MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018417	T	7	7	8974	8980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018417	T	6	6	9050	9055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018417	T	8	8	9124	9131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018417	A	8	8	13959	13966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018417	A	6	6	13980	13985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018417	A	7	7	14023	14029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018417	A	8	8	14143	14150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018417	T	11	11	21348	21358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018417	T	6	6	23438	23443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018417	T	11	11	23450	23460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018417	T	16	16	23520	23535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018417	A	8	8	26806	26813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018417	A	6	6	28338	28343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018417	T	6	6	28347	28352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018417	T	7	7	28378	28384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018417	A	10	10	28387	28396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018417	T	6	6	28484	28489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018417	T	7	7	28499	28505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018417	T	10	10	28539	28548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018417	A	6	6	28566	28571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018417	T	7	7	33606	33612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018417	A	7	7	33613	33619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018417	A	7	7	33662	33668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018417	A	14	14	35519	35532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018417	A	10	10	35705	35714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018417	T	6	6	36196	36201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018417	T	6	6	36232	36237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018417	A	6	6	36268	36273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018417	A	7	7	36286	36292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018417	A	7	7	36344	36350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018417	A	7	7	36359	36365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018417	T	6	6	39651	39656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018417	A	6	6	39692	39697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018417	T	6	6	39717	39722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018417	A	6	6	39847	39852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018417	T	6	6	39901	39906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018417	A	6	6	39932	39937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018417	A	9	9	40642	40650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018417	T	9	9	40654	40662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018417	A	6	6	40689	40694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018417	A	8	8	40699	40706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018417	T	7	7	46277	46283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018417	T	7	7	46285	46291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018417	T	6	6	46329	46334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018417	A	14	14	46367	46380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018417	A	10	10	46535	46544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018417	T	7	7	51236	51242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018417	A	8	8	51256	51263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018417	A	6	6	52073	52078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018417	T	7	7	52107	52113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018417	T	8	8	52133	52140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018417	T	9	9	52154	52162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018417	T	10	10	52180	52189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018417	A	9	9	53021	53029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018417	A	6	6	53031	53036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57	NC_018417	A	6	6	63591	63596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_018417	A	6	6	67731	67736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_018417	T	8	8	78631	78638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018417	A	8	8	78642	78649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018417	T	9	9	79080	79088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018417	A	6	6	79095	79100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68	NC_018417	A	6	6	81665	81670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018417	A	7	7	81722	81728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71	NC_018417	A	9	9	81738	81746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018417	T	6	6	81747	81752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018417	T	11	11	81793	81803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018417	A	8	8	81804	81811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018417	T	6	6	81827	81832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018417	T	6	6	81899	81904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018417	A	8	8	81909	81916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018417	T	6	6	81917	81922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018417	T	7	7	81979	81985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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81	NC_018417	T	7	7	93002	93008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_018417	A	6	6	146383	146388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_018417	T	6	6	156756	156761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.