MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Phaeobacter gallaeciensis 2.10 plasmid pPGA2_95

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018423	GCGCG	2	10	1785	1794	0 %	0 %	60 %	40 %	400760246
2	NC_018423	GGATG	2	10	2622	2631	20 %	20 %	60 %	0 %	400760246
3	NC_018423	GATCG	2	10	3727	3736	20 %	20 %	40 %	20 %	400760247
4	NC_018423	CCGCG	2	10	4872	4881	0 %	0 %	40 %	60 %	400760248
5	NC_018423	GGCGG	2	10	4931	4940	0 %	0 %	80 %	20 %	400760248
6	NC_018423	CCGAT	2	10	5867	5876	20 %	20 %	20 %	40 %	400760249
7	NC_018423	ATCTG	2	10	7022	7031	20 %	40 %	20 %	20 %	400760249
8	NC_018423	CCGCG	2	10	9260	9269	0 %	0 %	40 %	60 %	400760252
9	NC_018423	CGGTC	2	10	9363	9372	0 %	20 %	40 %	40 %	400760252
10	NC_018423	GTCGG	2	10	9951	9960	0 %	20 %	60 %	20 %	400760253
11	NC_018423	AATAA	2	10	10338	10347	80 %	20 %	0 %	0 %	400760253
12	NC_018423	CAGAG	2	10	10552	10561	40 %	0 %	40 %	20 %	400760254
13	NC_018423	GGCGC	2	10	11150	11159	0 %	0 %	60 %	40 %	400760254
14	NC_018423	GGATC	2	10	11672	11681	20 %	20 %	40 %	20 %	400760254
15	NC_018423	CAGTC	2	10	11824	11833	20 %	20 %	20 %	40 %	400760255
16	NC_018423	ACTGT	2	10	14445	14454	20 %	40 %	20 %	20 %	400760256
17	NC_018423	AGTTC	2	10	14658	14667	20 %	40 %	20 %	20 %	400760257
18	NC_018423	CAGCA	2	10	17624	17633	40 %	0 %	20 %	40 %	400760258
19	NC_018423	CAGAA	2	10	17996	18005	60 %	0 %	20 %	20 %	400760258
20	NC_018423	TCGGA	2	10	18188	18197	20 %	20 %	40 %	20 %	400760258
21	NC_018423	CCGCG	2	10	18423	18432	0 %	0 %	40 %	60 %	400760258
22	NC_018423	GGTTT	2	10	20972	20981	0 %	60 %	40 %	0 %	400760259
23	NC_018423	CAGTG	2	10	21640	21649	20 %	20 %	40 %	20 %	400760259
24	NC_018423	GAGCC	2	10	22504	22513	20 %	0 %	40 %	40 %	400760259
25	NC_018423	CGTTG	2	10	24634	24643	0 %	40 %	40 %	20 %	400760261
26	NC_018423	GGATC	2	10	25431	25440	20 %	20 %	40 %	20 %	400760262
27	NC_018423	CAGTT	2	10	26371	26380	20 %	40 %	20 %	20 %	400760262
28	NC_018423	CGATC	2	10	27645	27654	20 %	20 %	20 %	40 %	400760263
29	NC_018423	GATTT	2	10	35169	35178	20 %	60 %	20 %	0 %	400760268
30	NC_018423	CTGGC	2	10	37063	37072	0 %	20 %	40 %	40 %	400760270
31	NC_018423	GCCAA	2	10	37643	37652	40 %	0 %	20 %	40 %	400760271
32	NC_018423	CATGT	2	10	40819	40828	20 %	40 %	20 %	20 %	400760274
33	NC_018423	TGATG	2	10	41388	41397	20 %	40 %	40 %	0 %	400760274
34	NC_018423	CGCCC	2	10	41458	41467	0 %	0 %	20 %	80 %	400760274
35	NC_018423	TGCGG	2	10	42369	42378	0 %	20 %	60 %	20 %	400760275
36	NC_018423	CGCAG	2	10	44324	44333	20 %	0 %	40 %	40 %	400760277
37	NC_018423	GGATC	2	10	44559	44568	20 %	20 %	40 %	20 %	400760277
38	NC_018423	GACCG	2	10	44620	44629	20 %	0 %	40 %	40 %	400760277
39	NC_018423	GATCA	2	10	44953	44962	40 %	20 %	20 %	20 %	400760277
40	NC_018423	GGCGC	2	10	45351	45360	0 %	0 %	60 %	40 %	400760277
41	NC_018423	TGATC	2	10	47771	47780	20 %	40 %	20 %	20 %	400760279
42	NC_018423	GTCGC	2	10	49177	49186	0 %	20 %	40 %	40 %	400760280
43	NC_018423	GCCGG	2	10	53915	53924	0 %	0 %	60 %	40 %	400760284
44	NC_018423	ATGGC	2	10	56530	56539	20 %	20 %	40 %	20 %	400760285
45	NC_018423	ACCGC	2	10	57518	57527	20 %	0 %	20 %	60 %	400760286
46	NC_018423	AGACC	2	10	62024	62033	40 %	0 %	20 %	40 %	400760291
47	NC_018423	GCCCG	2	10	62457	62466	0 %	0 %	40 %	60 %	400760291
48	NC_018423	GCCGG	2	10	63407	63416	0 %	0 %	60 %	40 %	400760292
49	NC_018423	AGGCC	2	10	64250	64259	20 %	0 %	40 %	40 %	400760293
50	NC_018423	GGCAG	2	10	64325	64334	20 %	0 %	60 %	20 %	400760293
51	NC_018423	CCGCG	2	10	65136	65145	0 %	0 %	40 %	60 %	400760293
52	NC_018423	GACCG	2	10	66345	66354	20 %	0 %	40 %	40 %	400760294
53	NC_018423	CGGCA	2	10	67405	67414	20 %	0 %	40 %	40 %	400760294
54	NC_018423	GAGCC	2	10	67543	67552	20 %	0 %	40 %	40 %	400760294
55	NC_018423	CTGAT	2	10	68466	68475	20 %	40 %	20 %	20 %	400760295
56	NC_018423	ACCGC	2	10	69332	69341	20 %	0 %	20 %	60 %	400760295
57	NC_018423	GACCG	2	10	69602	69611	20 %	0 %	40 %	40 %	400760295
58	NC_018423	CCCGG	2	10	70504	70513	0 %	0 %	40 %	60 %	400760296
59	NC_018423	CTGAC	2	10	74192	74201	20 %	20 %	20 %	40 %	400760299
60	NC_018423	CAACC	2	10	75828	75837	40 %	0 %	0 %	60 %	400760301
61	NC_018423	GCAGG	2	10	77221	77230	20 %	0 %	60 %	20 %	400760302
62	NC_018423	CGGCG	2	10	79791	79800	0 %	0 %	60 %	40 %	400760304
63	NC_018423	TGCGC	2	10	83396	83405	0 %	20 %	40 %	40 %	400760305
64	NC_018423	CCGCC	2	10	83753	83762	0 %	0 %	20 %	80 %	400760305
65	NC_018423	TCCCG	2	10	84257	84266	0 %	20 %	20 %	60 %	400760306
66	NC_018423	CAGGA	2	10	85685	85694	40 %	0 %	40 %	20 %	400760307
67	NC_018423	GACCA	2	10	87487	87496	40 %	0 %	20 %	40 %	400760310
68	NC_018423	AGCCT	2	10	87953	87962	20 %	20 %	20 %	40 %	400760311
69	NC_018423	GCCCG	2	10	88181	88190	0 %	0 %	40 %	60 %	400760312
70	NC_018423	GATCA	2	10	89462	89471	40 %	20 %	20 %	20 %	400760312
71	NC_018423	AGCGC	2	10	91660	91669	20 %	0 %	40 %	40 %	400760314
72	NC_018423	AATTT	2	10	92746	92755	40 %	60 %	0 %	0 %	400760315
73	NC_018423	GATCA	2	10	93084	93093	40 %	20 %	20 %	20 %	400760315
74	NC_018423	GGATC	2	10	93743	93752	20 %	20 %	40 %	20 %	400760315

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.