MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018417	TAAA	2	8	8961	8968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018417	TTAT	2	8	8982	8989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018417	TTAT	2	8	9057	9064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018417	ATCT	2	8	14129	14136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018417	ATAA	2	8	23489	23496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018417	TTAA	2	8	26778	26785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018417	ATTA	2	8	28355	28362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018417	ATTT	2	8	28470	28477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018417	TCGT	2	8	33624	33631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018417	TAGG	2	8	33635	33642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018417	ATTC	2	8	35454	35461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018417	ATGA	2	8	35669	35676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018417	TAAA	2	8	36281	36288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018417	AATT	2	8	39801	39808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018417	ATAA	2	8	39841	39848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018417	AATA	2	8	39868	39875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018417	TTAA	2	8	39957	39964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018417	ATAA	2	8	40672	40679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018417	GATT	2	8	51992	51999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018417	TAAT	2	8	54864	54871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018417	TTTA	2	8	63576	63583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018417	TTTA	2	8	67587	67594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018417	ATTT	2	8	67692	67699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018417	ATTG	2	8	67779	67786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018417	TTAT	2	8	96749	96756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018417	ATTT	2	8	104915	104922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018417	GTAC	2	8	106086	106093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018417	ATTT	2	8	106440	106447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018417	CTTT	2	8	106581	106588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018417	TTTA	2	8	106809	106816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018417	ATAG	2	8	106964	106971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018417	CCTA	2	8	107033	107040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018417	TCGC	2	8	107380	107387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018417	TAAA	2	8	107459	107466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018417	CATT	2	8	107559	107566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018417	AATT	2	8	108577	108584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018417	TTTA	2	8	109217	109224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018417	TTTA	2	8	119837	119844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018417	CTTT	2	8	157035	157042	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018417	ATTT	2	8	157077	157084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018417	TAAA	2	8	157153	157160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018417	ATTT	2	8	157341	157348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.