MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV chromosome

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018418	ATTTA	2	10	13955	13964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018418	AAATT	2	10	13976	13985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018418	TTTAT	2	10	24724	24733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018418	TTTTA	2	10	30365	30374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018418	AAAAT	2	10	30452	30461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018418	TTTAA	2	10	30462	30471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018418	TTTTA	2	10	48355	48364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018418	ATTTT	2	10	53466	53475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018418	ATTTT	2	10	84013	84022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018418	TAAAA	2	10	84194	84203	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018418	CTCTA	2	10	93721	93730	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018418	TATTT	2	10	93765	93774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018418	CCATT	2	10	106424	106433	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018418	TACTT	2	10	107205	107214	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018418	TAGAA	2	10	107498	107507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018418	ATTTT	2	10	108081	108090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018418	ATAAG	2	10	109230	109239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018418	TTTAT	2	10	111700	111709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.