MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV chromosome

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018418	AATAT	2	10	4	13	60 %	40 %	0 %	0 %	400404724
2	NC_018418	TTATA	2	10	2285	2294	40 %	60 %	0 %	0 %	400404725
3	NC_018418	AAAAT	2	10	2727	2736	80 %	20 %	0 %	0 %	400404725
4	NC_018418	TAATA	2	10	3009	3018	60 %	40 %	0 %	0 %	400404726
5	NC_018418	AATTT	2	10	3379	3388	40 %	60 %	0 %	0 %	400404726
6	NC_018418	AAATA	2	10	3891	3900	80 %	20 %	0 %	0 %	400404728
7	NC_018418	AAATA	2	10	4545	4554	80 %	20 %	0 %	0 %	400404730
8	NC_018418	TATTT	2	10	5141	5150	20 %	80 %	0 %	0 %	400404730
9	NC_018418	AAAAT	2	10	5666	5675	80 %	20 %	0 %	0 %	400404730
10	NC_018418	AAAAT	2	10	5692	5701	80 %	20 %	0 %	0 %	400404730
11	NC_018418	AAAAT	2	10	6481	6490	80 %	20 %	0 %	0 %	400404731
12	NC_018418	AATTT	2	10	6642	6651	40 %	60 %	0 %	0 %	400404732
13	NC_018418	TAAAT	2	10	8596	8605	60 %	40 %	0 %	0 %	400404734
14	NC_018418	ATTTA	2	10	8809	8818	40 %	60 %	0 %	0 %	400404734
15	NC_018418	TGATG	2	10	10069	10078	20 %	40 %	40 %	0 %	400404736
16	NC_018418	ATTTT	2	10	10529	10538	20 %	80 %	0 %	0 %	400404736
17	NC_018418	TATAA	2	10	11902	11911	60 %	40 %	0 %	0 %	400404737
18	NC_018418	ATTAT	2	10	12324	12333	40 %	60 %	0 %	0 %	400404737
19	NC_018418	ATTTA	2	10	13955	13964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018418	AAATT	2	10	13976	13985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018418	TTAAA	2	10	14628	14637	60 %	40 %	0 %	0 %	400404740
22	NC_018418	TAAAA	2	10	14791	14800	80 %	20 %	0 %	0 %	400404740
23	NC_018418	AATTT	2	10	15170	15179	40 %	60 %	0 %	0 %	400404741
24	NC_018418	TATTT	2	10	15966	15975	20 %	80 %	0 %	0 %	400404741
25	NC_018418	TATTT	2	10	15982	15991	20 %	80 %	0 %	0 %	400404741
26	NC_018418	AAATT	2	10	16735	16744	60 %	40 %	0 %	0 %	400404742
27	NC_018418	ATTTT	2	10	17769	17778	20 %	80 %	0 %	0 %	400404744
28	NC_018418	TTAAA	2	10	17837	17846	60 %	40 %	0 %	0 %	400404744
29	NC_018418	TAAAA	2	10	18151	18160	80 %	20 %	0 %	0 %	400404745
30	NC_018418	TTTTA	2	10	18803	18812	20 %	80 %	0 %	0 %	400404746
31	NC_018418	ATTTA	2	10	19367	19376	40 %	60 %	0 %	0 %	400404746
32	NC_018418	ATAGA	2	10	21436	21445	60 %	20 %	20 %	0 %	400404746
33	NC_018418	TAATT	2	10	22027	22036	40 %	60 %	0 %	0 %	400404747
34	NC_018418	AAATT	2	10	22122	22131	60 %	40 %	0 %	0 %	400404747
35	NC_018418	TAAAT	2	10	22312	22321	60 %	40 %	0 %	0 %	400404747
36	NC_018418	ATTAT	2	10	22787	22796	40 %	60 %	0 %	0 %	400404748
37	NC_018418	AATTA	2	10	22860	22869	60 %	40 %	0 %	0 %	400404748
38	NC_018418	ATTTA	2	10	23100	23109	40 %	60 %	0 %	0 %	400404748
39	NC_018418	TTTAT	2	10	24724	24733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018418	TAAAA	2	10	25967	25976	80 %	20 %	0 %	0 %	400404751
41	NC_018418	AAATT	2	10	26209	26218	60 %	40 %	0 %	0 %	400404751
42	NC_018418	TAATT	2	10	27045	27054	40 %	60 %	0 %	0 %	400404752
43	NC_018418	ATTTT	2	10	28730	28739	20 %	80 %	0 %	0 %	400404753
44	NC_018418	TAAAA	2	10	30263	30272	80 %	20 %	0 %	0 %	400404754
45	NC_018418	GTTTA	2	10	30286	30295	20 %	60 %	20 %	0 %	400404754
46	NC_018418	TTTTA	2	10	30365	30374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018418	AAAAT	2	10	30452	30461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018418	TTTAA	2	10	30462	30471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018418	TTCAA	2	10	31557	31566	40 %	40 %	0 %	20 %	400404755
50	NC_018418	AATTT	2	10	31861	31870	40 %	60 %	0 %	0 %	400404755
51	NC_018418	AAATT	2	10	33110	33119	60 %	40 %	0 %	0 %	400404757
52	NC_018418	TTTTA	2	10	33202	33211	20 %	80 %	0 %	0 %	400404757
53	NC_018418	ATTTT	2	10	33638	33647	20 %	80 %	0 %	0 %	400404758
54	NC_018418	AATTA	2	10	33738	33747	60 %	40 %	0 %	0 %	400404758
55	NC_018418	ATATT	2	10	34036	34045	40 %	60 %	0 %	0 %	400404758
56	NC_018418	AATAA	2	10	34564	34573	80 %	20 %	0 %	0 %	400404759
57	NC_018418	TTTAC	2	10	34655	34664	20 %	60 %	0 %	20 %	400404759
58	NC_018418	ATTTA	2	10	34747	34756	40 %	60 %	0 %	0 %	400404759
59	NC_018418	ATTGA	2	10	36642	36651	40 %	40 %	20 %	0 %	400404762
60	NC_018418	ATTTA	2	10	38055	38064	40 %	60 %	0 %	0 %	400404763
61	NC_018418	TAAAA	2	10	38243	38252	80 %	20 %	0 %	0 %	400404763
62	NC_018418	TAAAA	2	10	40152	40161	80 %	20 %	0 %	0 %	400404765
63	NC_018418	GTTTA	2	10	40254	40263	20 %	60 %	20 %	0 %	400404765
64	NC_018418	ATTTT	2	10	40643	40652	20 %	80 %	0 %	0 %	400404766
65	NC_018418	CCATT	2	10	41073	41082	20 %	40 %	0 %	40 %	400404766
66	NC_018418	ATTTA	2	10	43017	43026	40 %	60 %	0 %	0 %	400404770
67	NC_018418	ATTAA	2	10	43736	43745	60 %	40 %	0 %	0 %	400404771
68	NC_018418	TAATT	2	10	44571	44580	40 %	60 %	0 %	0 %	400404772
69	NC_018418	ATAAA	2	10	45023	45032	80 %	20 %	0 %	0 %	400404772
70	NC_018418	TAAAA	2	10	45445	45454	80 %	20 %	0 %	0 %	400404773
71	NC_018418	TAAAA	2	10	45946	45955	80 %	20 %	0 %	0 %	400404773
72	NC_018418	ATTTT	2	10	46048	46057	20 %	80 %	0 %	0 %	400404773
73	NC_018418	ATTTT	2	10	46350	46359	20 %	80 %	0 %	0 %	400404773
74	NC_018418	TTTCT	2	10	47148	47157	0 %	80 %	0 %	20 %	400404774
75	NC_018418	ATTTT	2	10	47988	47997	20 %	80 %	0 %	0 %	400404774
76	NC_018418	TATTT	2	10	48230	48239	20 %	80 %	0 %	0 %	400404775
77	NC_018418	TTTTA	2	10	48355	48364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018418	TTAAA	2	10	48676	48685	60 %	40 %	0 %	0 %	400404776
79	NC_018418	ATTTT	2	10	48728	48737	20 %	80 %	0 %	0 %	400404776
80	NC_018418	TAAAT	2	10	49285	49294	60 %	40 %	0 %	0 %	400404777
81	NC_018418	AATAT	2	10	49325	49334	60 %	40 %	0 %	0 %	400404777
82	NC_018418	ATTAT	2	10	49397	49406	40 %	60 %	0 %	0 %	400404777
83	NC_018418	AATTA	2	10	49468	49477	60 %	40 %	0 %	0 %	400404777
84	NC_018418	AAATT	2	10	49545	49554	60 %	40 %	0 %	0 %	400404777
85	NC_018418	AATTA	2	10	49573	49582	60 %	40 %	0 %	0 %	400404777
86	NC_018418	AAATT	2	10	49813	49822	60 %	40 %	0 %	0 %	400404778
87	NC_018418	AAGAA	2	10	49876	49885	80 %	0 %	20 %	0 %	400404778
88	NC_018418	AAATT	2	10	50279	50288	60 %	40 %	0 %	0 %	400404778
89	NC_018418	TAATT	2	10	50358	50367	40 %	60 %	0 %	0 %	400404778
90	NC_018418	ATTAT	2	10	52379	52388	40 %	60 %	0 %	0 %	400404782
91	NC_018418	TAAAA	2	10	52389	52398	80 %	20 %	0 %	0 %	400404782
92	NC_018418	TAAAA	2	10	52626	52635	80 %	20 %	0 %	0 %	400404782
93	NC_018418	ATTTA	2	10	52742	52751	40 %	60 %	0 %	0 %	400404782
94	NC_018418	ATTTT	2	10	53466	53475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018418	ATTTA	2	10	53936	53945	40 %	60 %	0 %	0 %	400404783
96	NC_018418	TAGAA	2	10	53988	53997	60 %	20 %	20 %	0 %	400404783
97	NC_018418	TTCCT	2	10	54003	54012	0 %	60 %	0 %	40 %	400404783
98	NC_018418	TATAA	2	10	54086	54095	60 %	40 %	0 %	0 %	400404783
99	NC_018418	TAATT	2	10	54355	54364	40 %	60 %	0 %	0 %	400404784
100	NC_018418	TAAAA	2	10	56633	56642	80 %	20 %	0 %	0 %	400404786
101	NC_018418	ATTAA	2	10	56980	56989	60 %	40 %	0 %	0 %	400404787
102	NC_018418	ATTTT	2	10	56996	57005	20 %	80 %	0 %	0 %	400404787
103	NC_018418	TATTT	2	10	57129	57138	20 %	80 %	0 %	0 %	400404787
104	NC_018418	ATTTT	2	10	58824	58833	20 %	80 %	0 %	0 %	400404790
105	NC_018418	AATTT	2	10	59643	59652	40 %	60 %	0 %	0 %	400404790
106	NC_018418	TTTTC	2	10	59723	59732	0 %	80 %	0 %	20 %	400404790
107	NC_018418	ATTTT	2	10	59980	59989	20 %	80 %	0 %	0 %	400404790
108	NC_018418	TATTT	2	10	60442	60451	20 %	80 %	0 %	0 %	400404790
109	NC_018418	ATTTT	2	10	60541	60550	20 %	80 %	0 %	0 %	400404790
110	NC_018418	ATTCA	2	10	60691	60700	40 %	40 %	0 %	20 %	400404790
111	NC_018418	TTTTA	2	10	61067	61076	20 %	80 %	0 %	0 %	400404790
112	NC_018418	TGAAA	2	10	61129	61138	60 %	20 %	20 %	0 %	400404790
113	NC_018418	AAATA	2	10	61207	61216	80 %	20 %	0 %	0 %	400404790
114	NC_018418	ATTTT	2	10	61959	61968	20 %	80 %	0 %	0 %	400404791
115	NC_018418	ATTCT	2	10	62643	62652	20 %	60 %	0 %	20 %	400404791
116	NC_018418	TAAAA	2	10	63058	63067	80 %	20 %	0 %	0 %	400404791
117	NC_018418	ATAAA	2	10	63322	63331	80 %	20 %	0 %	0 %	400404792
118	NC_018418	TTTTA	2	10	63674	63683	20 %	80 %	0 %	0 %	400404793
119	NC_018418	ACAAA	2	10	63871	63880	80 %	0 %	0 %	20 %	400404793
120	NC_018418	TTTAT	2	10	64119	64128	20 %	80 %	0 %	0 %	400404793
121	NC_018418	AAAAT	2	10	64555	64564	80 %	20 %	0 %	0 %	400404794
122	NC_018418	TAATA	2	10	65051	65060	60 %	40 %	0 %	0 %	400404794
123	NC_018418	AATTA	2	10	65122	65131	60 %	40 %	0 %	0 %	400404794
124	NC_018418	TTTTA	2	10	67843	67852	20 %	80 %	0 %	0 %	400404797
125	NC_018418	TAATT	2	10	69332	69341	40 %	60 %	0 %	0 %	400404798
126	NC_018418	AAAAT	2	10	69535	69544	80 %	20 %	0 %	0 %	400404798
127	NC_018418	TAAAT	2	10	69551	69560	60 %	40 %	0 %	0 %	400404798
128	NC_018418	ATTTT	2	10	70373	70382	20 %	80 %	0 %	0 %	400404799
129	NC_018418	ATTTC	2	10	71242	71251	20 %	60 %	0 %	20 %	400404800
130	NC_018418	AAAAT	2	10	71659	71668	80 %	20 %	0 %	0 %	400404800
131	NC_018418	TGAAA	2	10	71902	71911	60 %	20 %	20 %	0 %	400404800
132	NC_018418	ATTAA	2	10	74554	74563	60 %	40 %	0 %	0 %	400404801
133	NC_018418	AAAGA	2	10	74967	74976	80 %	0 %	20 %	0 %	400404802
134	NC_018418	TTTAT	2	10	77292	77301	20 %	80 %	0 %	0 %	400404804
135	NC_018418	TTAAT	2	10	77851	77860	40 %	60 %	0 %	0 %	400404805
136	NC_018418	AAATT	2	10	79207	79216	60 %	40 %	0 %	0 %	400404806
137	NC_018418	TAATT	2	10	79386	79395	40 %	60 %	0 %	0 %	400404806
138	NC_018418	TAAAA	2	10	80023	80032	80 %	20 %	0 %	0 %	400404807
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.