Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 235

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_018417ATTTAA21246847950 %50 %0 %0 %400404502
2NC_018417ATTTTA2121984199533.33 %66.67 %0 %0 %400404503
3NC_018417AAATAT2123084309566.67 %33.33 %0 %0 %400404504
4NC_018417AATTTT2123702371333.33 %66.67 %0 %0 %400404506
5NC_018417ATAAAA2126236624783.33 %16.67 %0 %0 %400404509
6NC_018417AATTAA2126345635666.67 %33.33 %0 %0 %400404509
7NC_018417TTGGAG2127007701816.67 %33.33 %50 %0 %400404510
8NC_018417ATATTT2127828783933.33 %66.67 %0 %0 %400404511
9NC_018417ATTTTT2127952796316.67 %83.33 %0 %0 %400404511
10NC_018417TAAAAA2128759877083.33 %16.67 %0 %0 %400404512
11NC_018417ATTTTT2129117912816.67 %83.33 %0 %0 %Non-Coding
12NC_018417AAATAA2129836984783.33 %16.67 %0 %0 %400404514
13NC_018417ATTAAA212103641037566.67 %33.33 %0 %0 %400404514
14NC_018417AAATTA212109471095866.67 %33.33 %0 %0 %400404514
15NC_018417CCTATA318111081112533.33 %33.33 %0 %33.33 %400404514
16NC_018417TAAAAA212122911230283.33 %16.67 %0 %0 %400404515
17NC_018417ATAATT212135341354550 %50 %0 %0 %400404516
18NC_018417AATTCC212143701438133.33 %33.33 %0 %33.33 %400404518
19NC_018417ATTTAA212147901480150 %50 %0 %0 %400404518
20NC_018417AAATTA212148881489966.67 %33.33 %0 %0 %400404518
21NC_018417ATTTTT212153591537016.67 %83.33 %0 %0 %400404519
22NC_018417ATATTA212162991631050 %50 %0 %0 %400404520
23NC_018417TAAATT212166441665550 %50 %0 %0 %400404521
24NC_018417AATTTA212172761728750 %50 %0 %0 %400404522
25NC_018417TAATTT212183231833433.33 %66.67 %0 %0 %400404523
26NC_018417AGATTT318186831870033.33 %50 %16.67 %0 %400404523
27NC_018417TTAGAT212198301984133.33 %50 %16.67 %0 %400404523
28NC_018417AATTGA212205342054550 %33.33 %16.67 %0 %400404523
29NC_018417AAATTA212208052081666.67 %33.33 %0 %0 %400404523
30NC_018417ATATTA212210212103250 %50 %0 %0 %400404524
31NC_018417AAAATA212221682217983.33 %16.67 %0 %0 %400404525
32NC_018417TAAATA212227292274066.67 %33.33 %0 %0 %400404525
33NC_018417TAAATT212231912320250 %50 %0 %0 %400404525
34NC_018417TAGATT212237962380733.33 %50 %16.67 %0 %400404527
35NC_018417TAAAAA212238892390083.33 %16.67 %0 %0 %400404527
36NC_018417AATAGG212264582646950 %16.67 %33.33 %0 %400404529
37NC_018417TAAAAA212270402705183.33 %16.67 %0 %0 %400404530
38NC_018417ATTATA212275532756450 %50 %0 %0 %400404531
39NC_018417TATTAG212294922950333.33 %50 %16.67 %0 %400404532
40NC_018417TTAAAT212308303084150 %50 %0 %0 %400404534
41NC_018417TAATTT212321503216133.33 %66.67 %0 %0 %400404535
42NC_018417TTATTT212338933390416.67 %83.33 %0 %0 %400404538
43NC_018417AAATAA212350743508583.33 %16.67 %0 %0 %400404539
44NC_018417TTTTTG21235236352470 %83.33 %16.67 %0 %400404539
45NC_018417TTATTT212355073551816.67 %83.33 %0 %0 %Non-Coding
46NC_018417ATTTTT212357183572916.67 %83.33 %0 %0 %Non-Coding
47NC_018417TAAAAT212357823579366.67 %33.33 %0 %0 %400404540
48NC_018417AATTTA212361623617350 %50 %0 %0 %400404540
49NC_018417TTAAAT212369023691350 %50 %0 %0 %400404541
50NC_018417ATAATT212373323734350 %50 %0 %0 %400404542
51NC_018417TTCTAA212386683867933.33 %50 %0 %16.67 %400404543
52NC_018417TTTTAT212394693948016.67 %83.33 %0 %0 %400404544
53NC_018417TAATTA212405124052350 %50 %0 %0 %400404546
54NC_018417ATAAAA212409734098483.33 %16.67 %0 %0 %400404547
55NC_018417TATTAA212410174102850 %50 %0 %0 %400404547
56NC_018417TAAAAA212412534126483.33 %16.67 %0 %0 %400404547
57NC_018417ATTTAA212415074151850 %50 %0 %0 %400404548
58NC_018417ATTTAT212416324164333.33 %66.67 %0 %0 %400404548
59NC_018417ATTTTA212427564276733.33 %66.67 %0 %0 %400404549
60NC_018417TTTATA212432294324033.33 %66.67 %0 %0 %400404549
61NC_018417AATAAA212436404365183.33 %16.67 %0 %0 %400404550
62NC_018417ATTTTT212450334504416.67 %83.33 %0 %0 %400404551
63NC_018417TCCCTT21245427454380 %50 %0 %50 %400404551
64NC_018417TAAAAA212491484915983.33 %16.67 %0 %0 %400404556
65NC_018417ATTAAA212501395015066.67 %33.33 %0 %0 %400404559
66NC_018417TTATTT212505435055416.67 %83.33 %0 %0 %400404559
67NC_018417AGAAAA212508735088483.33 %0 %16.67 %0 %400404559
68NC_018417TTAATT212517475175833.33 %66.67 %0 %0 %400404560
69NC_018417AAATTT212524045241550 %50 %0 %0 %400404561
70NC_018417AGCTGT212541445415516.67 %33.33 %33.33 %16.67 %400404563
71NC_018417AGAAAT212545615457266.67 %16.67 %16.67 %0 %400404563
72NC_018417ATTTTT212548925490316.67 %83.33 %0 %0 %400404564
73NC_018417TTTTAT212550945510516.67 %83.33 %0 %0 %400404564
74NC_018417TATTAA212559465595750 %50 %0 %0 %400404565
75NC_018417CATTTT212571175712816.67 %66.67 %0 %16.67 %400404567
76NC_018417GAATTA212571765718750 %33.33 %16.67 %0 %400404567
77NC_018417ATAAAA318601046012183.33 %16.67 %0 %0 %400404568
78NC_018417AAATTG212606266063750 %33.33 %16.67 %0 %400404568
79NC_018417ATTTTT212607626077316.67 %83.33 %0 %0 %400404568
80NC_018417TATAAA212610356104666.67 %33.33 %0 %0 %400404568
81NC_018417ATTTTA212614266143733.33 %66.67 %0 %0 %400404570
82NC_018417AAATTT318631066312350 %50 %0 %0 %400404571
83NC_018417TTTATT212631906320116.67 %83.33 %0 %0 %400404571
84NC_018417TGATAA212648286483950 %33.33 %16.67 %0 %400404573
85NC_018417TATTTT212652126522316.67 %83.33 %0 %0 %400404573
86NC_018417AAATAA212652826529383.33 %16.67 %0 %0 %400404574
87NC_018417ATTTTA212657556576633.33 %66.67 %0 %0 %400404574
88NC_018417ATTTAA212659146592550 %50 %0 %0 %400404574
89NC_018417ATAAAA212659586596983.33 %16.67 %0 %0 %400404574
90NC_018417ATTTTA212664686647933.33 %66.67 %0 %0 %400404575
91NC_018417AATAAA212666716668283.33 %16.67 %0 %0 %400404575
92NC_018417ATAAAA212670616707283.33 %16.67 %0 %0 %400404575
93NC_018417TAAAAA212670836709483.33 %16.67 %0 %0 %400404575
94NC_018417ATTTAA212673116732250 %50 %0 %0 %400404575
95NC_018417TTTATT212673846739516.67 %83.33 %0 %0 %400404575
96NC_018417TAAATT212702247023550 %50 %0 %0 %400404577
97NC_018417TTTAAT212716597167033.33 %66.67 %0 %0 %400404578
98NC_018417ATTCAT212719477195833.33 %50 %0 %16.67 %400404578
99NC_018417TCAACT212719747198533.33 %33.33 %0 %33.33 %400404578
100NC_018417ATTTTA212720677207833.33 %66.67 %0 %0 %400404578
101NC_018417TATAAT212723857239650 %50 %0 %0 %400404578
102NC_018417TAAAAA212733757338683.33 %16.67 %0 %0 %400404579
103NC_018417AAATAA212739167392783.33 %16.67 %0 %0 %400404580
104NC_018417CAAGTT212770427705333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %400404583
105NC_018417TTAAAT212773747738550 %50 %0 %0 %400404583
106NC_018417TAATTT212776607767133.33 %66.67 %0 %0 %400404584
107NC_018417TATTTA212787037871433.33 %66.67 %0 %0 %400404585
108NC_018417TAATTT212790547906533.33 %66.67 %0 %0 %Non-Coding
109NC_018417TAAAAT212792447925566.67 %33.33 %0 %0 %400404586
110NC_018417TTTTAT212803168032716.67 %83.33 %0 %0 %400404588
111NC_018417TTTAAA212807538076450 %50 %0 %0 %400404588
112NC_018417TAAAAT212818508186166.67 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
113NC_018417TAAAAA212828008281183.33 %16.67 %0 %0 %400404592
114NC_018417TTAAAA212828268283766.67 %33.33 %0 %0 %400404592
115NC_018417TAAAAA212828638287483.33 %16.67 %0 %0 %400404592
116NC_018417ATTAAA212839878399866.67 %33.33 %0 %0 %400404594
117NC_018417CTATAC212852178522833.33 %33.33 %0 %33.33 %400404595
118NC_018417CAAATA212858548586566.67 %16.67 %0 %16.67 %400404596
119NC_018417TAAATT318862458626250 %50 %0 %0 %400404596
120NC_018417ATAAAA212864378644883.33 %16.67 %0 %0 %400404596
121NC_018417TATATT212866078661833.33 %66.67 %0 %0 %400404597
122NC_018417TAAAAA212877748778583.33 %16.67 %0 %0 %400404598
123NC_018417TAAAAA212882868829783.33 %16.67 %0 %0 %400404600
124NC_018417TATTAA212885418855250 %50 %0 %0 %400404600
125NC_018417TTTAAA212889258893650 %50 %0 %0 %400404600
126NC_018417TAAATC212892348924550 %33.33 %0 %16.67 %400404600
127NC_018417TAAAAA212897508976183.33 %16.67 %0 %0 %400404600
128NC_018417TAAAAT318910489106566.67 %33.33 %0 %0 %400404602
129NC_018417TCAATA212916119162250 %33.33 %0 %16.67 %400404602
130NC_018417ATTCAT212919369194733.33 %50 %0 %16.67 %400404602
131NC_018417AAAATT318923439236066.67 %33.33 %0 %0 %400404603
132NC_018417ATAAAA212933719338283.33 %16.67 %0 %0 %400404604
133NC_018417TTTATT212950099502016.67 %83.33 %0 %0 %400404606
134NC_018417AAATTA212963619637266.67 %33.33 %0 %0 %400404607
135NC_018417TAATAT212964189642950 %50 %0 %0 %400404607
136NC_018417AATTTA212965809659150 %50 %0 %0 %400404607
137NC_018417TAAAAA212967879679883.33 %16.67 %0 %0 %Non-Coding
138NC_018417TAAAAA212973989740983.33 %16.67 %0 %0 %400404608
139NC_018417TTTTAA212975039751433.33 %66.67 %0 %0 %400404608
140NC_018417TAAAAT212979719798266.67 %33.33 %0 %0 %400404608
141NC_018417CTTTTT21298181981920 %83.33 %0 %16.67 %400404608
142NC_018417ATATTT212996369964733.33 %66.67 %0 %0 %400404610
143NC_018417ATTTTT21210026510027616.67 %83.33 %0 %0 %400404610
144NC_018417TTTTAT21210062610063716.67 %83.33 %0 %0 %400404611
145NC_018417ATAAAA21210092310093483.33 %16.67 %0 %0 %400404611
146NC_018417AATTAT21210105910107050 %50 %0 %0 %400404611
147NC_018417ATTTAA21210193910195050 %50 %0 %0 %400404612
148NC_018417TAAAAT21210198510199666.67 %33.33 %0 %0 %400404612
149NC_018417TTATAA21210313610314750 %50 %0 %0 %400404612
150NC_018417AAAAGA21210328810329983.33 %0 %16.67 %0 %400404613
151NC_018417TAATAT21210340810341950 %50 %0 %0 %400404613
152NC_018417CTCCAG21210516510517616.67 %16.67 %16.67 %50 %Non-Coding
153NC_018417ATTTTT21210757310758416.67 %83.33 %0 %0 %Non-Coding
154NC_018417CTAATA21210903210904350 %33.33 %0 %16.67 %Non-Coding
155NC_018417TTTTAT21210984310985416.67 %83.33 %0 %0 %400404615
156NC_018417ATTTTT21211035811036916.67 %83.33 %0 %0 %400404617
157NC_018417ATTTAA21211075211076350 %50 %0 %0 %400404618
158NC_018417ATTAGA31811155111156850 %33.33 %16.67 %0 %400404619
159NC_018417ATTTAT21211257511258633.33 %66.67 %0 %0 %400404620
160NC_018417ATTTTT21211512111513216.67 %83.33 %0 %0 %400404622
161NC_018417TAGAAA21211609511610666.67 %16.67 %16.67 %0 %400404626
162NC_018417CAGTTT21211628111629216.67 %50 %16.67 %16.67 %400404626
163NC_018417TTGTGC2121167501167610 %50 %33.33 %16.67 %400404626
164NC_018417TATAAA21211684311685466.67 %33.33 %0 %0 %400404627
165NC_018417TAAAAT21211709111710266.67 %33.33 %0 %0 %400404627
166NC_018417AAATCC21211766811767950 %16.67 %0 %33.33 %400404628
167NC_018417TAAAAT21211771511772666.67 %33.33 %0 %0 %400404628
168NC_018417TAAAAT31811829711831466.67 %33.33 %0 %0 %400404628
169NC_018417AATTTA21212036212037350 %50 %0 %0 %400404630
170NC_018417ATTATC21212059112060233.33 %50 %0 %16.67 %400404630
171NC_018417AAACTT21212067912069050 %33.33 %0 %16.67 %400404630
172NC_018417ATTTTT21212113112114216.67 %83.33 %0 %0 %400404630
173NC_018417AATTTT21212157312158433.33 %66.67 %0 %0 %400404630
174NC_018417ATTTAT21212274012275133.33 %66.67 %0 %0 %400404632
175NC_018417ATTACC21212315112316233.33 %33.33 %0 %33.33 %400404632
176NC_018417ATTTTA21212382912384033.33 %66.67 %0 %0 %400404635
177NC_018417TCTATA21212434512435633.33 %50 %0 %16.67 %400404636
178NC_018417ATTTTT21212436312437416.67 %83.33 %0 %0 %400404636
179NC_018417ATAATT21212477912479050 %50 %0 %0 %400404636
180NC_018417ATTAAA21212496712497866.67 %33.33 %0 %0 %400404637
181NC_018417TTAAAA21212504312505466.67 %33.33 %0 %0 %400404637
182NC_018417TTTGTT2121259041259150 %83.33 %16.67 %0 %400404639
183NC_018417TTGTTT2121262231262340 %83.33 %16.67 %0 %400404640
184NC_018417TTTATT21212652112653216.67 %83.33 %0 %0 %400404641
185NC_018417TTGAAG21212689112690233.33 %33.33 %33.33 %0 %400404642
186NC_018417TAAATA21212762112763266.67 %33.33 %0 %0 %400404644
187NC_018417ATAAAC21212797012798166.67 %16.67 %0 %16.67 %400404645
188NC_018417TTTGAT21212891412892516.67 %66.67 %16.67 %0 %400404648
189NC_018417AATTAA21212926212927366.67 %33.33 %0 %0 %400404649
190NC_018417TTCCTT2121295621295730 %66.67 %0 %33.33 %400404650
191NC_018417TTTTCC2121305191305300 %66.67 %0 %33.33 %400404652
192NC_018417TAAAAA21213187113188283.33 %16.67 %0 %0 %400404655
193NC_018417GCTCTA21213198313199416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %400404655
194NC_018417TCCTTT2121324251324360 %66.67 %0 %33.33 %400404656
195NC_018417TTAAAT21213263313264450 %50 %0 %0 %400404657
196NC_018417ATTATA21213409513410650 %50 %0 %0 %400404659
197NC_018417TAATTT21213470313471433.33 %66.67 %0 %0 %400404659
198NC_018417AATATT21213559813560950 %50 %0 %0 %400404659
199NC_018417CAGTTT21213574113575216.67 %50 %16.67 %16.67 %400404659
200NC_018417CAGAAG21213590613591750 %0 %33.33 %16.67 %400404659
201NC_018417TCTTGT2121359351359460 %66.67 %16.67 %16.67 %400404659
202NC_018417GTAGTT21213602813603916.67 %50 %33.33 %0 %400404659
203NC_018417TAATTT21213795113796233.33 %66.67 %0 %0 %400404662
204NC_018417TTAAAA21213806813807966.67 %33.33 %0 %0 %400404662
205NC_018417AAAACT21213816213817366.67 %16.67 %0 %16.67 %400404662
206NC_018417ATTTTT21213883113884216.67 %83.33 %0 %0 %400404662
207NC_018417AATTTT21213892113893233.33 %66.67 %0 %0 %400404662
208NC_018417TATAAT21213930113931250 %50 %0 %0 %400404662
209NC_018417AATATT21214130914132050 %50 %0 %0 %400404663
210NC_018417ATATTA21214153214154350 %50 %0 %0 %400404663
211NC_018417AAAAAG21214303914305083.33 %0 %16.67 %0 %400404663
212NC_018417CAAAAA21214402014403183.33 %0 %0 %16.67 %400404663
213NC_018417AAAATA21214505714506883.33 %16.67 %0 %0 %400404665
214NC_018417TAAAAA21214570314571483.33 %16.67 %0 %0 %400404666
215NC_018417ATTTAT21214578714579833.33 %66.67 %0 %0 %400404666
216NC_018417TTTATT21214655614656716.67 %83.33 %0 %0 %Non-Coding
217NC_018417TTATAT21214705014706133.33 %66.67 %0 %0 %400404669
218NC_018417TTAAAT21214711614712750 %50 %0 %0 %400404669
219NC_018417AAATAA21214743614744783.33 %16.67 %0 %0 %400404670
220NC_018417TAAATT21214758014759150 %50 %0 %0 %400404670
221NC_018417ATTAAT21214763514764650 %50 %0 %0 %400404670
222NC_018417TTATAT21214778314779433.33 %66.67 %0 %0 %400404670
223NC_018417AAAATT21214837214838366.67 %33.33 %0 %0 %400404670
224NC_018417CAACCC21214859314860433.33 %0 %0 %66.67 %400404670
225NC_018417ATAATT21214905714906850 %50 %0 %0 %400404670
226NC_018417TAAATT21215019315020450 %50 %0 %0 %400404672
227NC_018417AAAAAT21215021615022783.33 %16.67 %0 %0 %400404672
228NC_018417GGAATT21215158115159233.33 %33.33 %33.33 %0 %400404674
229NC_018417AATTAA21215308415309566.67 %33.33 %0 %0 %400404675
230NC_018417AAAATA21215325615326783.33 %16.67 %0 %0 %400404675
231NC_018417TTTAAA21215356915358050 %50 %0 %0 %400404676
232NC_018417AATAAA21215426515427683.33 %16.67 %0 %0 %400404676
233NC_018417TAAAAT21215459015460166.67 %33.33 %0 %0 %400404677
234NC_018417TAAAAA21215476615477783.33 %16.67 %0 %0 %400404677
235NC_018417TTTATT21215679315680416.67 %83.33 %0 %0 %Non-Coding