MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV chromosome

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018418	ATT	2	6	9069	9074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018418	TAA	4	12	13919	13930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018418	TAG	2	6	13935	13940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018418	ACA	2	6	14003	14008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018418	TAT	2	6	24564	24569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018418	TAA	2	6	24612	24617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018418	ATT	2	6	24638	24643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018418	TAT	2	6	24718	24723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018418	TAA	4	12	29085	29096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018418	TAA	2	6	30532	30537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018418	CGG	2	6	35654	35659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018418	TAA	2	6	37543	37548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018418	TAT	2	6	37630	37635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018418	TAT	2	6	37674	37679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018418	ATT	2	6	37698	37703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018418	AGT	2	6	37867	37872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018418	ATC	2	6	37900	37905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018418	TTA	2	6	41919	41924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018418	ATA	2	6	48340	48345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018418	TAA	2	6	48385	48390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018418	ATT	2	6	48417	48422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018418	ATA	2	6	53276	53281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018418	TAA	2	6	53457	53462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018418	GGT	2	6	53560	53565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018418	TAT	2	6	53831	53836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018418	ATA	3	9	54719	54727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018418	GTA	2	6	61526	61531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018418	GTT	2	6	65723	65728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018418	TTA	2	6	81317	81322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018418	ATA	2	6	83896	83901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018418	ATT	2	6	83921	83926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018418	AAG	2	6	84058	84063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018418	TAA	2	6	84131	84136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018418	ATT	2	6	84152	84157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018418	TAA	2	6	84172	84177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018418	AAT	2	6	84184	84189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018418	TAT	2	6	84274	84279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018418	CAG	2	6	93683	93688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018418	ATA	2	6	93834	93839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018418	TAA	2	6	97448	97453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018418	ATT	2	6	105813	105818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018418	TAA	2	6	105905	105910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018418	TAT	2	6	105919	105924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018418	CTT	2	6	106074	106079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018418	TAT	2	6	106085	106090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018418	AAC	2	6	106140	106145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018418	ACG	2	6	106243	106248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018418	TGA	2	6	106323	106328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018418	CTC	2	6	106557	106562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018418	AGG	2	6	106574	106579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018418	CAC	2	6	106602	106607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018418	ATT	2	6	106643	106648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018418	CAT	2	6	106855	106860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018418	GCC	2	6	106930	106935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018418	TTA	2	6	106950	106955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018418	TAA	2	6	107065	107070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018418	TCT	2	6	107137	107142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018418	TTA	2	6	107286	107291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018418	TAT	2	6	107302	107307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018418	ATC	2	6	107491	107496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018418	ATT	2	6	107588	107593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018418	TTC	2	6	107603	107608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018418	GCT	2	6	107737	107742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018418	GTT	2	6	107827	107832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018418	TAA	2	6	107876	107881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018418	AAT	2	6	107882	107887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018418	AAT	2	6	107944	107949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018418	ATC	2	6	108035	108040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018418	TCC	2	6	108070	108075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018418	ATT	2	6	108471	108476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018418	ACT	2	6	108536	108541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018418	TAG	2	6	108653	108658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018418	TAA	2	6	108679	108684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018418	TAA	3	9	108900	108908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018418	ATT	2	6	108913	108918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018418	AAT	2	6	109057	109062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018418	TAT	2	6	109107	109112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018418	ATG	2	6	109150	109155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018418	CGT	2	6	109162	109167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018418	TCC	2	6	109176	109181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018418	TTA	2	6	109202	109207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018418	GAC	2	6	109287	109292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018418	GCA	2	6	109299	109304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018418	ATT	2	6	109524	109529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018418	ATA	2	6	109533	109538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018418	TTC	2	6	109665	109670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018418	TCT	2	6	109713	109718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018418	TAT	2	6	109739	109744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018418	ATT	2	6	109749	109754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018418	ATT	2	6	109759	109764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018418	TAA	2	6	109765	109770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018418	AAT	2	6	109816	109821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018418	GCT	2	6	109856	109861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018418	CTT	2	6	109881	109886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018418	CTT	2	6	109931	109936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018418	CTT	2	6	109969	109974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018418	CTG	2	6	110028	110033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018418	GTT	2	6	110074	110079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018418	AAC	2	6	110129	110134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018418	TAA	2	6	110198	110203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018418	TAT	2	6	110229	110234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018418	GCT	2	6	110274	110279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018418	AAT	2	6	110280	110285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018418	TTC	2	6	110407	110412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018418	TAA	2	6	111680	111685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018418	ATT	2	6	111763	111768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018418	CTA	2	6	111779	111784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018418	ATA	3	9	116792	116800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018418	TAT	2	6	147178	147183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018418	ATA	2	6	147286	147291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018418	GAA	2	6	147319	147324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018418	GCA	2	6	147352	147357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018418	TCT	2	6	147394	147399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018418	ATT	2	6	147426	147431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018418	AAT	2	6	147435	147440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.