MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV chromosome

Total Repeats: 426

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018418	AT	3	6	74	79	50 %	50 %	0 %	0 %	400404724
2	NC_018418	TA	3	6	160	165	50 %	50 %	0 %	0 %	400404724
3	NC_018418	AT	3	6	914	919	50 %	50 %	0 %	0 %	400404724
4	NC_018418	AT	3	6	1744	1749	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
5	NC_018418	AT	4	8	1794	1801	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
6	NC_018418	TA	3	6	2074	2079	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
7	NC_018418	AT	4	8	2202	2209	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
8	NC_018418	AT	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
9	NC_018418	AT	3	6	2792	2797	50 %	50 %	0 %	0 %	400404725
10	NC_018418	AT	3	6	2849	2854	50 %	50 %	0 %	0 %	400404726
11	NC_018418	TA	3	6	3268	3273	50 %	50 %	0 %	0 %	400404726
12	NC_018418	AT	3	6	3356	3361	50 %	50 %	0 %	0 %	400404726
13	NC_018418	TA	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	400404729
14	NC_018418	AT	3	6	4977	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	400404730
15	NC_018418	AT	3	6	5945	5950	50 %	50 %	0 %	0 %	400404731
16	NC_018418	TA	3	6	6286	6291	50 %	50 %	0 %	0 %	400404731
17	NC_018418	TA	5	10	6614	6623	50 %	50 %	0 %	0 %	400404732
18	NC_018418	AT	3	6	7151	7156	50 %	50 %	0 %	0 %	400404732
19	NC_018418	TA	3	6	7423	7428	50 %	50 %	0 %	0 %	400404732
20	NC_018418	TA	3	6	8047	8052	50 %	50 %	0 %	0 %	400404733
21	NC_018418	AT	3	6	8133	8138	50 %	50 %	0 %	0 %	400404734
22	NC_018418	TA	3	6	8543	8548	50 %	50 %	0 %	0 %	400404734
23	NC_018418	TA	3	6	8727	8732	50 %	50 %	0 %	0 %	400404734
24	NC_018418	AT	4	8	9202	9209	50 %	50 %	0 %	0 %	400404735
25	NC_018418	AT	3	6	9213	9218	50 %	50 %	0 %	0 %	400404735
26	NC_018418	AT	3	6	9495	9500	50 %	50 %	0 %	0 %	400404735
27	NC_018418	TA	3	6	9502	9507	50 %	50 %	0 %	0 %	400404735
28	NC_018418	AT	3	6	9705	9710	50 %	50 %	0 %	0 %	400404736
29	NC_018418	TA	5	10	10016	10025	50 %	50 %	0 %	0 %	400404736
30	NC_018418	TA	3	6	10275	10280	50 %	50 %	0 %	0 %	400404736
31	NC_018418	AT	4	8	10383	10390	50 %	50 %	0 %	0 %	400404736
32	NC_018418	AT	3	6	10397	10402	50 %	50 %	0 %	0 %	400404736
33	NC_018418	TA	3	6	11405	11410	50 %	50 %	0 %	0 %	400404736
34	NC_018418	AT	3	6	11471	11476	50 %	50 %	0 %	0 %	400404737
35	NC_018418	AT	3	6	12297	12302	50 %	50 %	0 %	0 %	400404737
36	NC_018418	AT	3	6	12777	12782	50 %	50 %	0 %	0 %	400404737
37	NC_018418	TA	3	6	12892	12897	50 %	50 %	0 %	0 %	400404737
38	NC_018418	AT	3	6	13902	13907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018418	TA	3	6	14359	14364	50 %	50 %	0 %	0 %	400404740
40	NC_018418	AT	3	6	14588	14593	50 %	50 %	0 %	0 %	400404740
41	NC_018418	AT	3	6	14736	14741	50 %	50 %	0 %	0 %	400404740
42	NC_018418	AT	3	6	14952	14957	50 %	50 %	0 %	0 %	400404740
43	NC_018418	AT	3	6	15276	15281	50 %	50 %	0 %	0 %	400404741
44	NC_018418	AT	3	6	15307	15312	50 %	50 %	0 %	0 %	400404741
45	NC_018418	AT	3	6	15569	15574	50 %	50 %	0 %	0 %	400404741
46	NC_018418	AT	3	6	16138	16143	50 %	50 %	0 %	0 %	400404742
47	NC_018418	TA	3	6	16358	16363	50 %	50 %	0 %	0 %	400404742
48	NC_018418	TA	3	6	16667	16672	50 %	50 %	0 %	0 %	400404742
49	NC_018418	TA	3	6	16859	16864	50 %	50 %	0 %	0 %	400404743
50	NC_018418	AT	3	6	17529	17534	50 %	50 %	0 %	0 %	400404744
51	NC_018418	TA	3	6	18016	18021	50 %	50 %	0 %	0 %	400404744
52	NC_018418	TA	3	6	18260	18265	50 %	50 %	0 %	0 %	400404745
53	NC_018418	AT	3	6	18691	18696	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
54	NC_018418	TA	4	8	19645	19652	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
55	NC_018418	AT	3	6	19957	19962	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
56	NC_018418	TA	3	6	19974	19979	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
57	NC_018418	AT	3	6	20371	20376	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
58	NC_018418	AT	3	6	21090	21095	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
59	NC_018418	TA	4	8	21184	21191	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
60	NC_018418	TA	3	6	21203	21208	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
61	NC_018418	AT	3	6	21331	21336	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
62	NC_018418	TA	3	6	21636	21641	50 %	50 %	0 %	0 %	400404746
63	NC_018418	TA	3	6	22018	22023	50 %	50 %	0 %	0 %	400404747
64	NC_018418	AT	3	6	22270	22275	50 %	50 %	0 %	0 %	400404747
65	NC_018418	TA	3	6	22612	22617	50 %	50 %	0 %	0 %	400404748
66	NC_018418	TA	3	6	22967	22972	50 %	50 %	0 %	0 %	400404748
67	NC_018418	TA	4	8	23481	23488	50 %	50 %	0 %	0 %	400404748
68	NC_018418	AT	3	6	23673	23678	50 %	50 %	0 %	0 %	400404748
69	NC_018418	TA	3	6	23680	23685	50 %	50 %	0 %	0 %	400404748
70	NC_018418	AT	3	6	23904	23909	50 %	50 %	0 %	0 %	400404748
71	NC_018418	TA	3	6	25112	25117	50 %	50 %	0 %	0 %	400404750
72	NC_018418	TA	3	6	25476	25481	50 %	50 %	0 %	0 %	400404751
73	NC_018418	TA	3	6	25546	25551	50 %	50 %	0 %	0 %	400404751
74	NC_018418	AT	3	6	25806	25811	50 %	50 %	0 %	0 %	400404751
75	NC_018418	TA	3	6	25918	25923	50 %	50 %	0 %	0 %	400404751
76	NC_018418	TA	3	6	26775	26780	50 %	50 %	0 %	0 %	400404752
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78	NC_018418	AT	4	8	28041	28048	50 %	50 %	0 %	0 %	400404753
79	NC_018418	TA	3	6	28142	28147	50 %	50 %	0 %	0 %	400404753
80	NC_018418	AT	3	6	28578	28583	50 %	50 %	0 %	0 %	400404753
81	NC_018418	AT	3	6	28880	28885	50 %	50 %	0 %	0 %	400404753
82	NC_018418	TA	3	6	29557	29562	50 %	50 %	0 %	0 %	400404754
83	NC_018418	AT	3	6	29621	29626	50 %	50 %	0 %	0 %	400404754
84	NC_018418	TA	3	6	29986	29991	50 %	50 %	0 %	0 %	400404754
85	NC_018418	AT	3	6	32203	32208	50 %	50 %	0 %	0 %	400404756
86	NC_018418	AT	3	6	32542	32547	50 %	50 %	0 %	0 %	400404756
87	NC_018418	TA	3	6	32555	32560	50 %	50 %	0 %	0 %	400404756
88	NC_018418	AT	3	6	33454	33459	50 %	50 %	0 %	0 %	400404758
89	NC_018418	AT	3	6	34984	34989	50 %	50 %	0 %	0 %	400404759
90	NC_018418	TA	3	6	35187	35192	50 %	50 %	0 %	0 %	400404759
91	NC_018418	AT	3	6	35310	35315	50 %	50 %	0 %	0 %	400404759
92	NC_018418	TA	3	6	36596	36601	50 %	50 %	0 %	0 %	400404762
93	NC_018418	AT	3	6	37325	37330	50 %	50 %	0 %	0 %	400404762
94	NC_018418	AT	3	6	37343	37348	50 %	50 %	0 %	0 %	400404762
95	NC_018418	AT	3	6	37447	37452	50 %	50 %	0 %	0 %	400404762
96	NC_018418	TA	3	6	37933	37938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018418	AT	3	6	38221	38226	50 %	50 %	0 %	0 %	400404763
98	NC_018418	TA	3	6	38494	38499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018418	AT	3	6	38500	38505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018418	TA	3	6	39395	39400	50 %	50 %	0 %	0 %	400404765
101	NC_018418	AT	3	6	39411	39416	50 %	50 %	0 %	0 %	400404765
102	NC_018418	AT	3	6	40707	40712	50 %	50 %	0 %	0 %	400404766
103	NC_018418	AT	3	6	40784	40789	50 %	50 %	0 %	0 %	400404766
104	NC_018418	AT	3	6	40937	40942	50 %	50 %	0 %	0 %	400404766
105	NC_018418	TA	3	6	41766	41771	50 %	50 %	0 %	0 %	400404767
106	NC_018418	AT	3	6	41865	41870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018418	TA	3	6	42146	42151	50 %	50 %	0 %	0 %	400404768
108	NC_018418	TA	4	8	42208	42215	50 %	50 %	0 %	0 %	400404768
109	NC_018418	AT	3	6	42388	42393	50 %	50 %	0 %	0 %	400404769
110	NC_018418	TA	3	6	42818	42823	50 %	50 %	0 %	0 %	400404770
111	NC_018418	TA	3	6	42953	42958	50 %	50 %	0 %	0 %	400404770
112	NC_018418	AT	3	6	43045	43050	50 %	50 %	0 %	0 %	400404770
113	NC_018418	AT	4	8	43152	43159	50 %	50 %	0 %	0 %	400404770
114	NC_018418	AT	3	6	44191	44196	50 %	50 %	0 %	0 %	400404772
115	NC_018418	TA	3	6	44314	44319	50 %	50 %	0 %	0 %	400404772
116	NC_018418	AT	3	6	45085	45090	50 %	50 %	0 %	0 %	400404772
117	NC_018418	AT	3	6	45345	45350	50 %	50 %	0 %	0 %	400404773
118	NC_018418	AT	3	6	45367	45372	50 %	50 %	0 %	0 %	400404773
119	NC_018418	AT	4	8	45395	45402	50 %	50 %	0 %	0 %	400404773
120	NC_018418	TA	3	6	45903	45908	50 %	50 %	0 %	0 %	400404773
121	NC_018418	AT	5	10	45934	45943	50 %	50 %	0 %	0 %	400404773
122	NC_018418	AT	3	6	46103	46108	50 %	50 %	0 %	0 %	400404773
123	NC_018418	AT	3	6	46392	46397	50 %	50 %	0 %	0 %	400404773
124	NC_018418	AT	4	8	47409	47416	50 %	50 %	0 %	0 %	400404774
125	NC_018418	TA	3	6	48441	48446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018418	TA	3	6	49099	49104	50 %	50 %	0 %	0 %	400404776
127	NC_018418	AT	3	6	49202	49207	50 %	50 %	0 %	0 %	400404776
128	NC_018418	AT	3	6	49686	49691	50 %	50 %	0 %	0 %	400404778
129	NC_018418	TA	3	6	49734	49739	50 %	50 %	0 %	0 %	400404778
130	NC_018418	TA	3	6	51195	51200	50 %	50 %	0 %	0 %	400404779
131	NC_018418	AT	3	6	51287	51292	50 %	50 %	0 %	0 %	400404779
132	NC_018418	TA	4	8	51601	51608	50 %	50 %	0 %	0 %	400404781
133	NC_018418	AT	3	6	51835	51840	50 %	50 %	0 %	0 %	400404781
134	NC_018418	AT	3	6	51887	51892	50 %	50 %	0 %	0 %	400404781
135	NC_018418	AT	3	6	51963	51968	50 %	50 %	0 %	0 %	400404781
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140	NC_018418	TA	3	6	53347	53352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018418	AT	3	6	53499	53504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018418	AT	3	6	54625	54630	50 %	50 %	0 %	0 %	400404784
143	NC_018418	TA	3	6	54716	54721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018418	AT	3	6	55455	55460	50 %	50 %	0 %	0 %	400404785
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426	NC_018418	AT	3	6	159901	159906	50 %	50 %	0 %	0 %	400404905

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.