	CTTAAA	2	12	259955	259966	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018485	GTTTGC	2	12	276706	276717	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018485	ACGAAG	2	12	363526	363537	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018485	CGAGCG	2	12	390370	390381	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018485	ATTCGC	2	12	393957	393968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018485	GACCGC	2	12	439928	439939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018485	CGGAGC	2	12	465224	465235	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018485	CTAAAA	2	12	469953	469964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018485	CGGGGT	2	12	517161	517172	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018485	TGAGCG	2	12	521407	521418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018485	GAAAAA	2	12	566024	566035	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018485	CCCCAA	2	12	581416	581427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018485	TGGTCT	2	12	582738	582749	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018485	GACGCG	2	12	596032	596043	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018485	ATTCGG	2	12	613869	613880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018485	GCAAGC	2	12	663886	663897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018485	GACGGC	2	12	709251	709262	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018485	AGGAAA	2	12	766619	766630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018485	CGTCCT	2	12	826628	826639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018485	GGCGAC	2	12	834821	834832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018485	GCGCCG	2	12	840588	840599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018485	GCGCTC	2	12	896392	896403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018485	GGCTGA	2	12	924629	924640	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018485	GGCGCC	2	12	932581	932592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018485	TCTACC	2	12	997969	997980	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018485	TCGCAA	2	12	1003258	1003269	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018485	GGTCGG	2	12	1018603	1018614	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018485	AATTGC	2	12	1035412	1035423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018485	TAACCA	2	12	1048315	1048326	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018485	ACGCCT	2	12	1052208	1052219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018485	TTTTGA	2	12	1098607	1098618	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018485	ATTTTC	2	12	1132655	1132666	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018485	TAACGC	2	12	1140882	1140893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018485	GCGCCG	2	12	1177430	1177441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018485	TGTCGA	2	12	1199456	1199467	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018485	TCCCCG	2	12	1266856	1266867	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018485	ACATCT	2	12	1272324	1272335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018485	CGCATG	2	12	1287540	1287551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018485	GTTTGC	2	12	1306752	1306763	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018485	CCGAGA	2	12	1332273	1332284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018485	GAGCCG	2	12	1338421	1338432	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018485	GCGACG	2	12	1358373	1358384	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018485	CGCCCC	2	12	1358662	1358673	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
54	NC_018485	CGCGCC	2	12	1383399	1383410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018485	AATCGC	2	12	1431168	1431179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018485	GGGAGA	2	12	1441324	1441335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018485	CGATGG	2	12	1471349	1471360	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018485	GAGGCG	2	12	1484837	1484848	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_018485	TTTTGA	2	12	1507225	1507236	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018485	TTCCGC	2	12	1517118	1517129	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018485	TTCTAT	2	12	1538039	1538050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018485	GACGCG	2	12	1666194	1666205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018485	GGCGTC	2	12	1683278	1683289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018485	GCGCTG	2	12	1711122	1711133	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018485	TTTTGA	2	12	1756251	1756262	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018485	ATTTTG	2	12	1812106	1812117	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018485	GACGCG	2	12	1863375	1863386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018485	GACCCG	2	12	1886285	1886296	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018485	GGCCGA	2	12	1888789	1888800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018485	TTCCCT	2	12	1915877	1915888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018485	CGTTAA	2	12	2079208	2079219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_018485	TTCGCC	2	12	2082406	2082417	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018485	GCCTTC	2	12	2086011	2086022	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018485	ATCTTG	2	12	2137276	2137287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_018485	GCGGGC	2	12	2168406	2168417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018485	AGCGCA	2	12	2175976	2175987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018485	AAAAGA	2	12	2196547	2196558	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018485	GGCCGG	2	12	2216590	2216601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018485	GCCAGA	2	12	2240584	2240595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018485	GGCGCC	2	12	2286320	2286331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018485	GCGTCC	2	12	2309418	2309429	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018485	TCAAAA	2	12	2325633	2325644	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018485	GGGAGA	2	12	2337161	2337172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018485	TCAAAA	2	12	2390406	2390417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018485	CTGCGC	2	12	2391284	2391295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018485	AAGCTA	2	12	2423192	2423203	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018485	CCGGAG	2	12	2496768	2496779	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018485	CCCCAT	2	12	2510521	2510532	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018485	CGCTCG	2	12	2521602	2521613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018485	GATCGA	2	12	2547177	2547188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018485	TCATCT	2	12	2596729	2596740	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018485	TCAAAA	2	12	2655066	2655077	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018485	GCCTTT	2	12	2679213	2679224	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018485	CGCAAC	2	12	2700772	2700783	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018485	TCCACG	2	12	2738325	2738336	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018485	CTTGGT	2	12	2803299	2803310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018485	GCTCGC	2	12	2846369	2846380	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018485	TCAAAA	2	12	2867311	2867322	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018485	AAAGGC	2	12	2868271	2868282	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018485	GGACAC	2	12	2869875	2869886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018485	GGCGCA	2	12	2874241	2874252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018485	CGCTTT	2	12	2899058	2899069	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018485	CCGCGC	2	12	2904563	2904574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_018485	TCGCTG	2	12	2932673	2932684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018485	AGGACG	2	12	2990894	2990905	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018485	TTAGCC	2	12	3016365	3016376	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018485	GAGGCG	2	12	3056627	3056638	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018485	TCAAAA	2	12	3063036	3063047	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018485	TCAAAA	2	12	3120122	3120133	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018485	GCCGGC	2	12	3135647	3135658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018485	GCCCGC	2	12	3204223	3204234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_018485	TTTTGA	2	12	3221036	3221047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018485	CGTCGC	2	12	3286483	3286494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018485	GGTTCG	2	12	3306576	3306587	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018485	ATGGCG	2	12	3329568	3329579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018485	AGGACG	2	12	3357014	3357025	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018485	TCTCCT	2	12	3368584	3368595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018485	TCAAAA	2	12	3373551	3373562	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018485	AAGGAC	2	12	3387293	3387304	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_018485	CTCCCT	2	12	3407270	3407281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_018485	TCGCGC	2	12	3407392	3407403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018485	TTCGCA	2	12	3417530	3417541	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018485	GGCGAC	2	12	3423144	3423155	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018485	TCGTCC	2	12	3434388	3434399	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018485	TCCGCC	2	12	3447680	3447691	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018485	CCGCCC	2	12	3447696	3447707	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
127	NC_018485	CGGGCG	2	12	3460026	3460037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018485	GAGCCA	2	12	3486545	3486556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018485	TCGGGC	2	12	3510801	3510812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018485	ATTTTG	2	12	3541451	3541462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018485	CCCTTC	2	12	3620537	3620548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018485	CGCTTT	2	12	3648612	3648623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018485	CAAAAG	2	12	3652966	3652977	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_018485	CGCCGG	2	12	3668096	3668107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018485	GTTAAG	2	12	3679334	3679345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018485	GCCTTT	2	12	3697119	3697130	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018485	GACGGC	2	12	3773364	3773375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.