MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018417	AT	3	6	9036	9041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018417	TA	3	6	14038	14043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018417	TA	3	6	35696	35701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018417	TA	3	6	39775	39780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018417	AT	3	6	39815	39820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018417	AT	3	6	39886	39891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018417	TA	3	6	39917	39922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018417	AT	5	10	40722	40731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018417	TA	4	8	46315	46322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018417	AT	3	6	52121	52126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018417	TA	3	6	52127	52132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018417	TA	3	6	52983	52988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018417	AT	3	6	81622	81627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018417	AT	4	8	81833	81840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018417	TA	3	6	95709	95714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018417	AT	3	6	95718	95723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018417	AT	3	6	96661	96666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018417	AT	3	6	98261	98266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018417	TA	3	6	105491	105496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018417	TA	3	6	105967	105972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018417	TG	3	6	106723	106728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018417	TA	3	6	107089	107094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018417	TA	3	6	107124	107129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018417	TA	3	6	107591	107596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018417	AT	4	8	107623	107630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018417	GT	3	6	107752	107757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018417	GT	3	6	107924	107929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018417	AT	3	6	108013	108018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018417	AT	3	6	108302	108307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018417	CA	3	6	108774	108779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018417	TA	3	6	109021	109026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018417	TA	3	6	109054	109059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018417	AT	3	6	119506	119511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018417	AT	3	6	119588	119593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018417	AT	3	6	146365	146370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018417	AT	3	6	146542	146547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018417	AT	3	6	146584	146589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018417	TA	7	14	156715	156728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018417	TA	3	6	156898	156903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018417	TC	3	6	156915	156920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018417	TA	3	6	156946	156951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.