MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018417	ATATT	2	10	8949	8958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018417	ATTTT	2	10	28366	28375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018417	TAAAA	2	10	35533	35542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018417	AAGTA	2	10	39657	39666	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018417	TTAAT	2	10	39671	39680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018417	TAGTT	2	10	46467	46476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018417	TAATT	2	10	51164	51173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018417	TTTGC	2	10	51183	51192	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018417	AAAAT	2	10	51243	51252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018417	AAATA	2	10	53000	53009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018417	ATTAT	2	10	96653	96662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018417	AATAT	2	10	107607	107616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018417	ATAAG	2	10	108029	108038	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018417	ATTAT	2	10	115724	115733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018417	AATTT	2	10	119481	119490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018417	AAAAT	2	10	119702	119711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018417	ATCTA	2	10	119753	119762	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018417	ATTTT	2	10	119796	119805	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018417	TAATT	2	10	157193	157202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.