MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018417	TA	3	6	389	394	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
2	NC_018417	AT	4	8	509	516	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
3	NC_018417	TA	3	6	887	892	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
4	NC_018417	AT	4	8	941	948	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
5	NC_018417	AT	3	6	1181	1186	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
6	NC_018417	TA	4	8	1251	1258	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
7	NC_018417	AT	3	6	1272	1277	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
8	NC_018417	TA	3	6	1624	1629	50 %	50 %	0 %	0 %	400404503
9	NC_018417	AT	3	6	2076	2081	50 %	50 %	0 %	0 %	400404503
10	NC_018417	TA	3	6	2511	2516	50 %	50 %	0 %	0 %	400404503
11	NC_018417	TA	3	6	2629	2634	50 %	50 %	0 %	0 %	400404503
12	NC_018417	AT	3	6	2789	2794	50 %	50 %	0 %	0 %	400404503
13	NC_018417	TA	3	6	2906	2911	50 %	50 %	0 %	0 %	400404504
14	NC_018417	AT	3	6	2913	2918	50 %	50 %	0 %	0 %	400404504
15	NC_018417	AT	3	6	3207	3212	50 %	50 %	0 %	0 %	400404504
16	NC_018417	AT	3	6	3290	3295	50 %	50 %	0 %	0 %	400404504
17	NC_018417	TA	3	6	3429	3434	50 %	50 %	0 %	0 %	400404504
18	NC_018417	TA	4	8	3666	3673	50 %	50 %	0 %	0 %	400404505
19	NC_018417	AT	3	6	4231	4236	50 %	50 %	0 %	0 %	400404507
20	NC_018417	AT	3	6	4275	4280	50 %	50 %	0 %	0 %	400404507
21	NC_018417	AT	3	6	4934	4939	50 %	50 %	0 %	0 %	400404508
22	NC_018417	TA	3	6	5003	5008	50 %	50 %	0 %	0 %	400404508
23	NC_018417	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	400404509
24	NC_018417	TA	3	6	6296	6301	50 %	50 %	0 %	0 %	400404509
25	NC_018417	AT	3	6	6556	6561	50 %	50 %	0 %	0 %	400404510
26	NC_018417	TA	4	8	6569	6576	50 %	50 %	0 %	0 %	400404510
27	NC_018417	AT	3	6	7090	7095	50 %	50 %	0 %	0 %	400404510
28	NC_018417	TA	4	8	7206	7213	50 %	50 %	0 %	0 %	400404510
29	NC_018417	AT	3	6	7515	7520	50 %	50 %	0 %	0 %	400404510
30	NC_018417	AT	3	6	7725	7730	50 %	50 %	0 %	0 %	400404510
31	NC_018417	TA	3	6	7996	8001	50 %	50 %	0 %	0 %	400404511
32	NC_018417	AT	3	6	8438	8443	50 %	50 %	0 %	0 %	400404512
33	NC_018417	AT	3	6	9036	9041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018417	TA	3	6	9144	9149	50 %	50 %	0 %	0 %	400404513
35	NC_018417	TA	3	6	9262	9267	50 %	50 %	0 %	0 %	400404513
36	NC_018417	TC	3	6	9511	9516	0 %	50 %	0 %	50 %	400404513
37	NC_018417	AT	3	6	9799	9804	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
38	NC_018417	AT	3	6	10032	10037	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
39	NC_018417	CT	3	6	10315	10320	0 %	50 %	0 %	50 %	400404514
40	NC_018417	TA	3	6	10333	10338	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
41	NC_018417	TA	3	6	10440	10445	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
42	NC_018417	AT	4	8	10455	10462	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
43	NC_018417	AT	3	6	10515	10520	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
44	NC_018417	AT	3	6	10542	10547	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
45	NC_018417	TA	3	6	10657	10662	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
46	NC_018417	TA	4	8	10671	10678	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
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50	NC_018417	TA	3	6	11688	11693	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
51	NC_018417	AT	3	6	11875	11880	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
52	NC_018417	AT	3	6	11964	11969	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
53	NC_018417	AT	3	6	12152	12157	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
54	NC_018417	AT	3	6	12340	12345	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
55	NC_018417	TA	3	6	13233	13238	50 %	50 %	0 %	0 %	400404516
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58	NC_018417	TA	3	6	14038	14043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018417	TA	3	6	14181	14186	50 %	50 %	0 %	0 %	400404518
60	NC_018417	TA	4	8	14328	14335	50 %	50 %	0 %	0 %	400404518
61	NC_018417	AT	4	8	14489	14496	50 %	50 %	0 %	0 %	400404518
62	NC_018417	TA	3	6	14538	14543	50 %	50 %	0 %	0 %	400404518
63	NC_018417	AT	4	8	14591	14598	50 %	50 %	0 %	0 %	400404518
64	NC_018417	TA	3	6	15205	15210	50 %	50 %	0 %	0 %	400404519
65	NC_018417	AT	3	6	15290	15295	50 %	50 %	0 %	0 %	400404519
66	NC_018417	TA	3	6	15662	15667	50 %	50 %	0 %	0 %	400404519
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68	NC_018417	AT	3	6	16363	16368	50 %	50 %	0 %	0 %	400404520
69	NC_018417	AT	3	6	16730	16735	50 %	50 %	0 %	0 %	400404521
70	NC_018417	AT	3	6	17145	17150	50 %	50 %	0 %	0 %	400404522
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72	NC_018417	TA	3	6	17511	17516	50 %	50 %	0 %	0 %	400404522
73	NC_018417	AT	3	6	17647	17652	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
74	NC_018417	AT	3	6	17826	17831	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
75	NC_018417	TA	3	6	18042	18047	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
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79	NC_018417	TA	3	6	19553	19558	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
80	NC_018417	AT	3	6	19920	19925	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
81	NC_018417	AT	3	6	20141	20146	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
82	NC_018417	AT	3	6	20208	20213	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
83	NC_018417	AT	3	6	20287	20292	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
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90	NC_018417	TA	4	8	22418	22425	50 %	50 %	0 %	0 %	400404525
91	NC_018417	AT	4	8	22552	22559	50 %	50 %	0 %	0 %	400404525
92	NC_018417	AT	3	6	22933	22938	50 %	50 %	0 %	0 %	400404525
93	NC_018417	AT	3	6	23074	23079	50 %	50 %	0 %	0 %	400404525
94	NC_018417	TA	3	6	23213	23218	50 %	50 %	0 %	0 %	400404525
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104	NC_018417	TA	3	6	26177	26182	50 %	50 %	0 %	0 %	400404529
105	NC_018417	AT	5	10	26350	26359	50 %	50 %	0 %	0 %	400404529
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108	NC_018417	AT	3	6	27225	27230	50 %	50 %	0 %	0 %	400404531
109	NC_018417	AT	3	6	27653	27658	50 %	50 %	0 %	0 %	400404531
110	NC_018417	AT	4	8	27902	27909	50 %	50 %	0 %	0 %	400404531
111	NC_018417	TA	3	6	28891	28896	50 %	50 %	0 %	0 %	400404532
112	NC_018417	AT	3	6	29833	29838	50 %	50 %	0 %	0 %	400404532
113	NC_018417	TA	3	6	30138	30143	50 %	50 %	0 %	0 %	400404533
114	NC_018417	TA	3	6	30290	30295	50 %	50 %	0 %	0 %	400404533
115	NC_018417	TA	3	6	30324	30329	50 %	50 %	0 %	0 %	400404533
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120	NC_018417	TA	3	6	31313	31318	50 %	50 %	0 %	0 %	400404534
121	NC_018417	AT	4	8	31824	31831	50 %	50 %	0 %	0 %	400404535
122	NC_018417	TA	3	6	32210	32215	50 %	50 %	0 %	0 %	400404535
123	NC_018417	TA	3	6	32280	32285	50 %	50 %	0 %	0 %	400404535
124	NC_018417	AT	3	6	32999	33004	50 %	50 %	0 %	0 %	400404536
125	NC_018417	AT	3	6	33132	33137	50 %	50 %	0 %	0 %	400404536
126	NC_018417	AT	3	6	33178	33183	50 %	50 %	0 %	0 %	400404536
127	NC_018417	TA	3	6	34478	34483	50 %	50 %	0 %	0 %	400404539
128	NC_018417	TA	3	6	34805	34810	50 %	50 %	0 %	0 %	400404539
129	NC_018417	AT	3	6	34844	34849	50 %	50 %	0 %	0 %	400404539
130	NC_018417	AT	3	6	34993	34998	50 %	50 %	0 %	0 %	400404539
131	NC_018417	AT	3	6	35424	35429	50 %	50 %	0 %	0 %	400404539
132	NC_018417	TA	3	6	35696	35701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018417	TA	3	6	35912	35917	50 %	50 %	0 %	0 %	400404540
134	NC_018417	AT	3	6	36372	36377	50 %	50 %	0 %	0 %	400404541
135	NC_018417	AC	3	6	36773	36778	50 %	0 %	0 %	50 %	400404541
136	NC_018417	AT	3	6	37047	37052	50 %	50 %	0 %	0 %	400404541
137	NC_018417	AT	3	6	37820	37825	50 %	50 %	0 %	0 %	400404542
138	NC_018417	AT	3	6	37994	37999	50 %	50 %	0 %	0 %	400404542
139	NC_018417	AT	3	6	38238	38243	50 %	50 %	0 %	0 %	400404543
140	NC_018417	AT	3	6	38259	38264	50 %	50 %	0 %	0 %	400404543
141	NC_018417	TA	3	6	38467	38472	50 %	50 %	0 %	0 %	400404543
142	NC_018417	TA	3	6	38487	38492	50 %	50 %	0 %	0 %	400404543
143	NC_018417	TA	3	6	38662	38667	50 %	50 %	0 %	0 %	400404543
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