MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018420	AAATT	2	10	1169	1178	60 %	40 %	0 %	0 %	400406008
2	NC_018420	GAAAA	2	10	1349	1358	80 %	0 %	20 %	0 %	400406008
3	NC_018420	AGGAG	2	10	1901	1910	40 %	0 %	60 %	0 %	400406009
4	NC_018420	AAGAT	2	10	6727	6736	60 %	20 %	20 %	0 %	400406011
5	NC_018420	GAGAC	2	10	7176	7185	40 %	0 %	40 %	20 %	400406011
6	NC_018420	CAAAT	2	10	7664	7673	60 %	20 %	0 %	20 %	400406012
7	NC_018420	TAAGT	2	10	8065	8074	40 %	40 %	20 %	0 %	400406012
8	NC_018420	TAAAA	2	10	9100	9109	80 %	20 %	0 %	0 %	400406012
9	NC_018420	AAAGG	2	10	12047	12056	60 %	0 %	40 %	0 %	400406014
10	NC_018420	ATTAA	2	10	14317	14326	60 %	40 %	0 %	0 %	400406015
11	NC_018420	GGTTG	2	10	16965	16974	0 %	40 %	60 %	0 %	400406016
12	NC_018420	AAAGT	2	10	23625	23634	60 %	20 %	20 %	0 %	400406018
13	NC_018420	CTAGA	2	10	30822	30831	40 %	20 %	20 %	20 %	400406019
14	NC_018420	AGAAA	2	10	35508	35517	80 %	0 %	20 %	0 %	400406021
15	NC_018420	ATTAT	2	10	35862	35871	40 %	60 %	0 %	0 %	400406021
16	NC_018420	ATCCT	2	10	36146	36155	20 %	40 %	0 %	40 %	400406021
17	NC_018420	TACCA	2	10	39397	39406	40 %	20 %	0 %	40 %	400406024
18	NC_018420	TTCCA	2	10	39709	39718	20 %	40 %	0 %	40 %	400406024
19	NC_018420	AATTT	2	10	43553	43562	40 %	60 %	0 %	0 %	400406026
20	NC_018420	AAATA	2	10	46384	46393	80 %	20 %	0 %	0 %	400406028
21	NC_018420	GATAT	2	10	47097	47106	40 %	40 %	20 %	0 %	400406028
22	NC_018420	GCTGA	2	10	49261	49270	20 %	20 %	40 %	20 %	400406029
23	NC_018420	CGTTG	2	10	50388	50397	0 %	40 %	40 %	20 %	400406029
24	NC_018420	TACGT	2	10	52636	52645	20 %	40 %	20 %	20 %	400406030
25	NC_018420	CTCTT	2	10	53894	53903	0 %	60 %	0 %	40 %	400406032
26	NC_018420	AAGGA	2	10	54320	54329	60 %	0 %	40 %	0 %	400406032
27	NC_018420	AGAAA	2	10	54359	54368	80 %	0 %	20 %	0 %	400406032
28	NC_018420	GAGAT	2	10	54590	54599	40 %	20 %	40 %	0 %	400406032
29	NC_018420	AACCC	2	10	54926	54935	40 %	0 %	0 %	60 %	400406032
30	NC_018420	TTTAC	2	10	60708	60717	20 %	60 %	0 %	20 %	400406036
31	NC_018420	ACCAA	2	10	63646	63655	60 %	0 %	0 %	40 %	400406037
32	NC_018420	TTTAC	2	10	78043	78052	20 %	60 %	0 %	20 %	400406041
33	NC_018420	CTTTT	2	10	78639	78648	0 %	80 %	0 %	20 %	400406041
34	NC_018420	TAAAA	2	10	79603	79612	80 %	20 %	0 %	0 %	400406042
35	NC_018420	CGTCA	2	10	79888	79897	20 %	20 %	20 %	40 %	400406042
36	NC_018420	CGTTA	2	10	82627	82636	20 %	40 %	20 %	20 %	400406043
37	NC_018420	GCAAT	2	10	85663	85672	40 %	20 %	20 %	20 %	400406044
38	NC_018420	CTTTT	2	10	88049	88058	0 %	80 %	0 %	20 %	400406046
39	NC_018420	TACTG	2	10	88286	88295	20 %	40 %	20 %	20 %	400406046
40	NC_018420	GGTAT	2	10	88391	88400	20 %	40 %	40 %	0 %	400406046
41	NC_018420	GCTAT	2	10	88560	88569	20 %	40 %	20 %	20 %	400406046
42	NC_018420	TTTTC	2	10	88874	88883	0 %	80 %	0 %	20 %	400406046
43	NC_018420	AACTT	2	10	89105	89114	40 %	40 %	0 %	20 %	400406046
44	NC_018420	TTAAT	2	10	92882	92891	40 %	60 %	0 %	0 %	400406048
45	NC_018420	TGTAT	2	10	94599	94608	20 %	60 %	20 %	0 %	400406049
46	NC_018420	TACAT	2	10	98559	98568	40 %	40 %	0 %	20 %	400406050
47	NC_018420	CCACG	2	10	99954	99963	20 %	0 %	20 %	60 %	400406050
48	NC_018420	TGTCC	2	10	106295	106304	0 %	40 %	20 %	40 %	400406056
49	NC_018420	TAAAC	2	10	109849	109858	60 %	20 %	0 %	20 %	400406057
50	NC_018420	CATTT	2	10	111505	111514	20 %	60 %	0 %	20 %	400406059
51	NC_018420	CAATT	2	10	112282	112291	40 %	40 %	0 %	20 %	400406059
52	NC_018420	ACGAA	2	10	113699	113708	60 %	0 %	20 %	20 %	400406060
53	NC_018420	TAAAA	2	10	125274	125283	80 %	20 %	0 %	0 %	400406063
54	NC_018420	TCGAA	2	10	132243	132252	40 %	20 %	20 %	20 %	400406067
55	NC_018420	ATTTA	2	10	147188	147197	40 %	60 %	0 %	0 %	400406076
56	NC_018420	GCATT	2	10	151993	152002	20 %	40 %	20 %	20 %	400406078
57	NC_018420	CTTAT	2	10	152020	152029	20 %	60 %	0 %	20 %	400406078
58	NC_018420	CATTA	2	10	153026	153035	40 %	40 %	0 %	20 %	400406078
59	NC_018420	TCAAA	2	10	153528	153537	60 %	20 %	0 %	20 %	400406078
60	NC_018420	AGCAA	2	10	157201	157210	60 %	0 %	20 %	20 %	400406081
61	NC_018420	AATAA	2	10	160618	160627	80 %	20 %	0 %	0 %	400406082
62	NC_018420	AAGAG	2	10	163299	163308	60 %	0 %	40 %	0 %	400406084
63	NC_018420	CTATT	2	10	163810	163819	20 %	60 %	0 %	20 %	400406085
64	NC_018420	TTAAA	2	10	168547	168556	60 %	40 %	0 %	0 %	400406088
65	NC_018420	TGAAT	2	10	183237	183246	40 %	40 %	20 %	0 %	400406092
66	NC_018420	AATAC	2	10	190183	190192	60 %	20 %	0 %	20 %	400406095
67	NC_018420	TCAAC	2	10	190217	190226	40 %	20 %	0 %	40 %	400406095
68	NC_018420	ATAAA	2	10	194460	194469	80 %	20 %	0 %	0 %	400406097
69	NC_018420	TTCTA	2	10	194479	194488	20 %	60 %	0 %	20 %	400406097
70	NC_018420	AAATA	2	10	194494	194503	80 %	20 %	0 %	0 %	400406097
71	NC_018420	TTATT	2	10	197678	197687	20 %	80 %	0 %	0 %	400406098
72	NC_018420	AGTGG	2	10	199498	199507	20 %	20 %	60 %	0 %	400406098
73	NC_018420	CAAAT	2	10	199777	199786	60 %	20 %	0 %	20 %	400406098
74	NC_018420	AAAAT	2	10	203178	203187	80 %	20 %	0 %	0 %	400406100
75	NC_018420	TTTAG	2	10	204238	204247	20 %	60 %	20 %	0 %	400406101
76	NC_018420	AAAAT	2	10	204954	204963	80 %	20 %	0 %	0 %	400406102
77	NC_018420	AACTG	2	10	205444	205453	40 %	20 %	20 %	20 %	400406102
78	NC_018420	AAAAG	2	10	214040	214049	80 %	0 %	20 %	0 %	400406107
79	NC_018420	TAGAA	2	10	221429	221438	60 %	20 %	20 %	0 %	400406110
80	NC_018420	GATCA	2	10	226384	226393	40 %	20 %	20 %	20 %	400406113
81	NC_018420	TAAAA	2	10	229734	229743	80 %	20 %	0 %	0 %	400406115
82	NC_018420	ATGGA	2	10	230674	230683	40 %	20 %	40 %	0 %	400406116
83	NC_018420	ATTTC	2	10	232923	232932	20 %	60 %	0 %	20 %	400406117
84	NC_018420	TGATT	2	10	233103	233112	20 %	60 %	20 %	0 %	400406117
85	NC_018420	CGCTA	2	10	233176	233185	20 %	20 %	20 %	40 %	400406117
86	NC_018420	TAAAA	2	10	236493	236502	80 %	20 %	0 %	0 %	400406118
87	NC_018420	TTTTA	2	10	239346	239355	20 %	80 %	0 %	0 %	400406120
88	NC_018420	TGTTC	2	10	240718	240727	0 %	60 %	20 %	20 %	400406121
89	NC_018420	AATTA	2	10	245336	245345	60 %	40 %	0 %	0 %	400406125
90	NC_018420	TATCA	2	10	252467	252476	40 %	40 %	0 %	20 %	400406127
91	NC_018420	GAAAA	2	10	253546	253555	80 %	0 %	20 %	0 %	400406127
92	NC_018420	TTTCT	2	10	260434	260443	0 %	80 %	0 %	20 %	400406132
93	NC_018420	ATACC	2	10	270526	270535	40 %	20 %	0 %	40 %	400406135
94	NC_018420	AAACC	2	10	271002	271011	60 %	0 %	0 %	40 %	400406135
95	NC_018420	TCTAG	2	10	271641	271650	20 %	40 %	20 %	20 %	400406135
96	NC_018420	AATAG	2	10	273465	273474	60 %	20 %	20 %	0 %	400406135
97	NC_018420	TATCT	2	10	274668	274677	20 %	60 %	0 %	20 %	400406136
98	NC_018420	ATATG	2	10	282933	282942	40 %	40 %	20 %	0 %	400406139
99	NC_018420	AATAT	2	10	283277	283286	60 %	40 %	0 %	0 %	400406139
100	NC_018420	AGATA	2	10	284650	284659	60 %	20 %	20 %	0 %	400406140
101	NC_018420	ATAAC	2	10	286039	286048	60 %	20 %	0 %	20 %	400406141
102	NC_018420	TAAAA	2	10	287024	287033	80 %	20 %	0 %	0 %	400406142
103	NC_018420	CAACA	2	10	291564	291573	60 %	0 %	0 %	40 %	400406144
104	NC_018420	TATTT	2	10	301345	301354	20 %	80 %	0 %	0 %	400406147
105	NC_018420	TATTT	2	10	301381	301390	20 %	80 %	0 %	0 %	400406147
106	NC_018420	TACAC	2	10	301884	301893	40 %	20 %	0 %	40 %	400406147
107	NC_018420	ATATT	2	10	304699	304708	40 %	60 %	0 %	0 %	400406148
108	NC_018420	TTTGG	2	10	304736	304745	0 %	60 %	40 %	0 %	400406148
109	NC_018420	AATGG	2	10	306670	306679	40 %	20 %	40 %	0 %	400406149
110	NC_018420	AAAGA	2	10	307849	307858	80 %	0 %	20 %	0 %	400406150
111	NC_018420	ATTTT	2	10	308081	308090	20 %	80 %	0 %	0 %	400406150
112	NC_018420	ATTTT	2	10	308759	308768	20 %	80 %	0 %	0 %	400406150
113	NC_018420	CAACA	2	10	312527	312536	60 %	0 %	0 %	40 %	400406152
114	NC_018420	TAAAA	2	10	315996	316005	80 %	20 %	0 %	0 %	400406153
115	NC_018420	ATCAT	2	10	316763	316772	40 %	40 %	0 %	20 %	400406153
116	NC_018420	TTGTA	2	10	319194	319203	20 %	60 %	20 %	0 %	400406154
117	NC_018420	GGATG	2	10	319324	319333	20 %	20 %	60 %	0 %	400406154
118	NC_018420	CAACC	2	10	319587	319596	40 %	0 %	0 %	60 %	400406154
119	NC_018420	TTGGT	2	10	320608	320617	0 %	60 %	40 %	0 %	400406154
120	NC_018420	AATCC	2	10	321800	321809	40 %	20 %	0 %	40 %	400406155
121	NC_018420	TAAAT	2	10	326187	326196	60 %	40 %	0 %	0 %	400406158
122	NC_018420	TGGAG	2	10	332936	332945	20 %	20 %	60 %	0 %	400406162
123	NC_018420	AGAGC	2	10	333544	333553	40 %	0 %	40 %	20 %	400406163
124	NC_018420	TTTCA	2	10	333885	333894	20 %	60 %	0 %	20 %	400406163
125	NC_018420	ACCAA	2	10	337468	337477	60 %	0 %	0 %	40 %	400406165
126	NC_018420	ACGTT	2	10	340401	340410	20 %	40 %	20 %	20 %	400406167
127	NC_018420	CAAAT	2	10	346612	346621	60 %	20 %	0 %	20 %	400406169
128	NC_018420	TTTAT	2	10	349778	349787	20 %	80 %	0 %	0 %	400406170
129	NC_018420	AATGC	2	10	350648	350657	40 %	20 %	20 %	20 %	400406171
130	NC_018420	TTTGA	2	10	355146	355155	20 %	60 %	20 %	0 %	400406173
131	NC_018420	GGAGC	2	10	355245	355254	20 %	0 %	60 %	20 %	400406173
132	NC_018420	CTAAT	2	10	357368	357377	40 %	40 %	0 %	20 %	400406174
133	NC_018420	TCATG	2	10	365310	365319	20 %	40 %	20 %	20 %	400406177
134	NC_018420	TATAT	2	10	366289	366298	40 %	60 %	0 %	0 %	400406177
135	NC_018420	CATTT	2	10	368777	368786	20 %	60 %	0 %	20 %	400406179
136	NC_018420	ATATT	2	10	372068	372077	40 %	60 %	0 %	0 %	400406180
137	NC_018420	TTTGC	2	10	373807	373816	0 %	60 %	20 %	20 %	400406181
138	NC_018420	CGGAG	2	10	373886	373895	20 %	0 %	60 %	20 %	400406181
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149	NC_018420	TGGAT	2	10	402716	402725	20 %	40 %	40 %	0 %	400406200
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261	NC_018420	AAAAT	2	10	745603	745612	80 %	20 %	0 %	0 %	400406395
262	NC_018420	ATGCA	2	10	746989	746998	40 %	20 %	20 %	20 %	400406396
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.