MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV chromosome

Total Repeats: 2801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018418	ATT	2	6	141	146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
2	NC_018418	ATA	3	9	239	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
3	NC_018418	ATT	2	6	250	255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
4	NC_018418	TAA	2	6	482	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
5	NC_018418	TAA	2	6	578	583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
6	NC_018418	ATT	2	6	601	606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
7	NC_018418	ATT	2	6	614	619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
8	NC_018418	TAT	2	6	741	746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
9	NC_018418	CAG	2	6	794	799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404724
10	NC_018418	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
11	NC_018418	TAA	2	6	945	950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
12	NC_018418	TAA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
13	NC_018418	TAA	2	6	1037	1042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
14	NC_018418	TTC	2	6	1050	1055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404724
15	NC_018418	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404724
16	NC_018418	TAA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
17	NC_018418	TTA	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404724
18	NC_018418	TAA	2	6	1164	1169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
19	NC_018418	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404724
20	NC_018418	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
21	NC_018418	AGC	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404725
22	NC_018418	TAA	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
23	NC_018418	ATT	2	6	1410	1415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
24	NC_018418	GGA	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400404725
25	NC_018418	TAG	2	6	1538	1543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404725
26	NC_018418	ATT	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
27	NC_018418	TAT	2	6	1661	1666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
28	NC_018418	ATT	2	6	1683	1688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
29	NC_018418	AAT	2	6	1691	1696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
30	NC_018418	TAA	2	6	1724	1729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
31	NC_018418	ATT	3	9	1755	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
32	NC_018418	TTA	2	6	1780	1785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
33	NC_018418	ATT	2	6	1918	1923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
34	NC_018418	AAT	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
35	NC_018418	TTA	2	6	2011	2016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
36	NC_018418	ATA	2	6	2026	2031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
37	NC_018418	TAA	2	6	2036	2041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
38	NC_018418	ATA	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
39	NC_018418	ATC	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404725
40	NC_018418	TAA	2	6	2254	2259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
41	NC_018418	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
42	NC_018418	AAC	2	6	2402	2407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404725
43	NC_018418	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404725
44	NC_018418	GCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404725
45	NC_018418	GTT	2	6	2436	2441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400404725
46	NC_018418	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
47	NC_018418	ATT	2	6	2591	2596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
48	NC_018418	ATA	2	6	2608	2613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
49	NC_018418	TAA	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
50	NC_018418	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
51	NC_018418	ATT	2	6	2674	2679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
52	NC_018418	TAA	2	6	2713	2718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
53	NC_018418	ATA	2	6	2763	2768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404725
54	NC_018418	ATT	2	6	2769	2774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404725
55	NC_018418	TAA	2	6	2855	2860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
56	NC_018418	TAT	3	9	2861	2869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
57	NC_018418	TAA	2	6	2904	2909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
58	NC_018418	TAT	3	9	2918	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
59	NC_018418	AAT	2	6	2938	2943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
60	NC_018418	TTA	2	6	2945	2950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
61	NC_018418	ATT	2	6	3003	3008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
62	NC_018418	TAA	3	9	3056	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
63	NC_018418	ATT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
64	NC_018418	AAT	2	6	3147	3152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
65	NC_018418	TAT	2	6	3249	3254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
66	NC_018418	ATA	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404726
67	NC_018418	TTA	2	6	3362	3367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
68	NC_018418	ATT	2	6	3401	3406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404726
69	NC_018418	AAT	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404727
70	NC_018418	ATC	3	9	3503	3511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404727
71	NC_018418	AAT	2	6	3512	3517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404727
72	NC_018418	AGG	2	6	3563	3568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400404727
73	NC_018418	TAT	2	6	3613	3618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404727
74	NC_018418	ATT	2	6	3644	3649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404727
75	NC_018418	TTG	2	6	3749	3754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400404728
76	NC_018418	TAA	2	6	3827	3832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404728
77	NC_018418	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404728
78	NC_018418	ATA	2	6	3878	3883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404728
79	NC_018418	TAA	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404728
80	NC_018418	TTA	2	6	3967	3972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404728
81	NC_018418	TTA	2	6	3986	3991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404728
82	NC_018418	TAA	3	9	4047	4055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404728
83	NC_018418	AAT	2	6	4131	4136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404728
84	NC_018418	TAA	2	6	4143	4148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404728
85	NC_018418	TAT	2	6	4155	4160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404728
86	NC_018418	TTA	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404729
87	NC_018418	AAT	2	6	4288	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404729
88	NC_018418	TAA	3	9	4297	4305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404729
89	NC_018418	AAT	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
90	NC_018418	AGT	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404730
91	NC_018418	TAA	2	6	4403	4408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
92	NC_018418	TAA	2	6	4440	4445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
93	NC_018418	ATT	2	6	4489	4494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404730
94	NC_018418	TAA	2	6	4509	4514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
95	NC_018418	AAC	2	6	4574	4579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404730
96	NC_018418	GAA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404730
97	NC_018418	TAC	2	6	4622	4627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404730
98	NC_018418	TCT	2	6	4651	4656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404730
99	NC_018418	TCT	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404730
100	NC_018418	TAA	2	6	4886	4891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
101	NC_018418	TAA	2	6	4899	4904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
102	NC_018418	ATT	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404730
103	NC_018418	GCA	2	6	4966	4971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404730
104	NC_018418	ATG	2	6	5051	5056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400404730
105	NC_018418	AAG	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404730
106	NC_018418	ACC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400404730
107	NC_018418	ATC	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400404730
108	NC_018418	ATT	2	6	5190	5195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404730
109	NC_018418	TAA	2	6	5199	5204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
110	NC_018418	CTT	2	6	5276	5281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404730
111	NC_018418	CAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400404730
112	NC_018418	AGG	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400404730
113	NC_018418	AGC	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400404730
114	NC_018418	TTC	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404730
115	NC_018418	TAA	2	6	5525	5530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
116	NC_018418	ATT	2	6	5604	5609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404730
117	NC_018418	AAT	2	6	5610	5615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
118	NC_018418	ATT	2	6	5681	5686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404730
119	NC_018418	ATA	2	6	5770	5775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404730
120	NC_018418	TAT	2	6	5781	5786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404730
121	NC_018418	ATT	2	6	5913	5918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404731
122	NC_018418	TAA	2	6	5969	5974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404731
123	NC_018418	TAA	2	6	5989	5994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404731
124	NC_018418	AAT	2	6	6024	6029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404731
125	NC_018418	ATA	2	6	6064	6069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404731
126	NC_018418	ATT	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404731
127	NC_018418	ATT	2	6	6182	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404731
128	NC_018418	ATT	2	6	6249	6254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404731
129	NC_018418	ATA	2	6	6259	6264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404731
130	NC_018418	ATA	2	6	6312	6317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404731
131	NC_018418	CTG	3	9	6433	6441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400404731
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391	NC_018418	ATA	2	6	20382	20387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404746
392	NC_018418	TAT	2	6	20392	20397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404746
393	NC_018418	TTA	2	6	20443	20448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404746
394	NC_018418	TTA	2	6	20464	20469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404746
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