MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana chromosome

Total Repeats: 16782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018420	CAA	2	6	19	24	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406008
2	NC_018420	ATC	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
3	NC_018420	CAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406008
4	NC_018420	TTA	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
5	NC_018420	TAA	2	6	237	242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406008
6	NC_018420	TGC	2	6	260	265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406008
7	NC_018420	ATC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
8	NC_018420	ACA	3	9	276	284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406008
9	NC_018420	TAC	3	9	315	323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
10	NC_018420	GTA	2	6	491	496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406008
11	NC_018420	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
12	NC_018420	TGG	2	6	519	524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406008
13	NC_018420	TAC	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
14	NC_018420	AGA	2	6	663	668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406008
15	NC_018420	ATT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
16	NC_018420	GAT	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406008
17	NC_018420	TAA	2	6	729	734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406008
18	NC_018420	GAA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406008
19	NC_018420	TTA	2	6	775	780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
20	NC_018420	CAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406008
21	NC_018420	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406008
22	NC_018420	CCA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406008
23	NC_018420	TGA	2	6	936	941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406008
24	NC_018420	TTA	2	6	1102	1107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406008
25	NC_018420	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406008
26	NC_018420	TAC	2	6	1162	1167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406008
27	NC_018420	ACG	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406008
28	NC_018420	CGG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400406008
29	NC_018420	AGA	2	6	1371	1376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406008
30	NC_018420	CAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406009
31	NC_018420	AGC	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406009
32	NC_018420	GAA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406009
33	NC_018420	TCA	2	6	1853	1858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406009
34	NC_018420	TTA	2	6	1868	1873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406009
35	NC_018420	AGT	2	6	2009	2014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406009
36	NC_018420	GTG	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400406009
37	NC_018420	TAA	2	6	2294	2299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406009
38	NC_018420	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406009
39	NC_018420	CCT	2	6	2482	2487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400406009
40	NC_018420	CAC	3	9	2515	2523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018420	ACA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018420	AAT	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018420	ATA	2	6	2601	2606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018420	CTT	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018420	TGT	2	6	2796	2801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018420	TAA	2	6	3029	3034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018420	AAT	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018420	TAT	2	6	3228	3233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018420	ATT	2	6	3256	3261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018420	AAT	2	6	3289	3294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018420	TAT	2	6	3310	3315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018420	ACC	2	6	3611	3616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406010
53	NC_018420	CTT	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406010
54	NC_018420	TTA	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018420	TAT	2	6	3921	3926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018420	TCA	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018420	TAA	2	6	4052	4057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018420	AAC	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018420	TAT	2	6	4157	4162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018420	ATT	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018420	TAA	2	6	4192	4197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018420	ATT	2	6	4286	4291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018420	ATA	2	6	4357	4362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018420	TCA	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018420	GAA	2	6	4545	4550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018420	TAA	2	6	4719	4724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018420	GAT	2	6	4739	4744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018420	ATT	2	6	4779	4784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018420	TAA	2	6	4819	4824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018420	TTA	2	6	4835	4840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018420	CAT	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018420	TGA	2	6	4911	4916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018420	TAG	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018420	CTT	2	6	4990	4995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018420	CAA	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018420	AAT	2	6	5093	5098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018420	CAA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018420	ACT	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018420	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018420	ATA	2	6	5347	5352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018420	TTA	2	6	5376	5381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018420	TAA	2	6	5443	5448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018420	TAA	2	6	5576	5581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018420	TTA	2	6	5710	5715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018420	ATT	2	6	5779	5784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018420	AAT	2	6	5791	5796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018420	ATT	2	6	5810	5815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018420	ATA	4	12	5849	5860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
89	NC_018420	TGA	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
90	NC_018420	CTT	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406011
91	NC_018420	AAT	2	6	5972	5977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
92	NC_018420	TTC	2	6	5983	5988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406011
93	NC_018420	TCA	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406011
94	NC_018420	CAA	2	6	6086	6091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406011
95	NC_018420	CCA	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406011
96	NC_018420	ACC	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406011
97	NC_018420	AGT	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
98	NC_018420	TCA	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406011
99	NC_018420	TAA	2	6	6398	6403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
100	NC_018420	GAA	2	6	6462	6467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406011
101	NC_018420	ATT	2	6	6482	6487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406011
102	NC_018420	TGA	2	6	6528	6533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
103	NC_018420	ACC	2	6	6555	6560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400406011
104	NC_018420	ATT	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406011
105	NC_018420	ATA	2	6	6760	6765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
106	NC_018420	AGC	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406011
107	NC_018420	TAA	2	6	6872	6877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
108	NC_018420	ATA	2	6	6884	6889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
109	NC_018420	AGT	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
110	NC_018420	TAG	3	9	7219	7227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406011
111	NC_018420	AAT	2	6	7337	7342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
112	NC_018420	TGC	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406011
113	NC_018420	GCA	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406011
114	NC_018420	GCT	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406011
115	NC_018420	GCT	2	6	7454	7459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406011
116	NC_018420	TAA	2	6	7463	7468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
117	NC_018420	TAA	2	6	7471	7476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
118	NC_018420	AAT	2	6	7497	7502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406011
119	NC_018420	AAG	2	6	7575	7580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406012
120	NC_018420	AGC	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406012
121	NC_018420	TTG	2	6	7633	7638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406012
122	NC_018420	TAA	2	6	7683	7688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406012
123	NC_018420	TGA	2	6	7697	7702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406012
124	NC_018420	TAA	2	6	7704	7709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406012
125	NC_018420	GAC	2	6	7722	7727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406012
126	NC_018420	TCA	2	6	7793	7798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406012
127	NC_018420	TCT	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406012
128	NC_018420	CAA	2	6	8178	8183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406012
129	NC_018420	ATA	2	6	8250	8255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406012
130	NC_018420	ATT	2	6	8263	8268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406012
131	NC_018420	ATT	2	6	8332	8337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406012
132	NC_018420	CAG	2	6	8361	8366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406012
133	NC_018420	CTA	2	6	8532	8537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406012
134	NC_018420	AGA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406012
135	NC_018420	CAG	2	6	8760	8765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406012
136	NC_018420	TAT	2	6	8821	8826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406012
137	NC_018420	CAT	2	6	8863	8868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406012
138	NC_018420	ATC	2	6	8876	8881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406012
139	NC_018420	GAA	2	6	9042	9047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406012
140	NC_018420	TAT	2	6	9142	9147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406012
141	NC_018420	TAA	2	6	9165	9170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406012
142	NC_018420	ATC	2	6	9212	9217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406012
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144	NC_018420	TAA	2	6	9558	9563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018420	TTA	2	6	9647	9652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018420	TTA	2	6	9674	9679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018420	ATA	2	6	9683	9688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_018420	TTA	2	6	9814	9819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018420	TAA	2	6	9828	9833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018420	TGT	2	6	9834	9839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018420	CAA	2	6	9907	9912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_018420	TTA	2	6	9961	9966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018420	TCA	2	6	10015	10020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_018420	CAT	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_018420	TAA	2	6	10103	10108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018420	TAA	2	6	10203	10208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018420	GAT	2	6	10239	10244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018420	TAA	2	6	10434	10439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018420	ATC	2	6	10464	10469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_018420	TAA	2	6	10583	10588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018420	ATT	2	6	10614	10619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018420	ACT	2	6	10648	10653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_018420	ATG	2	6	10814	10819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018420	TAT	2	6	10915	10920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_018420	ATC	2	6	10987	10992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_018420	AAT	2	6	11039	11044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_018420	AAT	2	6	11067	11072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018420	TAA	2	6	11196	11201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018420	TAA	2	6	11266	11271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406013
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262	NC_018420	ATT	2	6	16858	16863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_018420	ACA	2	6	17403	17408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406016
270	NC_018420	ATT	2	6	17425	17430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406016
271	NC_018420	TCA	2	6	17447	17452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406016
272	NC_018420	GTT	2	6	17486	17491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406016
273	NC_018420	ATT	2	6	17498	17503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406016
274	NC_018420	GAT	2	6	17504	17509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406016
275	NC_018420	TTA	2	6	17525	17530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406016
276	NC_018420	CTT	2	6	17608	17613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400406016
277	NC_018420	ATT	2	6	17676	17681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400406016
278	NC_018420	CGT	2	6	17730	17735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400406016
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280	NC_018420	GTT	2	6	17853	17858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400406016
281	NC_018420	TGA	2	6	17903	17908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400406016
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283	NC_018420	ACT	2	6	18011	18016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400406016
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286	NC_018420	AGA	2	6	18212	18217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400406016
287	NC_018420	CAA	2	6	18429	18434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400406016
288	NC_018420	TAA	2	6	18536	18541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400406016
289	NC_018420	GCA	3	9	18576	18584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400406016
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291	NC_018420	ATT	2	6	18746	18751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018420	ATT	2	6	18807	18812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_018420	TAA	2	6	18919	18924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_018420	TAA	2	6	18958	18963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018420	AAT	2	6	18990	18995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_018420	TAA	2	6	19146	19151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_018420	AAT	2	6	19325	19330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_018420	ACA	2	6	19336	19341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_018420	ATA	2	6	19372	19377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_018420	TAA	2	6	19385	19390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_018420	GGA	2	6	19739	19744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
302	NC_018420	CTC	2	6	19816	19821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
303	NC_018420	ATA	2	6	19823	19828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_018420	TTA	2	6	19930	19935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_018420	ATT	2	6	19940	19945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_018420	TTA	2	6	20284	20289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_018420	TTA	2	6	20302	20307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_018420	ATT	2	6	20315	20320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_018420	TAA	2	6	20453	20458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_018420	TTA	2	6	25619	25624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_018420	ATA	2	6	25718	25723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_018420	TAA	2	6	25774	25779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_018420	TAA	2	6	25812	25817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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